歷史沿革
•明治時期（1868-1912）
明治10年（1877年）04月1877年4月12日，東京開成學校與東京醫學校合併，東京大學創立，設法學、理學、文學、醫學四個學部。11年12月文部省（教育部）批准東京大學授予學士學位。 12年04月東京大學開始授予法學士、理學士、文學士、醫學士、藥學士學位。13年08月法、理、文三個學部的學士研究科成立，這是日後東京大學研究生院的前身。14年06月東京大學章程規制確立。14年08月諮詢委員會成立。19年03月更名為帝國大學。同月合併工科大學，改組帝國大學，設法、醫、工、文、理五個學部。
明治19年（1886年）04月，大學院規程制定（研究期限2年以內）。19年04月分科大學諸學科課程制定完成（法、工、文、理修業年限3年，醫科4年）。20年05月獲博士學位授予權。21年05月首次進行博士學位授予（法學、醫學、工學、文學、理學各5名）。23年06月成立東京農林學校（農科大學），學部增加到六個。30年06月京都帝國大學成立，帝國大學改稱東京帝國大學。
•大正時期（1912-1926）
| 05年04月 | 設立傳染病研究所 |
| 08年02月 | 帝國大學令更正，單科大學改為學部。新設經濟學部，總數增加到七個。 |
| 10年07月 | 航空研究所成立。 |
| 10年11月 | 東京天文台成立。 |
| 14年11月 | 地震研究所成立。 |
•昭和時期（1926-1989）
| 10年11月 | 外國人留學章程設定。 |
| 16年11月 | 成立東洋文化研究所。 |
| 17年03月 | 成立第二工學部。 |
| 19年01月 | 成立南方自然科學研究所。 |
| 20年01月 | 成立放射線化學研究所。 |
| 21年03月 | 成立理工學研究所，改組航空研究所。 |
| 21年08月 | 成立社會科學研究所。 |
| 22年03月 | 學校教育基本法、教育法公布，開始男女同校。 |
| 22年09月 | 東京帝國大學更名為東京大學。 |
| 24年05月 | 第二工學部撤銷。 |
| 24年05月 | 國立學校法令重新修訂，新制東京大學創設，新設立教養學部、教育學部從文學部分離，學部總數增加到9個。同年成立新聞研究所及生產技術研究所。 |
| 25年03月 | 成立史料編簒所。 |
| 26年03月 | 設定教育學部附屬中學校、高等學校。 |
| 28年03月 | 大學院學制制定，設定東京大學大學院（初設人文科學、社會科學、數物系、化學系、生物系5大研究科）。 |
| 28年04月 | 新制大學學位規則公布。 |
| 28年07月 | 成立套用微生物研究所、宇宙線觀測所。 |
| 30年07月 | 成立原子核研究所。 |
| 32年04月 | 成立物性研究所。 |
| 33年04月 | 藥學部從醫學部分離，成為第十個學部。 |
| 37年04月 | 成立海洋研究所。 |
| 38年04月 | 人文科學、教育學、法學政治學、社會學、經濟學5大研究科創立，現代研究生院雛形初現。 |
| 39年02月 | 制定東京大學名譽教授稱號授與規則。 |
| 39年04月 | 成立宇宙航空研究所（航空研究所廢止）。 |
| 40年04月 | 大學院生物系、數物系、化學系3個研究科改組，理學系、醫學系、藥學系、工學系、農學系5個研究科成立。 |
| 41年04月 | 成立綜合研究資料館、大型計算機中心、保健中心。 |
| 42年06月 | 成立醫科學研究所。 |
| 42年06月 | 設立低溫中心。 |
| 43年03月 | 為了反對東京大學實施登記醫師制度代替現行的實習制度，醫學院的學生髮起了醫學生運動，（東京大學安田講堂事件）因此展開。在運動發起之後，抗爭逐漸激烈，1968年3月12日的醫學院綜合中央館、3月27日的安田講堂一度遭到占領，原訂於隔日舉行的畢業典禮也因而中止。 |
| 45年04月 | 成立放射性同位素綜合中心。 |
| 47年05月 | 成立原子能綜合研究中心。 |
| 50年04月 | 成立環境安全中心。 |
| 52年04月 | 創立百年紀念典禮舉行。 |
| 58年04月 | 成立大學院綜合文化研究科。 |
| 58年04月 | 成立文獻情報中心。 |
| 58年04月 | 成立遺傳子實驗設施。 |
| 60年04月 | 成立留學生教育中心。 |
| 61年04月 | 文獻情報中心廢止，改為學術情報中心。 |
| 62年05月 | 成立先端科學技術研究中心。 |
| 63年07月 | 東京天文台廢止，改為國立天文台。 |
•平成時期（1989—）
| 02年06月 | 留學生中心變更為留學生教育中心。 |
| 03年04月 | 成立氣候系統研究中心。 |
| 04年04月 | 研究生院數理科學研究科成立。 |
| 04年04月 | 人工物工學研究中心成立。 |
| 04年04月 | 新聞研究所改組為社會情報研究所。 |
| 05年04月 | 套用微生物研究所改組為分子細胞生物學研究所。 |
| 05年04月 | 生物生產工學研究中心成立。 |
| 06年04月 | 農學系研究科改名為農學生命科學研究科。 |
| 06年06月 | 基本粒子物理國際研究中心成立。 |
| 07年04月 | 社會學研究科廢止，人文科學研究科更名為人文社會系研究科。 |
| 08年05月 | 綜合研究資料館改組為綜合研究博物館。 |
| 08年05月 | 大學綜合教育研究中心成立。 |
| 08年05月 | 國際・產學共同研究中心成立。 |
| 08年05月 | 大規模積集系統設計教育研究中心成立。 |
| 09年03月 | 廢止原子核研究所，改為高能加速器研究機構，並向全日本相關科研人員開放。 |
| 10年04月 | 大學院新領域創成科學研究科設立。 |
| 10年04月 | 駒場開放實驗室成立。 |
| 10年04月 | 空間情報科學研究中心成立。 |
| 11年04月 | 先端經濟工學研究中心成立。 |
| 11年04月 | 高溫等離子研究中心成立。 |
| 11年04月 | 教育用計算機中心與大型計算機中心更名為情報基盤中心。 |
| 12年04月 | 大學院學際情報學府成立。 |
| 12年04月 | 醫學教育國際協力研究中心成立。 |
| 13年04月 | 大學院情報理工學系研究科成立。 |
| 13年11月 | 創立東京大學名譽博士稱號制度。 |
| 14年10月 | 小柴昌俊名譽教授獲諾貝爾物理學獎。 |
| 15年03月 | 東京大學新憲章頒布。 |
| 16年03月 | 廢除社會情報研究所（併入大學院情報學環、學際情報學府）。 |
| 16年03月 | 廢除先端經濟工學研究中心（併入先端科學技術研究中心）。 |
| 16年04月 | 所有國立大學法人化，東京大學成立法人組織。 |
| 16年04月 | 大學院法學政治學研究科開設法曹養成專業。 |
| 16年04月 | 先端科學技術研究中心成為附屬研究所。 |
| 16年04月 | 特別榮譽教授制度創立。 |
| 17年03月 | 原子能綜合研究中心廢止（成為工學系研究科原子力國際專攻的一部分）。 |
| 17年04月 | 東京大學北京代表處成立。 |
| 19年11月 | 東京大學舉行成立130周年典禮。 |
| 22年03月 | 「東京大學行動計畫」發表。 |
| 22年04月 | 留學生中心廢止，成立國際本部。 |
| 23年01月 | 東京大學國際高等研究所成立。 |
| 24年02月 | 東京大學在印度設立班加羅爾事務處。 |
辦學規模
院系專業
截止2014年，東京大學下設10個學部、15個研究生招生院所，在50個本科專業、96個研究生專業招生。
| 學部設定 | ||
| 法學部 | 醫學部 | 工學部 |
| 文學部 | 理學部 | 農學部 |
| 經濟學部 | 教養學部 | 教育學部 |
| 藥學部 | ||
| 學部 | 學科數 | 學科名 | 科目 | 附屬設施 | |
| 教養學部 (前期課程) | 文科一類 文科二類 文科三類 | 理科一類 理科二類 理科三類 | 6 | 附屬教養教育高度化機構 | |
| 法學部 | 3 | 第一類 私法 第二類 公法 第三類 政治 | 5 | ||
| 醫學部 | 2 | 醫學科 健康綜合科 | 27 | 附屬病院 | |
| 工學部 | 16 | 社會基礎學科 都市工學科 機械情報工學科精密工學科 電氣電子工學科 計數工學科 套用化學科 化學生命工學科 | 建築學科 機械工學科航空宇宙工學科 電子情報工學科 物理工學科 材料工學科 化學系統工學科 系統創成學科 | 22 | |
| 文學部 | 4 | 思想文化學科 言語文化學科 | 歷史文化學科 行動文化學科 | 27 | |
| 理學部 | 10 | 數學科 物理學科 地球行星學科 化學科 生物學科 | 情報科學科 天文學科 地球環境學科 生物化學科 生物情報科學科 | 10 | |
| 農學部 | 3 | 套用生命科學課程 獸醫學課程 | 環境資源學課程 | 20 | |
| 經濟學部 | 3 | 經濟學科 金融學科 | 經管學科 | 14 | |
| 教養學部 (後期課程) | 6 | 超域文化科學科 綜合社會科學科 廣域科學科 | 地域文化研究學科 基礎科學科 生命・認知科學科 | 6 | |
| 教育學部 | 1 | 綜合教育科學科 | 5 | 附屬中等教育學校 | |
| 藥學部 | 2 | 藥科學科 | 藥學科 | 2 | |
| 國立東京大學大學院（授予碩博士學位の研究所） | ||
| 人文社會系研究科 | 理學系研究科 | 數理科學研究科 |
| 教育學研究科 | 工學系研究科 | 新領域創成科學研究科 |
| 法學政治學研究科 | 農學生命科學研究科 | 情報理工學系研究科 |
| 經濟學研究科 | 醫學系研究情報學科 | 情報學環學際情報學府 |
| 綜合文化研究科 | 藥學系研究科 | 公共政策大學院 |
| 研究科・學府 | 專業數 | 專業名 | 課程數 | 研究科附屬施設 |
| 人文社會系研究科 | 7 | 基礎文化研究 日本文化研究 東南亞文化研究 歐美文化研究 社會文化研究 文化資源學研究 韓國朝鮮文化研究 | 33 ★8 | 次世代人文學開発センター 北海文化研究常呂実習施設 |
| 教育學研究科 | 2 | 綜合教育科學 學校教育高度化 | 10 ★1 | 學校教育高度化センター バリアフリー教育開発研究センター |
| 法學政治學研究科 | 2 | 綜合法政 法曹養成 | 7 ★3 | ビジネスロー・比較法政研究センター 近代日本法政史料センター |
| 經濟學研究科 | 5 | 經濟理論 現代經濟 經營 經濟史 金融工程 | 14 ★12 | 日本経済國際共同研究センター 金融教育研究センター 経営教育研究センター |
| 綜合文化研究科 | 5 | 語言情報科學 超域文化科學 地域文化研究 國際社會科學 廣域科學 | 36 ★5 | グローバル地域研究機構 |
| 理學系研究科 | 6 | 物理學 天文學 地球行星科學 化學 生物化學 生物科學 | 28 ★30 | 植物園 臨海実験所 スペクトル化學研究センター 地殼化學実験施設 天文學教育研究センター 原子核科學研究センター ビッグバン宇宙國際研究センター 超高速強光子場科學研究センター 遺伝子実験施設 |
| 工學系研究科 | 18 | 基礎社會學 建築學 都市工學 機械工學 精密機械工學 系統創成學 航空宇宙工學 電氣系工學 物理工學 材料工學 套用化學 化學工程 化學生命工學 先端學際工學 核工程與技術 生物工程 技術經營戰略學 原子力 | 65 ★32 | 水環境制御研究センター 量子相エレクトロニクス研究センター 総合研究機構 工學教育推進機構 エネルギー・資源フロンティアセンター 光量子科學研究センター |
| 農學生命科學研究科 | 12 | 生產·環境生物學 套用生命化學 套用生命工學 森林科學 水圈生物科學 農業・資源經濟學 生物・環境工學 生物材料科學 國際農學 生物圈系統學 套用動物科學 獸醫學 | 32 ★11 | 生態調和農學機構 演習林 牧場 動物醫療センター 水產実験所 |
| 醫學系研究科 | 13 | 分子細胞生物學 機能生物學 病因・病理學 生體物理醫學 腦神經醫學 社會醫學 內科學 生殖・發育・老化醫學 外科學 健康科學・護理學 國際保健學 醫科學 公共健康醫學 | 31 ★16 | 疾患生命工學センター |
| 藥學系研究科 | 5 | 分子藥學 機能藥學 生命藥學 統合藥學 藥科學 | 8 ★4 | 薬用植物園 |
| 數理科學研究科 | 1 | 數理科學 | 6 | |
| 新領域創成科學研究科 | 12 | 物質系 尖端能量工學 複雜理工學 尖端生命科學 基因組醫學 自然環境學 系統環境學 人類環境學 社會文化環境學 國際協力學 海洋技術環境學 情報生命科學 | 32 ★32 | 生涯スポーツ健康科學研究センター オーミクス情報センター バイオイメージングセンター |
| 信息理工學系研究科 | 6 | 計算機信息科學 數理信息學 系統信息學 電子信息學 智慧型機械信息學 機器學習 | 12 ★5 | |
| 學際信息學府 | 1 | 學際信息學 | 5コース | |
| 公共政策學教育部 | 1 | 公共政策學 | 5 |
師資力量
截止到2013年5月1日，東京大學教職人員概況如下：
| 教職人員 | 男 | 女 | 總計 |
| 教授 | 1,201 | 66 | 1,267 |
| 準教授 | 804 | 97 | 901 |
| 講師 | 221 | 34 | 255 |
| 助教 | 1,109 | 217 | 1,326 |
| 助手 | 23 | 21 | 44 |
| 教諭・養護教諭 | 27 | 15 | 42 |
| 教務職員 | 1 | 1 | |
| 事務系職員 | 867 | 603 | 1,470 |
| 技術系職員 | 459 | 131 | 590 |
| 醫療系職員 | 222 | 1,545 | 1,767 |
| 其他職員 | 5 | 3 | 8 |
| 總計 | 4,938 | 2,733 | 7,671 |
| 安藤忠雄 | 戸冢洋二 |
| 小柴昌俊 | 藤嶋昭 |
優勢學科
東京大學綜合實力穩居日本國內第一位，與排名第二位的京都大學共同構成日本科教金字塔的最尖端。東京大學所有學科門類均無明顯短板，在理學、醫學、文學、工學、政治學等領域擁有世界級的學術影響力，在土木、建築學領域更是居於最尖端佇列。
| 學科 | 2014年 | 2013年 | 2012年 |
| 會計與金融 | 23 | 26 | 12 |
| 農林科學 | 13 | 19 | —— |
| 生命科學 | 18 | 12 | 17 |
| 化學 | 9 | 6 | 14 |
| 新聞傳播學 | 29 | 50 | 9 |
| 計算機科學及信息系統 | 20 | 20 | 11 |
| 地球與海洋科學 | 13 | 18 | 15 |
| 經濟與計量經濟學 | 19 | 21 | 20 |
| 教育培訓 | 35 | 25 | 12 |
| 化學工程 | 7 | 8 | 10 |
| 土木工程 | 4 | 3 | 2 |
| 電子電氣工程 | 14 | 12 | 10 |
| 機械工程 | 10 | 8 | 8 |
| 環境學 | 25 | 25 | 16 |
| 地理學 | 48 | 28 | 7 |
| 歷史與考古學 | 37 | 51-100 | —— |
| 法學 | 22 | 37 | —— |
| 語言學 | 20 | 14 | 9 |
| 材料科學 | 17 | 16 | 24 |
| 數學 | 23 | 22 | 31 |
| 醫學 | 20 | 21 | 25 |
| 現代語言學 | 13 | 20 | 19 |
| 藥學 | 12 | 14 | 8 |
| 哲學 | 29 | —— | —— |
| 物理學 | 9 | 9 | 14 |
| 政治學 | 12 | 9 | 11 |
| 心理學 | 51-100 | 39 | 20 |
| 統計及運籌學 | 14 | 12 | 27 |
辦學模式
•教養教育
東京大學由於校區的不同，教育內容和研究內容也不同。根據教育內容來看，主要分為實彪“教養”課程的目黑區駒場校區、實施專業教育的文京區本鄉校區、只進行研究生教育的千葉縣柏校區。東京大學醫科學研究所則位於港區白金台。根據研究內容，則有研究傳統學術領域的本鄉校區、進行跨學科研究的駒場校區、進行新學術領域研究的柏校區。這種校區分立體制，對於往往根據院系區分校區的其他大學是很少見的；這種在入學初期設立教養課程的大學在日本國內也並不多。
東京大學仍是採取學院制的大學，各校區實際可以稱為駒場學院、本鄉學院和柏學院。每個學院的自主權非常大，授課時間都不一樣。但另一方面，學生在選擇選修課的時候，有著很大的自由權力，所有學院的課程都可以選修。
如上所述，重視教養教育是東京大學教育的最大特徵。教養教育是作為教養學部前期課程授課的，但是東京大學的所有專業、研究生專業和研究所的老師都參加授課。在文部科學省主辦的每個大學只能應徵一項的 “特包大學支援項目”中，東京大學以 “推進教養教育與研究生院尖端研究的創造性合作”項目應徵，可以看出東京大學極為重視教養教育。
教養教育分前期課程和後期課程，基本包括了文科和理科的各種專業。前期課程涵蓋各國語言、法律和政治、經濟學、歷史學、文化人類學、物理、化學、生物、數學等等。後期課程則在前期課程基礎上加以細化。教養課程可以說基本上是一種綜合素質教育。
•教授治校
和其他優秀的亞洲高校相比，東京大學在治學理念上有兩個顯著的特點。其中第一個，是將“教授治校”放在學校管理的核心位置。這可以說是東京大學各院系保持高度專業性和學術性的一項根本保障。
除了管理獎學金、支援留學生等服務性部門，東京大學的各個院系幾乎都沒有專門的行政人員。每個院系的管理者，就是它們自己的教授和老師，甚至連學籍管理、網路維護這些雜事都是由教師們親力親為。在這樣的管理模式下，每個院系甚至每個老師都享有高度的自治權，他們的每一個行政措施，都是為教學和科研服務的。在這樣的管理模式下，東京大學的學術自由得到了充分發揮。
東京大學和中國大學的研究生院一樣，日本高校的碩士、博士教學也普遍採用導師負責制。但在東京大學，每個院系，甚至每個老師都可以決定自己研究室的組織結構。比如，在某文科研究生院中，研究文化史的老師對“師傅帶徒弟”的模式非常看重，而研究網際網路文化的導師卻採用開放式論壇，每一個研究室的氣氛都是獨一無二的。
東京大學學校、院系的每一個舉措，都是在充分考慮了自身專業特點的前提下實施的，甚至就連自己的上課時間都和別的院系不一樣。無論遇到任何問題，都可以直接尋找自己的導師或留學生支援中心解決，絕不會遇到“踢皮球”之類的現象。
而且，從提供教育服務的觀點出發，東京大學在校園內設立了餐館、便利店等。本鄉校區修建了星巴克、賽百味、Lawson等店鋪。醫學部研究樓還修建了義大利餐館。為了加強信息的發布，還設立了由學生管理的網站。
走進東京大學校內的超市，會發現這裡有著和普通超市完全不同的貨架排列：筆記本電腦和各種專業儀器就像一盒盒餅乾一樣整齊碼放在一起，文具櫃的旁邊還掛著一排一般超市很少見的白大褂。
此外，在東京大學的主校區里，食堂和快餐店多達21家，無論身處校園哪個角落，都能很快找到吃飯的地方。
和日本很多大學一樣，東京大學的後勤是交給“東京大學消費生活協同組合”（簡稱“生協”）的企業組織經營的。校方對“生協”的要求是：既不許賠錢，也不許賺錢。在這樣的經營理念下，學校的後勤將最主要的精力都放在降低成本、提供更多便利措施等方面。如今，東京大學內部的衣食住行都非常便利，學生可以放心將自己的主要精力放在課業和專業研究上。
•信息學環
相比其他高校，東京大學的必修課是比較少的，而另一方面，東京大學的選修課卻多得令人眼花繚亂。不僅如此，無論年級、專業，學生可以根據自己的興趣和需要任意選擇課程，只要時間允許，選什麼課都可以。物理系的學生可以選修世界史，教育學的學生可以選修計算機……文科生和工科生，大一新生和博士生出現在同一間教室，在東京大學是再正常不過的事情。因為學生們的專業角度和深度五花八門，經常碰撞出思維的火花，所以東京大學的每一場課堂討論都非常值得期待。
這種扁平化的課程設定，可以說是東京大學的另一個特點，這得益於東京大學在新世紀中教學思維的改變。
自從進入21世紀以來，有一個詞被越來越高頻度地在教育界提及：“複合型人才”。在人類社會進入資訊時代的今天，各學術領域的互相滲透與交融已經成為每個專業發展的必然趨一勢。因為提倡“教授治校”，一線教師就是管理者，東京大學在學術發展趨勢方面的嗅覺非常敏銳，並立即著手進行教學改革。2000年，東京大學將一些看似聯繫不大的幾個專業，如社會學、政治學、文化學、信息工程、統計學、環境學等統合為“信息學環”，並設定“學際信息學府”。這一打破常規的舉措，在當時引起了日本學界廣泛的爭論。
十年後的今天，“信息學環”的特殊能力開始充分顯現出來：計算機專業出身的理科教授，在進行國際網際網路政策等社會學研究時，會以網路構造等技術手段為理論基礎，提出“IP 地址即國家資源”的觀點。國際政治學出身的教授在研究地域文化交流時，電會從國家利益的角度出發，做出和傳統文化專家完全不同的解讀。
與此同時，東京大學還鼓勵教授積極參與媒體、企業和政黨活動，而不是泡在研究室和圖書館裡。東京大學的教授幾乎沒有不在社會團體中任職的。所以和日本其他高校相比，東京大學的老師往往具備更加寬廣的視野，他們很清楚社會各界的實際需求，並且將實現這些需求作為自己研究的重要部分，寫入論文、帶入課堂。
社會聲譽
| 2004年 | 2005年 | 2006年 | 2007年 | 2008年 | 2009年 | 2010年 | 2011年 | 2012年 | 2013年 | |
| 世界排名 | 12 | 16 | 19 | 17 | 19 | 22 | 26 | 30 | 27 | 23 |
| 亞洲排名 | 1 | 2 | 3 | 1 | 1 | 1 | 2 | 1 | 1 | 1 |
| 國內排名 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 |
| 2014/15 | 2013/14 | 2012/13 | 2011/12 | 2010/11 | Institution | Region |
| 31 | 32 | 30 | 25 | 24 | The University of Tokyo | Japan |
| 名次 | 教育機構 | 國家 | 指數 |
| 1 | Harvard University | United States | 100.0 |
| 2 | Massachusetts Institute of Technology (MIT) | United States | 87.6 |
| 3 | University of Cambridge | United Kingdom | 81.3 |
| 4 | University of Oxford | United Kingdom | 73.0 |
| 5 | University of California, Berkeley | United States | 72.4 |
| 6 | Stanford University | United States | 70.6 |
| 7 | Princeton University | United States | 36.2 |
| 8 | University of California, Los Angeles (UCLA) | United States | 35.6 |
| 9 | The University of Tokyo | Japan | 32.9 |
| 10 | Yale University | United States |
| 世界排名 | 機構名稱 | 國家排名 | 總因子 |
| 21 | The University of Tokyo | 1 | 43 |
世界排名
2017年10月25日，2018年全球最佳大學排行榜發布，東京大學在亞洲排名第三。
2017年11月，全球就業能力最強大學排行榜出爐，東京大學排名第9。
學術科研
科研機構
截止2014年，東京大學設有2個國際高等研究所、12個尖端研究中心、16個直屬科研機構，在11個附屬研究所建有47個高水平研究中心，在研究生院建有30餘個附置科研機構。
國際高等研究所
| カブリ數物連攜宇宙研究機構 | サステイナビリティ學連攜研究機構 |
獨立研究中心
| 低溫實驗中心 | 放射性同位素綜合研究中心 | 環境安全研究中心 |
| 人工物工學研究中心 | 生物生產工學研究中心 | 亞洲生物資源環境研究中心 |
| 大學綜合教育研究中心 | 空間情報科學研究中心 | 情報基礎研究中心 |
| 基本粒子物理國際研究中心 | 大規模集積系統設計教育研究中心 | 未來政策研究中心 |
直屬研究機構
| 地球観測データ統融合連攜研究機構 | 放射光連攜研究機構 |
| 創薬オープンイノベーション中心 | ナノ量子情報エレクトロニクス研究機構 |
| 知の構造化中心（ネットワーク） | 海洋基礎生物學研究推進中心 |
| 海洋アライアンス | 大學発教育支援コンソーシアム推進機構 |
| 高齢社會総合研究機構 | IRT研究機構 |
| トランスレーショナル・リサーチ・イニシアティブ | フューチャーセンター推進機構 |
| 生命科學ネットワーク | マイクロ・ナノ多機能デバイス研究ネットワーク |
| 日本・アジアに関する教育研究ネットワーク | 東京大學文書館 |
附屬研究所
| 醫學研究所 |
|
| 地震研究所 |
|
| 東洋文化研究所 |
|
| 社會科學研究所 |
|
| 生產技術研究所 |
|
| 史料編纂所 |
|
| 分子細胞生物學研究所 |
|
| 宇宙線研究所 |
|
| 物性研究所 |
|
| 大氣海洋研究所 |
|
| 先端科學技術研究所 |
|
科研概況
•科研經費
東京大學2012年全年在研項目4971個，政府資助科研經費到款233.2億日元 ；與外界合作研究及受委託研究項目2632個，獲科研經費310億日元；另受外界捐贈資金15235筆，總計86.9億日元。
| 科研經費研究領域 | 件數 | 到款金額（百萬日元） |
| * 特別推進研究 | 25 | 2,250 |
| 特定領域研究 | 16 | 140 |
| * 新學術領域研究 | 314 | 5,363 |
| * 基盤研究（S） | 93 | 3,349 |
| * 基盤研究（A） | 295 | 3,282 |
| * 基盤研究（B） | 402 | 1,816 |
| * 基盤研究（B）（一部基金分） | 201 | 1,375 |
| * 基盤研究（C） | 187 | 201 |
| * 基盤研究（C）（基金分） | 448 | 775 |
| * 挑戦的萌芽研究 | 22 | 25 |
| * 挑戦的萌芽研究（基金分） | 461 | 842 |
| * 若手研究（S） | 9 | 130 |
| * 若手研究（A） | 106 | 705 |
| * 若手研究（A）（一部基金分） | 48 | 481 |
| * 若手研究（B） | 91 | 94 |
| * 若手研究（B）（基金分） | 650 | 1,110 |
| * 研究活動スタート支援 | 128 | 184 |
| 奨勵研究 | 32 | 16 |
| 特別研究促進費 | 8 | 5 |
| 研究成果公開促進費 | 13 | 85 |
| 特別研究員奨勵費 | 1,420 | 1,079 |
| * 學術創成研究費 | 2 | 12 |
| 計 | 4,971 | 23,319 |
| 區分 | 件數 | 受入額(百萬円) | |
| 民間等との共同研究 | 1,412 | 5,067 | |
| 受託研究 | 國・競爭的資金 | 511 | 11,975 |
| 國・競爭的資金以外 | 470 | 13,363 | |
| 國以外からの受託 | 239 | 934 | |
| 小計 | 1,220 | 26,272 | |
| 寄附金 | 15,235 | 8,680 | |
| 合計 | 17,867 | 40,019 | |
•影響因子
在2014年3月《自然》發布的年度報告中，東京大學2013年《自然》雜誌高質量論文的貢獻指數排名第8；在《sciencewatch》發布的1999-2009十年間論文引用排名中，東京大學位列第11。
| Institution | CC3 | Articles4 | |
| 1. | Harvard University, USA | 158.99 | 387 |
| 2. | Massachusetts Institute of Technology (MIT), USA | 84.68 | 228 |
| 3. | Stanford University, USA | 80.21 | 170 |
| 4. | National Institutes of Health (NIH), USA | 73.46 | 181 |
| 5. | Max Planck Society, Germany | 70.65 | 216 |
| 6. | Chinese Academy of Sciences (CAS), China | 63.15 | 165 |
| 7. | French National Centre for Scientific Research (CNRS), France | 59.37 | 297 |
| 8. | The University of Tokyo, Japan | 57.19 | 128 |
| 9. | University of California San Francisco (UCSF), USA | 49.81 | 107 |
| 10. | University of Cambridge, UK | 48.52 | 151 |
| 排名 | 科研機構 | 論文總數 | 引用總數 | 平均引用數 |
| 1 | 哈佛大學 | 95,291 | 2,597,786 | 27.26 |
| 2 | 馬克斯·普朗克學會 | 69,373 | 1,366,087 | 19.69 |
| 3 | 約翰霍普金斯大學 | 54,022 | 1,222,166 | 22.62 |
| 4 | 西雅圖華盛頓大學 | 54,198 | 1,147,283 | 21.17 |
| 5 | 史丹福大學 | 48,846 | 1,138,795 | 23.31 |
| 6 | 加州大學洛杉磯分校 | 55,237 | 1,077,069 | 19.5 |
| 7 | 密西根大學 | 54,612 | 948,621 | 17.37 |
| 8 | 加州大學伯克利分校 | 46,984 | 945,817 | 20.13 |
| 9 | 加州大學舊金山分校 | 36,106 | 939,302 | 26.02 |
| 10 | 賓夕法尼亞大學 | 46,235 | 931,399 | 20.14 |
| 11 | 東京大學 | 68,840 | 913,896 | 13.28 |
| 12 | 加州大學聖地亞哥分校 | 40,789 | 899,832 | 22.06 |
| 13 | 多倫多大學 | 55,163 | 861,243 | 15.61 |
| 14 | 倫敦大學學院 | 46,882 | 860,117 | 18.35 |
| 15 | 哥倫比亞大學 | 43,302 | 858,073 | 19.82 |
| 16 | 耶魯大學 | 36,857 | 833,467 | 22.61 |
| 17 | 麻省理工學院 | 35,247 | 832,439 | 23.62 |
| 18 | 劍橋大學 | 43,017 | 811,673 | 18.87 |
| 19 | 牛津大學 | 40,494 | 766,577 | 18.93 |
| 20 | 威斯康星大學麥迪遜分校 | 50,016 | 760,091 | 15.2 |
•先端研究
能源開發研究
日本政府每年投放多達80億日元給東京大學、京都大學、九州大學等數所大學進行核聚變的基礎論研究，以此進行新能源的開發；東京大學的理學部、原子能所、工學部等單位聯手進行加速器科學、基本粒子、原子能等方面的理論與工程研究並已取得了初步的成果。
宇航研究
東京大學校園的銀杏以東京大學宇宙線研究所為依託單位，由日本政府每年撥款百餘億日元設備製造費和試驗費，至今已發射了14顆衛星和多顆運載火箭，進行極光觀測、探測行星和地球磁場、開展天文物理及無人宇宙實驗室的試驗。
地震火山研究
東京大學的地震火山研究活動在世界處於領先地位，此項綜合研究由政府每年撥款20億日元進行，並在東京大學建立全國性的地震變化資料處理中心、在全國各地地震火山多發地區均設立了裝置先進、預測可靠的觀察所。
海洋研究
東京大學的海洋研究於1967年在一艘大型海洋勘察船上開始，而後又同美國財團合作，建造了一艘更為先進的科考船進行深海鑽探、重大海洋地殼構成、海底生態、海底資源開發等領域的研究工作；此外日本文部省數次撥款組織東京大學等校研究人員參與南極的綜合科學考察。
癌研究
早在1983年日本政府就提出了“癌研究十年計畫”，並交付由東京大學、東北大學、大阪大學等院校聯合美國有關研究機構合作實施。研究圍繞致癌原因、診斷方法、治療途徑三方面展開，還涉及生物化學、遺傳學、核物理學等領域，東京大學醫學團隊是該項研究的中堅力量。
學術資源
•館藏資源
東京大學圖書館創立於1877年，原館在1923年的日本關東大地震中付之一炬。新的總圖書館於1928年受洛克菲勒基金資助興建；整個東京大學圖書館系統包括總圖書館及60餘個系所分館。
截止2013年，東京大學圖書館館藏圖書合計926萬冊，其中日文圖書488萬冊，外文圖書428萬冊，有各類學術刊物16萬冊；2012年全年購入及受捐圖書文獻總計15萬9千餘冊。
•博覽館所
総合研究博物館
安田講堂，為東京大學重要的學術象徵総合研究博物館 小石川分館
駒場博物館（大學院総合文化研究科・教養學部）
健康と醫學の博物館（大學院醫學系研究科・醫學部）
農學資料館（大學院農學生命科學研究科・農學部）
農場博物館（大學院農學生命科學研究科・農學部）
近代醫科學記念館（醫科學研究所）
大學院理學系研究科附屬植物園（小石川植物園）
歷任校長
| 大學名稱 | 役職名稱 | 就任年月 | 氏名 |
| 東京大學 | 法理文3學部綜理 | 明治10年04月 | 加藤 弘之 |
| 醫學部綜理 | 明治10年04月 | 池田 謙斎 | |
| 総理 | 明治14年07月 | 加藤 弘之 | |
| 総理(事務取扱) | 明治19年01月 | 外山 正一 | |
| 帝國大學 | 総長(事務取扱) | 明治19年03月 | 外山 正一 |
| 総長 | 明治19年03月 | 渡邊 洪基 | |
| 総長 | 明治23年05月 | 加藤 弘之 | |
| 総長 | 明治26年03月 | 濱尾 新 | |
| 総長 | 明治30年11月 | 外山 正一 | |
| 東京帝國大學 | 総長 | 明治31年05月 | 菊池 大麓 |
| 総長 | 明治34年06月 | 山川 健次郎 | |
| 総長(兼) | 明治38年12月 | 松井 直吉 | |
| 総長 | 明治38年12月 | 濱尾 新 | |
| 総長(事務取扱) | 大正01年08月 | 櫻井 錠二 | |
| 総長 | 大正02年05月 | 山川 健次郎 | |
| 総長 | 大正09年09月 | 古在 由直 | |
| 総長 | 昭和03年12月 | 小野冢 喜平次 | |
| 総長 | 昭和09年12月 | 長與 又郎 | |
| 総長(事務取扱) | 昭和13年11月 | 佐藤 寛次 | |
| 総長 | 昭和13年12月 | 平賀 譲 | |
| 総長(事務取扱) | 昭和18年02月 | 寺澤 寛一 | |
| 総長 | 昭和18年03月 | 內田 祥三 | |
| 総長 | 昭和20年12月 | 南原 繁 | |
| 東京大學 | 総長 | 昭和26年12月 | 矢內原 忠雄 |
| 総長 | 昭和32年12月 | 茅 誠司 | |
| 総長 | 昭和38年12月 | 大河內 一男 | |
| 総長(事務取扱) | 昭和43年11月 | 加藤 一郎 | |
| 総長 | 昭和44年04月 | 加藤 一郎 | |
| 総長 | 昭和48年04月 | 林 健太郎 | |
| 総長 | 昭和52年04月 | 向坊 隆 | |
| 総長 | 昭和56年04月 | 平野 龍一 | |
| 総長 | 昭和60年04月 | 森 亘 | |
| 総長 | 平成01年04月 | 有馬 朗人 | |
| 総長 | 平成05年04月 | 吉川 弘之 | |
| 総長 | 平成09年04月 | 蓮實 重彥 | |
| 総長 | 平成13年04月 | 佐々木 毅 | |
| 総長 | 平成17年04月 | 小宮山 宏 | |
| 総長 | 平成21年04月 | 濱田 純一 | |
| 総長 | 平成27年04月 | 五神 真 |
文化傳統
標識
東京大學東京大學並沒有正式意義上的所謂“校徽”，右邊黃青相間的圖案只是東京大學長久以來的“標識”，它來源於昭和23年6月的校理事會上星野昌一教授繪製的圖案。
圖案由一黃一青兩枚互相交疊的銀杏葉組成，銀杏是東京大學校園內栽植最為廣泛的樹種，沿街而立，每逢秋季黃葉遍地、覆滿整個校園，因此金黃的銀杏葉寓意東大最美麗的一面；而另一片銀杏葉的顏色則源於東大傳統的代表色——淡青。
歌曲
與校徽相同，即便東京大學是一所有著超過百年辦學歷史的老校，直到今天，東大也沒能選出一首公認的“校歌”；2004年6月，東京大學曾專門成立校歌制定委員會開展校歌徵選活動，最終選出「ただ一つ」與「大空と」兩首歌曲，依據不同場合，代行“校歌”之職。
| 「ただ一つ」 | 「大空と」 （東京大學運動會歌） |
| 作詞 大森幸男 作曲 山口琢磨 | 作詞 北原白秋 作曲 山田耕筰 |
| 一、 ただ一つ 旗かげ高し いまかがやける 深空の光 天寵を 負える子ら 友よ 友 ここなる丘に 東大の旗立てり 伝統の旗 東大の光 たたえ たたえん たたえ たたえん 二、 ただ一つ 歌ごえ高し いまなりわたる 疾風の力 雙眼の 澄める子ら 友よ 友 ここなる杜に 東大の歌涌けり 伝統の歌 東大の力 たたえ たたえん たたえ たたえん | 一、 大空と澄みわたる淡青 厳たり我が旗高く開かん 仰げよ梢を銀杏のこの道 蘊奧の窮理応じて更に 人格の陶冶ここに薫る 栄光の學府 巍々たり赤門我が赤門 高く開かん 二、 大空と新しき淡青 冴えたり我が旗風と光らん 楽しめ季節を思慮あれこの道 文明の證自由と常に 甚深の調和ここに明る 精神の學府 満ちたり赤門我が赤門 風と光らん 三、 大空と揺り動く淡青 生きたり我が旗雲と興らん 羽ばたけ搏力どよめよこの道 青春の笑い爆けてすでに 健腕の矜ここに躍る 堂々の學府 こうたり赤門我が赤門 雲と興らん |
象徵
•校色
東京大學的代表色是“淡青色”，其源於一場競技。東京大學與京都大學之於日本，酷似牛津大學與劍橋大學之於英國，東大與京大長期保持著相爭共進的友好關係；在很久很久之前（傳為1920年）兩校之間進行的一場划艇比賽中，由東京大學與京都大學抽籤決定各自所乘賽艇，兩校抽到的賽艇艇身分別為淡青色和濃青色，自那以後，這兩種顏色也就成了他們雙方的代表色，最後逐步演變為校色。
而在東京大學內部，各個學部也分別擁有自己的代表色。
•院色
| 法學部 綠色 | 醫學部 紅色 | 工學部 白色 | 理學部 樺色 | 農學部 紫色 |
| 經濟學部 青色 | 教養學部文科 黑色 | 教養學部理科 黃色 | 教育學部 橙色 | 藥學部 胭脂色 |
校園環境
東京大學本鄉總校區：東京都文京區 40.27公頃
東京大學主校區設在東京都內文京區本鄉，占地面積40公頃 ，全校絕大部分機構均在這裡。另外在目黑區駒場另建一新校區，為教養學部及生產技術研究所所在地。附屬學校、工同研究部門，實驗實習基地（如農場、林場、地震、火山、天文等觀察站）、師生員工宿舍等分布於全國各地。
東京大學赤門赤門是日本東京大學本鄉校區在本鄉通側的一個大門，原為加賀藩的御守殿門，“赤門”為御守殿門的俗稱，此乃因為御守殿門皆漆為朱紅色之故。依古代日本習俗，御守殿門一旦受災損毀便不能重建，而東京大學的赤門是唯一留存下來的御守殿門，已有百年以上的歷史，殊為難得，因此曾被日本政府列為國寶，現則指定為重要文物。赤門也是東京大學的代表性象徵之一，被假借為東京大學的代稱，也因而常被誤以為是東京大學的正門，東京大學真正的正門在赤門旁邊。
東京大學淺野校區：東京都文京區 4.37公頃
彌生校區：東京都文京區11.28公頃
駒場校區：東京都目黑區 35.20公頃
綜合博物館小石川分館白金校區：東京都港區 7.2公頃
三鷹校區：東京都三鷹市6.88公頃
東京大學檢見川校區：千葉縣千葉市 32.3公頃
傑出人才
•政界
加藤高明：第24任日本內閣總理大臣
佐藤榮作若槻禮次郎：第25、第28代首相
浜口雄幸：第27代首相，酒豪，雄獅宰相
廣田弘毅：第32代日本首相
平沼騏一郎：第35代首相
幣原喜重郎：第44任日本首相
吉田茂：第45、48─51代日本首相
片山哲：第46屆首相
蘆田均：第47任日本首相
佐藤榮作：第61─63代日本首相、1974年諾貝爾和平獎得主
石冢英藏：1929－1931年任台灣總督
鳩山一郎：第52、53、54任日本首相
岸信介：第56、57代日本首相
福田赳夫：第67代日本首相
宮澤喜一中曾根康弘：第71─73代日本首相
宮澤喜一：第78代日本首相
加藤紘一：日本眾議院議員
小和田雅子：日本皇太子德仁親王妃
內田康哉：原敬、高橋、加藤各內閣外相，兩任代理首相
宮本顯治：日本共產黨領袖
不破哲三：日本共產黨領袖
江田五月：前參議院議長
向坊隆：中日友好協會副會長
•科教界
朝永振一郎：1965年諾貝爾物理學獎得主
江崎玲於奈：1973年諾貝爾物理學獎得主
小柴昌俊：2002年諾貝爾物理學獎得主
小柴昌俊南部陽一郎：2008年諾貝爾物理學獎得主
根岸英一：2010年諾貝爾化學獎得主
大隅良典：2016年諾貝爾生理學或醫學獎
小平邦彥：1984/1985年沃爾夫數學獎得主
伊藤清：1987年沃爾夫數學獎得主
佐藤乾夫：2002/2003年沃爾夫數學獎得主
槙文彥：1988年沃爾夫藝術獎得主
仁科芳雄：日本物理學之父
高峰讓吉：荷爾蒙—“腎上腺素”的發現者
志賀潔：志賀桿菌的發現者
矢內原忠雄：日本著名經濟學者
植草一秀：經濟學家，前早稻田大學研究生院教授
家永三郎：日本著名歷史學家，教育家
石坂公成：日本首位蓋爾德納國際獎得主（1973年）
•文藝界
川端康成川端康成：1968年諾貝爾文學獎得主
大江健三郎：1994年諾貝爾文學獎得主
芥川龍之介：日本著名小說家，一代文豪
夏目漱石：日本著名作家，一代文豪
太宰治（肄業）：日本著名小說家，一代文豪
三島由紀夫：日本著名作家，一代文豪
谷崎潤一郎：著名小說家，被日本文學界推崇為經典的唯美派大師
森鷗外：小說家、評論家、翻譯家
竹內好：文學評論家、漢學家
吉行淳之介（肄業）：作家
安部公房：作家，曾獲諾貝爾文學獎提名
芥川龍之介梶井基次郎（肄業）：小說家
志賀直哉：作家，“白樺派”代表作家之一
菊池寬：小說家，戲劇家
永井荷風：小說家、散文家
小田實：作家、和平運動家
鈴木三重吉：日本小說家、兒童文學作家
正岡子規：俳句權威
上田敏：詩人、評論家
•華人校友
江丙坤：台灣經濟部長、經建會主委、海基會董事長。
賴永祥：圖書館學學者，曾任哈佛大學燕京圖書館副館長，中國圖書分類法的設計者。
許世楷：台灣駐日代表，台灣獨立運動主要參與者。
賴浩敏：台灣司法院院長。
劉明朝：前台灣參議員、制憲國大代表、立法委員。
梁希： 中國科學院院士，林業部首任部長，曾任南京大學校長、南京林業大學校長。
黃現璠：中國現代民族學奠基人之一，壯學之父。1935年曾就讀於東京帝國大學研究院。
黃昭堂：台灣獨立運動參與者，政治學者，現任“台灣獨立聯盟”主席；曾任日本“昭和大學”政治學教授。
王育德：語言學及歷史學者，日本台灣獨立運動的領導人，《台灣青年》的創始人。
王育霖：台灣日治時期律師，戰後曾任新竹地檢處檢查官，在台灣的“二二八事件”中被處死。
張炎憲：台灣現任國史館館長，台灣史研究的著名學者。
鄭欽仁：歷史學者，曾任國立台灣大學歷史系教授；現任台灣總統府國策顧問。
蘇遠志：套用微生物學家，有台灣醱酵之父之稱。
宋進英：日本高等文官考試合格、日治時期台籍律師、台灣私立延平學院創辦人。
盤點中國認證學歷的日本國立大學
| 日本地處溫帶，氣候溫和、四季分明。日本的高等教育從初等教育以及中等教育的12年教育以後開始，留學生可以入學的高等教育機構有以下5類。根據其設施，大致可分國立、公立和私立。 |
環太平洋大學聯盟
| 澳大利亞 | 澳大利亞國立大學 | 墨爾本大學 | 悉尼大學 |
| 加拿大 | 不列顛哥倫比亞大學 |
| 智利 | 智利大學 |
| 中國大陸 | 復旦大學 | 南京大學 | 北京大學 | 清華大學 | 中國科學技術大學 | 浙江大學 |
| 印度尼西亞 | 印度尼西亞大學 |
| 日本 | 慶應義塾大學 | 京都大學 | 大阪大學 | 東北大學 | 東京大學 | 早稻田大學 |
| 韓國 | 首爾大學 | 高麗大學 |
| 中國香港 | 香港大學 | 香港科技大學 |
| 馬來西亞 | 馬來亞大學 |
| 墨西哥 | 蒙特瑞科技與高等教育學院 | 墨西哥國立自治大學 |
| 紐西蘭 | 奧克蘭大學 |
| 菲律賓 | 菲律賓大學 |
| 俄羅斯 | 遠東國立大學 |
| 新加坡 | 新加坡國立大學 |
| 中國台灣 | 國立台灣大學 |
| 泰國 | 朱拉隆功大學 |
| 美國 | 加州理工學院 | 史丹福大學 | 柏克萊加州大學 | 戴維斯加利福尼亞大學 | 爾灣加州大學 | 洛杉磯加利福尼亞大學 | 聖地牙哥加利福尼亞大學 | 聖塔芭芭拉加利福尼亞大學 | 俄勒岡大學 | 南加州大學 | 華盛頓大學 |
