基本分支如下：
被子植物 angiosperms :
木蘭分支 magnoliids
單子葉植物分支 monocots
鴨跖草分支 commelinids
真雙子葉植物分支 eudicots
核心真雙子葉植物分支 core eudicots
薔薇分支 rosids
I類真薔薇分支 eurosids I
II類真薔薇分支 eurosids II
菊分支 asterids
I類真菊分支 euasterids I
II類真菊分支 euasterids II
被子植物分支 angiosperms
無油樟科 Amborellaceae金粟蘭科 Chloranthaceae
睡蓮科 Nymphaeaceae + 蓴菜科 Cabombaceae
木蘭藤目 Austrobaileyales
木蘭藤科 Austrobaileyaceae
五味子科 Schisandraceae + 八角茴香科 Illiciaceae
腺齒木科 Trimeniaceae
木蘭分支 magnoliids
白桂皮目 Canellales 白桂皮科 Canellaceae 林仙科 Winteraceae 樟目 Laurales 香皮茶科 Atherospermataceae 臘梅科 Calycanthaceae 腺蕊花科 Gomortegaceae 蓮葉桐科 Hernandiaceae 樟科 Lauraceae 杯軸花科 Monimiaceae 壇罐花科 Siparunaceae 木蘭目 Magnoliales 番荔枝科 Annonaceae 單室木蘭科 Degeneriaceae 帽花木科 Eupomatiaceae 舌蕊花科 Himantandraceae 木蘭科 Magnoliaceae 肉豆蔻科 Myristicaceae 胡椒目 Piperales 馬兜鈴科 Aristolochiaceae 菌花科 Hydnoraceae 短蕊花科 Lactoridaceae 胡椒科 Piperaceae 三白草科 Saururaceae 單子葉植物分支 monocots 無葉蓮科 Petrosaviaceae 菖蒲目 Acorales 菖蒲科 Acoraceae 澤瀉目 Alismatales 澤瀉科 Alismataceae 水蕹科 Aponogetonaceae 天南星科 Araceae 花藺科 Butomaceae 絲粉藻科 Cymodoceaceae 水鱉科 Hydrocharitaceae 水麥冬科 Juncaginaceae 黃花絨葉草科 Limnocharitaceae 波喜盪草科 Posidoniaceae 眼子菜科 Potamogetonaceae 川蔓藻科 Ruppiaceae 芝菜科 Scheuchzeriaceae 岩菖蒲科 Tofieldiaceae 大葉藻科 Zosteraceae 天門冬目 Asparagales 蔥科Alliaceae + 百子蓮科Agapanthaceae + 石蒜科 Amaryllidaceae 天門冬科 Asparagaceae + 龍舌蘭科Agavaceae + 星捧月科Aphyllanthaceae + 西麗草科Hesperocallidaceae + 風信子科Hyacinthaceae + 異蕊草科Laxmanniaceae + 假葉樹科Ruscaceae + 紫燈花科Themidaceae 芳香草科 Asteliaceae 香水花科 Blandfordiaceae 澳韭蘭科 Boryaceae 矛花科 Doryanthaceae 仙茅科 Hypoxidaceae 鳶尾科 Iridaceae 鳶尾蒜科 Ixioliriaceae 毛石蒜科 Lanariaceae 蘭科 Orchidaceae 藍星科 Tecophilaeaceae 刺葉樹科Xanthorrhoeaceae + 獨尾草科Asphodelaceae + 萱草科Hemerocallidaceae 血劍草科 Xeronemataceae 薯蕷目 Dioscoreales 水玉簪科 Burmanniaceae 薯蕷科 Dioscoreaceae 納茜菜科 Nartheciaceae 百合目 Liliales 六出花科 Alstroemeriaceae 金梅草科 Campynemataceae 秋水仙科 Colchicaceae 白玉簪科 Corsiaceae 百合科 Liliaceae 菝葜木科 Luzuriagaceae 黑藥花科 Melanthiaceae 垂花科 Philesiaceae 菝葜藤科 Rhipogonaceae 菝葜科 Smilacaceae 露兜樹目 Pandanales 環花草科 Cyclanthaceae 露兜樹科 Pandanaceae 百部科 Stemonaceae 霉草科 Triuridaceae 翡若翠科 Velloziaceae 鴨跖草分支 commelinids 多須草科 Dasypogonaceae 檳榔目 Arecales 檳榔科 Arecaceae 鴨跖草目 Commelinales 鴨跖草科 Commelinaceae 血皮草科 Haemodoraceae 匍莖草科 Hanguanaceae 田蔥科 Philydraceae 雨久花科 Pontederiaceae 禾本目 Poales 苞穗草科 Anarthriaceae 鳳梨科 Bromeliaceae 刺鱗草科 Centrolepidaceae 莎草科 Cyperaceae 二柱草科 Ecdeiocoleaceae 谷精草科 Eriocaulaceae 須葉藤科 Flagellariaceae 獨蕊草科 Hydatellaceae 擬葦科 Joinvilleaceae 燈心草科 Juncaceae 苔草科 Mayacaceae 禾本科 Poaceae 偏穗草科 Rapateaceae 帚燈草科 Restionaceae 黑三棱科 Sparganiaceae 梭子草科 Thurniaceae 香蒲科 Typhaceae 黃眼草科 Xyridaceae 姜目 Zingiberales 美人蕉科 Cannaceae 閉鞘姜科 Costaceae 蠍尾蕉科 Heliconiaceae 蘭花蕉科 Lowiaceae 竹芋科 Marantaceae 芭蕉科 Musaceae 鶴望蘭科 Strelitziaceae 姜科 Zingiberaceae 金魚藻目 Ceratophyllales 金魚藻科 Ceratophyllaceae 真雙子葉植物分支 eudicots 黃楊科 Buxaceae + 雙頰果科 Didymelaceae 清風藤科 Sabiaceae 昆欄樹科Trochodendraceae + 水青樹科Tetracentraceae 山龍眼目 Proteales 蓮科 Nelumbonaceae 懸鈴木科 Platanaceae 山龍眼科 Proteaceae 毛茛目 Ranunculales 小檗科 Berberidaceae 星葉草科 Circaeasteraceae + 獨葉草科 Kingdoniaceae 領春木科 Eupteleaceae 木通科 Lardizabalaceae 防己科 Menispermaceae 罌粟科 Papaveraceae + 荷包牡丹科 Fumariaceae+ 蕨葉草科 Pteridophyllaceae 毛茛科 Ranunculaceae 核心真雙子葉植物分支 core eudicots 鱗枝樹科 Aextoxicaceae 智利藤科 Berberidopsidaceae 五椏果科 Dilleniaceae 洋二仙草目 Gunnerales 洋二仙草科 Gunneraceae + 香灌木科 Myrothamnaceae 石竹目 Caryophyllales 瑪瑙果科 Achatocarpaceae 番杏科 Aizoaceae 莧科 Amaranthaceae 鉤枝藤科 Ancistrocladaceae 翼萼茶科 Asteropeiaceae 節柄科 Barbeuiaceae 落葵科 Basellaceae 仙人掌科 Cactaceae 石竹科 Caryophyllaceae 龍樹科 Didiereaceae 雙鉤葉科 Dioncophyllaceae 茅膏菜科 Droseraceae 露葉毛氈苔科 Drosophyllaceae 瓣鱗花科 Frankeniaceae 吉粟草科 Gisekiaceae 浜藜葉科 Halophytaceae 粟米草科 Molluginaceae 豬籠草科 Nepenthaceae 紫茉莉科 Nyctaginaceae 非洲桐科 Physenaceae 商陸科 Phytolaccaceae 藍雪科 Plumbaginaceae 蓼科 Polygonaceae 馬齒莧科 Portulacaceae 棒木科 Rhabdodendraceae 肉葉刺莖藜科 Sarcobataceae 油蠟樹科 Simmondsiaceae 閉籽花科 Stegnospermataceae 檉柳科 Tamaricaceae 檀香目 Santalales 鐵青樹科 Olacaceae 山柚子科 Opiliaceae 桑寄生科 Loranthaceae 羽毛果科 Misodendraceae 檀香科 Santalaceae 虎耳草目 Saxifragales 楓香科 Altingiaceae 膠藤科 Aphanopetalaceae 連香樹科 Cercidiphyllaceae 景天科 Crassulaceae 交讓木科 Daphniphyllaceae 茶藨子科 Grossulariaceae 小二仙草科 Haloragaceae + 扯根菜科 Penthoraceae + 四果木科 Tetracarpaeaceae 金縷梅科 Hamamelidaceae 鼠刺科 Iteaceae + 齒蕊科 Pterostemonaceae 芍藥科 Paeoniaceae 虎耳草科 Saxifragaceae 薔薇分支 rosids 單果樹科 Aphloiaceae 四棱果科 Geissolomataceae 西蘭木科 Ixerbaceae 美洲苦木科 Picramniaceae 栓皮果科 Strasburgeriaceae 葡萄科 Vitaceae 燧體木目 Crossosomatales 燧體木科 Crossosomataceae 旌節花科 Stachyuraceae 省沽油科 Staphyleaceae 牻牛兒苗目 Geraniales 牻牛兒苗科 Geraniaceae + 高柱花科 Hypseocharitaceae 杜香果科 Ledocarpaceae 蜜花科 Melianthaceae + 花莖草科 Francoaceae 曲胚科 Vivianiaceae 桃金孃目 Myrtales 雙翼果科 Alzateaceae 使君子科 Combretaceae 隱翼科 Crypteroniaceae 異裂果科 Heteropyxidaceae 千屈菜科 Lythraceae 野牡丹科 Melastomataceae + 谷木科 Memecylaceae 桃金孃科 Myrtaceae 方枝樹科 Oliniaceae 柳葉菜科 Onagraceae 管萼科 Penaeaceae 裸木科 Psiloxylaceae 喙萼花科 Rhynchocalycaceae 蠟燭樹科 Vochysiaceae I類真薔薇分支 eurosids I 蒺藜科Zygophyllaceae +刺球果科Krameriaceae 蒜樹科 Huaceae 衛矛目 Celastrales 衛矛科 Celastraceae 洋酢漿草科 Lepidobotryaceae 梅花草科 Parnassiaceae + 微形草科Lepuropetalaceae 葫蘆目 Cucurbitales 四柱木科 Anisophylleaceae 秋海棠科 Begoniaceae 馬桑科 Coriariaceae 棒果木科 Corynocarpaceae 葫蘆科 Cucurbitaceae 野麻科 Datiscaceae 四數木科 Tetramelaceae 豆目 Fabales 豆科 Fabaceae 遠志科 Polygalaceae 皂皮樹科 Quillajaceae 海人樹科 Surianaceae 殼斗目 Fagales 樺木科 Betulaceae 木麻黃科 Casuarinaceae 山毛櫸科 Fagaceae 胡桃科 Juglandaceae 楊梅科 Myricaceae 南青岡科 Nothofagaceae 馬尾樹科 Rhoipteleaceae 太果木科 Ticodendraceae 金虎尾目 Malpighiales 鐘花科 Achariaceae 槲樹果科 Balanopaceae 多子科 Bonnetiaceae 油桃木科 Caryocaraceae 金殼果科 Chrysobalanaceae + 毒鼠子科 Dichapetalaceae + 大戟科 Euphorbiaceae +三角果科 Trigoniaceae 藤黃科 Clusiaceae 垂籽樹科 Ctenolophonaceae 溝繁縷科 Elatinaceae 毛藥樹科 Goupiaceae 香膏科 Humiriaceae 金絲桃科 Hypericaceae 包芽樹科 Irvingiaceae 粘木科 Ixonanthaceae 裂藥花科 Lacistemataceae 亞麻科 Linaceae 五翼果科 Lophopyxidaceae 金虎尾科 Malpighiaceae 金蓮木科 Ochnaceae + 水母柱科 Medusagynaceae + 羽葉樹科 Quiinaceae 小盤木科 Pandaceae 西番蓮科 Passifloraceae + 王冠草科 Malesherbiaceae + 時鐘花科 Turneraceae 圍盤樹科 Peridiscaceae 葉下珠科 Phyllanthaceae 苦胡桃科 Picrodendraceae 川苔草科 Podostemaceae 非洲核果木科 Putranjivaceae' 紅樹科 Rhizophoraceae + 古柯科 Erythroxylaceae 楊柳科 Salicaceae 堇菜科 Violaceae 酢漿草目 Oxalidales 瓣裂果科 Brunelliaceae 土瓶草科 Cephalotaceae 牛栓藤科 Connaraceae 火把樹科 Cunoniaceae 杜英科 Elaeocarpaceae 酢漿草科 Oxalidaceae 薔薇目 Rosales 鉤毛樹科 Barbeyaceae 大麻科 Cannabaceae 八瓣果科 Dirachmaceae 胡頹子科 Elaeagnaceae 桑科 Moraceae 鼠李科 Rhamnaceae 薔薇科 Rosaceae 榆科 Ulmaceae 蕁麻科 Urticaceae II類真薔薇分支 eurosids II 癭椒樹科 Tapisciaceae 十字花目 Brassicales 疊珠樹科 Akaniaceae + 鍾萼木科 Bretschneideraceae 藜木科 Bataceae 十字花科 Brassicaceae 番木瓜科 Caricaceae 澳遠志科 Emblingiaceae 環蕊科 Gyrostemonaceae 刺枝樹科 Koeberliniaceae 池花科 Limnanthaceae 辣木科 Moringaceae 瘤藥樹科 Pentadiplandraceae 木犀草科 Resedaceae 刺茉莉科 Salvadoraceae 夷白花菜科 Setchellanthaceae 烈味三葉草科 Tovariaceae 旱金蓮科 Tropaeolaceae 錦葵目 Malvales 紅木科 Bixaceae +地果蓮木科 Diegodendraceae + 彎子木科 Cochlospermaceae 半日花科 Cistaceae 龍腦香科 Dipterocarpaceae 錦葵科 Malvaceae 文定果科 Muntingiaceae 沙莓科 Neuradaceae 鏇花樹科 Sarcolaenaceae 球萼樹科 Sphaerosepalaceae 瑞香科 Thymelaeaceae 無患子目 Sapindales 漆樹科 Anacardiaceae 薰倒牛科 Biebersteiniaceae 橄欖科 Burseraceae 番苦木科 Kirkiaceae 楝科 Meliaceae 白刺科 Nitrariaceae + 駱駝蓬科 Peganaceae + 旱霸王科 Tetradiclidaceae 芸香科 Rutaceae 無患子科 Sapindaceae 苦木科 Simaroubaceae 菊分支 asterids 山茱萸目 Cornales 山茱萸科 Cornaceae + 珙桐科 Nyssaceae 南非茱萸科 Curtisiaceae 假石南科 Grubbiaceae 繡球花科 Hydrangeaceae 水穗草科 Hydrostachyaceae 刺蓮花科 Loasaceae 杜鵑花目 Ericales 獼猴桃科 Actinidiaceae 鳳仙花科 Balsaminaceae 山柳科 Clethraceae 翅萼樹科 Cyrillaceae 岩梅科 Diapensiaceae 柿樹科 Ebenaceae 杜鵑花科 Ericaceae 福桂花科 Fouquieriaceae 玉蕊科 Lecythidaceae 杜莖山科 Maesaceae 蜜囊花科 Marcgraviaceae 紫金牛科 Myrsinaceae 五列木科 Pentaphylacaceae + 厚皮香科 Ternstroemiaceae + 肋果茶科 Sladeniaceae 花荵科 Polemoniaceae 報春花科 Primulaceae 捕蠅幌科 Roridulaceae 山欖科 Sapotaceae 瓶子草科 Sarraceniaceae 野茉莉科 Styracaceae 山礬科 Symplocaceae 四籽樹科 Tetrameristaceae + 假紅樹科 Pellicieraceae 山茶科 Theaceae 假輪葉科 Theophrastaceae I類真菊分支 euasterids I 紫草科 Boraginaceae 茶茱萸科Icacinaceae 五蕊茶科Oncothecaceae 二歧草科 Vahliaceae 絞木目 Garryales 杜仲科 Eucommiaceae 絞木科 Garryaceae + 桃葉珊瑚科 Aucubaceae 龍膽目 Gentianales 夾竹桃科 Apocynaceae 胡蔓藤科 Gelsemiaceae 龍膽科 Gentianaceae 馬錢科 Loganiaceae 茜草科 Rubiaceae 唇形目 Lamiales 爵床科 Acanthaceae 紫葳科 Bignoniaceae 腺毛草科 Byblidaceae 蒲包花科 Calceolariaceae 香茜科 Carlemanniaceae 苦苣苔科 Gesneriaceae 唇形科 Lamiaceae 狸藻科 Lentibulariaceae 母草科 Linderniaceae 角胡麻科 Martyniaceae 木犀科 Oleaceae 列當科 Orobanchaceae 泡桐科 Paulowniaceae 胡麻科 Pedaliaceae 透骨草科 Phrymaceae 車前科 Plantaginaceae 環生籽科 Plocospermataceae 夷地黃科 Schlegeliaceae 玄參科 Scrophulariaceae 密穗草科 Stilbaceae 四粉草科 Tetrachondraceae 馬鞭草科 Verbenaceae 茄目 Solanales 鏇花科 Convolvulaceae 田基麻科 Hydroleaceae 山醋李科 Montiniaceae 茄科 Solanaceae 楔瓣花科 Sphenocleaceae II類真菊分支 euasterids II 鱗葉樹科 Bruniaceae 彎藥樹科Columelliaceae +離水花科Desfontainiaceae 寄奴花科Eremosynaceae 南鼠刺科Escalloniaceae 盔瓣花科Paracryphiaceae 多香木科Polyosmaceae 楔蕊花科Sphenostemonaceae 智利木科 Tribelaceae 傘形目 Apiales 傘形科 Apiaceae 五加科 Araliaceae 假茱萸科 Aralidiaceae 夷茱萸科 Griseliniaceae 參棕科 Mackinlayaceae 番茱萸科 Melanophyllaceae 裂果紅科 Myodocarpaceae 彭南特氏木科 Pennantiaceae 海桐花科 Pittosporaceae 鞘柄木科 Torricelliaceae 冬青目 Aquifoliales 冬青科 Aquifoliaceae 心翼果科 Cardiopteridaceae 青莢葉科 Helwingiaceae 葉茶藨科 Phyllonomaceae 金檀木科 Stemonuraceae 菊目 Asterales 假海桐科 Alseuosmiaceae 雪葉科 Argophyllaceae 菊科 Asteraceae 頭花草科 Calyceraceae 桔梗科 Campanulaceae + 半邊蓮科 Lobeliaceae 草海桐科 Goodeniaceae 睡菜科 Menyanthaceae 五膜草科 Pentaphragmataceae 石冬青科 Phellinaceae 盧梭木科 Rousseaceae 花柱草科 Stylidiaceae + 陀螺果科 Donatiaceae 川續斷目 Dipsacales 五福花科 Adoxaceae 忍冬科 Caprifoliaceae + 黃錦帶科 Diervillaceae + 川續斷科 Dipsacaceae + 北極花科 Linnaeaceae + 刺續斷科 Morinaceae + 敗醬科 Valerianaceae 注: "+ ..." 是一種建議選擇，可以合併也可以單獨分為一科。
尚無定論的屬和科
如果可以列為單屬科的屬，將科名也同時列出：Aneulophus Benth.
離花科 Apodanthaceae van Tieghem ex Takhtajan in Takhtajan （1997年）共三屬
美洲簇花草屬 Bdallophyton Eichl.
蛇菰科 Balanophoraceae Rich. （1822年）
Centroplacus Pierre
鎖陽屬 Cynomorium L. （鎖陽科 Cynomoriaceae Lindl. 1833年）
簇花草屬 Cytinus L. （簇花草科 Cytinaceae A.Rich. 1824年）
十齒花屬 Dipentodon Dunn （十齒花科 Dipentodontaceae Merr. (1941年)
Gumillea Ruiz & Pav.
單柱花屬 Hoplestigma Pierre （單柱花科 Hoplestigmataceae Engl. & Gilg 1924年）
Leptaulus Benth.
毛絲花屬 Medusandra Brenan （毛絲花科 Medusandraceae Brenan 1952年）
管花木屬 Metteniusa H.Karst. （管花木科 Metteniusaceae H.Karst. ex Schnizl. 1860年-1870年）
帽蕊草屬 Mitrastema Makino （帽蕊草科 Mitrastemonaceae Makino 1911年）
托葉假樟屬 Pottingeria Prain （托葉假樟科 Pottingeriaceae (Engl.) Takht. 1987年）
大花草科 Rafflesiaceae Dumort. （1829年）共三屬
非洲盤樹屬 Soyauxia Oliv.
Trichostephanus Gilg
