基本概述
染色體步查:在克隆基因組基因時,已知該基因在染色體上的位置但沒有該基因的序列信息,無法製備相應的探針,因此無法直接篩查文庫去克隆基因。此時,如果知道離開該基因一定距離上的DNA序列,則可用這個DNA序列作探針,通過染色體步移來逐步接近並最後達到待克隆的基因。其基本原理是用探針篩查文庫,得到陽性克隆後,將這個重組載體中的插入片段分離出來,然後用這個片段的末端部分(注意不能包含重複序列)作為新一輪篩查文庫的探針;得到新的重組載體中的插入片段,同上一個插入片段的末端部分(即探針序列)是重疊的,共有的。也就是這兩個片段是在同一條染色體上相互鄰接的。’於是,再用新得的插入片段的末端部分作為探針,再去篩查文庫。通過一系列的操作,得到的插入片段逐漸連線延伸,最後可以步移到待克隆的基因。當然,在具體操作過程中還必須設計具體的方法,如同時構建跳步文庫(jumpinglibrary)和連線文庫(1inkinglibrary)等,使插入片段朝著一個方向步移。採用一段分離自某一重組體一端的非重複DNA片段作為探針以鑑定含有相鄰序列的重組克隆。
基本簡介
用染色體步行法,從已知DNA序列克隆側翼未知序列是非常有效的方法之一,但由於所選用的特定限制性內切酶對目標基因組不能酶解成合適大小的片段,因而受PCR擴增能力的局限,往往擴增不出有效產物。一種改良的啟動子序列克隆的染色體步查法利用染色體步行法,從已知DNA序列克隆側翼未知序列是非常有效的方法之一,但由於所選用的特定限制性內切酶對目標基因組不能酶解成合適大小的片段,因而受PCR擴增能力的局限,往往擴增不出有效產物。