簡介
目前（2010年）公認的細菌分類體系是《伯吉氏中文系統細菌學
英文【醫】soilbactedology
細菌分類是在細菌的鑑別和分類中，對其細胞結構或是生理、生化特性進行觀察和測定並不太困難的，多利用下列方法：在各種培養基上的生長狀況；對碳水化合物和蛋白質的利用和分解情況；在DNA中的鳥嘌呤、胞嘧啶的克分子量的百分比；有時還根據血清學的試驗結果等。細菌的屬名和種名都是按命名規則而定的，但認為把全部細菌都按一個分類體系來定名不太合理的意見，愈來愈顯得有說服力。
細菌分類
（1）已往在套用上廣為依據的伯傑氏分類手冊第7版（1957年）中，在原生植物門中設定了包括裂殖菌綱、病毒和立克次氏體類的最小生物綱，並將裂殖菌綱分成10目：（i）假單胞菌目；（ii）鞘桿菌目；（iii）生絲微菌目；（iv）真桿菌目；（v）放線菌目；（vi）核衣細菌目；（vii）貝日阿托氏菌目；（viii）粘球菌目；（ix）螺鏇體目；（x）枝原體目。
（2）在該書第8版（1974年）中雖分作原核生物界的細菌門，但由於加強了該書的便覽性質，因而在其以下等級不再細分，只把全體分作19個部門，在各部門中，只在可能的情況下才把屬編成科和目。
（3）所謂細菌類，和其它的真核菌都是構成不同於植物界的另一個菌界（Mycota），從這樣的見解來看，作為原核菌類可放在亞界的位置上。然後，再像真核菌類的分類那樣，把原核菌類大致區分作枝原體類、細菌類、粘細菌類、螺鏇體類和放線菌類5個門。其詳細區分可套用伯傑氏分類法。在其中間不包括病毒類。
綜述
分類群 代表屬
嗜泉古生菌界 (Crenarchaeota)
1組熱變形菌、硫化葉菌和嗜壓菌
熱變形菌屬(Thermoproteus)、硫化葉菌屬(Sulfolobus)
廣古生菌界(Euryarchaeota)
2組產甲烷菌
甲烷桿菌屬(Methanobacterium)
3組鹽桿菌
鹽桿菌屬(Halobacterium)、鹽球菌屬(Halococcus)
4組熱原體
熱原體屬(Thermoplasma)等
5組熱球菌
古生球菌屬(Archaeoglobus)、熱球菌屬(Thermococcus)
最早分支的屬
細菌(真細菌)
6組產液菌和有關的細菌
產液菌屬(Aquifex)、氫桿菌屬(Hydrogenobacter)
7組熱袍菌和地袍菌
熱袍菌屬(Thermotoga)、地袍菌屬(Geotoga)、熱脫硫桿菌屬(Thermodesulfobacterium)
8組異常球菌
異常球菌屬(Deinococcus)
9組棲熱菌
棲熱菌屬(Thermus)、磁桿菌屬(Magnetobacterium)
10組產金色菌
產金色菌屬(Chrisiogenes)
11組綠屈撓菌和滑柱菌
綠屈撓菌屬(Chloroflexus)、滑柱菌屬(Herpetosiphon)
12組熱微菌
熱微菌屬(Thermomicrobium)
13組原綠藍細菌和藍細菌
原綠藍細菌屬(Prochloron)、聚球藍細菌屬(Synechococcus)、顫藍細菌屬(Oscillatoria)、魚腥藍細菌屬(Anabaena)、念珠藍細菌屬(Nostoc)、真枝藍細菌屬(Stigonema)等
14組綠菌
綠菌屬(Chlorobium)、暗網菌屬(Pelodictyon)
二、變形桿菌
細菌
變形桿菌界(Proteobacteria)
15組α變形桿菌
紅螺菌屬(Rhodospirillum)、立克次氏體屬(Rickettsia)、柄桿菌屬(Caulobacter)、根瘤菌屬(Rhizobium)、布魯氏菌屬(Brucella)、硝化桿菌屬(Nitrobacter)、甲基桿菌屬(Methylobacteriun)等
16組β變形桿菌
奈瑟氏菌屬(Neisseria)、產鹼桿菌屬(Alcaligenes)、亞硝化單胞菌屬(Nitrosomonas)、嗜甲基菌屬(Methylophilus)、硫桿菌屬(Thiobacillus)、伯克霍爾德氏菌屬(Burkholderia)等
17組γ變形桿菌
著色菌屬(Chromatium)、亮發菌屬(Leucothrix)、軍團菌屬(Legionella)、假單胞菌屬(Pseudomonas)、固氮菌屬(Azotobacter)、弧菌屬(Vibrio)、埃希氏菌屬(Escherichia)、克雷伯氏菌屬(Klebsiella)、變形桿菌屬(Proteus)、沙門氏菌屬(Salmonella)、志賀氏菌屬(Shigella)、伊爾森氏菌屬(Yersinia)、嗜血桿菌屬(Haemophilus)
18組δ變形桿菌
脫硫弧菌屬(Desulfovibrio)、蛭弧菌屬(Bodellovibiro)、粘球菌屬(Myxococcus)、多囊菌屬(Polyangium)
19組ε變形桿菌
彎曲桿菌屬(Campylobacter)、螺桿菌屬(Helicobacter)
三、低G+C含量的革蘭氏陽性細菌
20組梭菌和有關的細菌
梭菌屬(Clostridium)、消化鏈球菌屬(Peptostreptococcus)、真桿菌屬(Eubacterium)、脫硫腸狀菌屬(Desulfotomaculum)、韋榮氏菌屬(Veillonella)等
21組柔膜菌
枝原體屬(Mycoplasma)、尿原體屬(Ureaplasma)、螺原體屬(Spiroplasma)、無膽甾原體屬(Acholeplasma)
22組芽孢桿菌和乳桿菌
芽孢桿菌屬(Bacillus)、顯核菌屬(Caryophanon)、類芽孢桿菌屬(Paenibacillus)、高溫放線菌屬(Thermoactinomyces)、乳桿菌屬(Lactobacillus)、鏈球菌屬(Streptococcus)、腸球菌屬(Enterococcus)、葡萄球菌屬(Staphylococcus)、利斯特氏菌屬(Listeria)
四、高G+C含量的革蘭氏陽性細菌
23組放線桿菌綱(Actinobacteria)
放線菌屬(Actinomyces)、微球菌屬(Micrococcus)、節桿菌屬(Arthrobacter)、棒桿菌屬(Corynebacterium)、分枝桿菌屬(Mycobacterium)、諾卡氏菌屬(Nocardia)、遊動放線菌屬(Actinoplanes)、丙酸桿菌屬(Propionibacterium)鏈黴菌屬(Streptomyces)、高溫單孢菌屬(Thermomonospora)、弗蘭克氏菌屬(Frankia)、馬杜拉放線菌屬(Actinomadure)、雙歧桿菌屬(Bifidobacterium)
五、浮霉狀菌、螺鏇體、絲桿菌、擬桿菌和梭桿菌
24組浮霉狀菌、衣原體和有關的細菌
浮霉狀菌屬(Planctomyces)、衣原體屬(Chlamydia)
25組螺鏇體
螺鏇體屬(Spirochaeta)、疏螺鏇體屬(Borrelia)、密螺鏇體屬(Treponema)、小蛇菌屬(Serpulina)、鉤端螺鏇體屬(Leptospira)
26組絲狀桿菌
絲狀桿菌屬(Fibrobacter)
27組擬桿菌
擬桿菌屬(Bacteriodes)、卟啉單胞菌屬(Porphyromonas)、普雷沃氏菌屬(Prevotella)
28組黃桿菌
黃桿菌屬(Flavobacterium)
29組鞘氨醇桿菌、屈撓桿菌和噬纖維菌
鞘氨醇桿菌屬(Sphingobacterium)、屈撓桿菌屬(Flexibacter)、噬纖維菌屬(Cytophaga)
30組梭桿菌
梭桿菌屬(Fusobacterium)
微生物學辭彙
| 微生物學（microbiology）生物學的分支學科之一。它是在分子、細胞或群體水平上研究各類微小生物（細菌、放線菌、真菌、病毒、立克次氏體、支原體、衣原體、螺鏇體原生動物以及單細胞藻類）的形態結構、生長繁殖、生理代謝、遺傳變異、生態分布和分類進化等生命活動的基本規律，並將其套用於工業發酵、醫學衛生和生物工程等領域的科學。 |
