歷史革沿
文山自然保護區1980年6月5日文山州革命委員會批准合併建立州級保護區；
1986年3月批建小橋溝省級保護區；
1997年批建老君山省級保護區；
2000年7月擴建合併為“雲南文山自然保護區”；
2003年6月升為國家級自然保護區。
文山自然保護區溶洞地點：雲南省文山縣、西疇縣經緯度。
海拔範圍：1400—2991.2米。
總面積：26867公頃。
屬森林生態系統類型的自然保護區。主要景觀有森林、地貌、水域、人文等，如薄竹山、老君山、林海、竹海、溶洞、溫泉、瀑布、雪簾等。
瀑布分布有獸類9目29科60屬86種，鳥類13目37科221種，兩棲爬行類5目22科56屬92種，魚類4目15科44屬60種（亞種），昆蟲11目75科222種；
其中有國家一級重點保護野生植物5種，二級重點保護野生植物32種；如蜂猴、倭蜂猴、熊猴、雲豹、印支虎。
自然環境
黃棕壤地理坐標：為東經103°53′～104°10′、104°41′～104°52′，北緯23°16′～23°25′、23°21′～23°24′。
面積：保護區總面積26867公頃，核心區總面積為10304.62公頃，緩衝區面積7793.48公頃，實驗區面積8768.90公頃。
土壤：保護區內主要為黃壤、黃棕壤分布，PH值6—6.5，厚度60至120厘米，坡向3/4的為北向（陰坡），坡度15—25度之間。
岩溶地貌地貌：地處滇東南，為典型的岩溶地貌區。屬華南褶皺系西端滇東南褶皺帶西北部與揚子準地台嵌合，境內山巒起伏，河流溝壑縱橫；區內沉積地層發育，構造複雜，岩漿活動頻繁、強烈，岩類多樣，具有得天獨厚的成礦環境，形成了豐富的礦產資源。
氣候特徵：地處雲南省東南部低緯度高原，東南近北部灣，西南離孟加拉灣不遠，屬南亞熱帶季風氣候，隨海拔高低，兼有中亞熱帶、北亞熱帶、南亞熱帶和溫帶氣候。
多年平均氣溫17.8℃，極端最高氣溫27.7℃，極端最低氣溫-3℃。多年平均日照319天、2023.1小時。
降雨有“春旱、夏霪、秋濕、冬乾”的特點，多年平均降雨量為992.7mm，多年年平均無霜期359天，占98.36%，多年年平均有霧14.8天。
山地苔蘚常綠闊葉林保護區內的茫茫林海，生長著117種國家級珍稀樹種；肥沃大地，蘊藏著55種寶貴礦產。把健康與富裕的夢想變成現實的文山三七，早在明代就被醫學家李時珍寫進《本草綱目》，譽為“金不換”；更有極富地方特色的辣椒、八角、八寶米、草果、陽荷、烤菸、油桐、茶葉等聲名遠播。河川縱橫，水資源總量127.5億立方米，水能理論蘊藏量323萬千瓦，可開發利用134萬千瓦。
植物資源
北回歸線穿境而過，氣候適宜，資源豐富。具有南亞熱帶森林類型，保存著眾多的動植物種群，是亞熱帶植物區系中心發源地之一，分布著連片的天然原始闊葉林。林內生物古老而豐富，植被類型和動物種群多種多樣，具有“北回歸線的綠洲”之稱。
該區也是華夏植物區系的核心部分，是種子植物演化中心，古老和新生類類群在此地同時發展，而形成一個植物演化的歷史博物館，可看到許多種子植物清晰的演化史。保護好這個植物生存的大環境及其豐富的植物物種，對研究植物進化及種子植物起源有著重要理論意義。
保護區分布有維管束植物228科1046屬3347種（據後文統計），其中蕨類植物41科100屬262種，種子植物187科946屬3085種，分布密度達每平方公里有12.5種維管束植物。
文山三七三七：為五加科人參屬植物，因枝分三枝，為七片，故稱為“三七”，又名田七、金不換等，古時亦稱昭參、血參、人參三七、田三七、山漆、三七參等。
因常在春冬兩季採挖，又分為“春七”和“冬七”。由於三七同為人參屬植物，而它的有效活性物質又高於和多於人參，因此又被現代中藥藥物學家稱為“參中之王”。
文山三七花三七生長的地域性很強。文山州由於自然條件得天獨厚，是三七的原產地和主產地，生產性栽培三七已有近500年的歷史，栽培歷史悠久，七農經驗豐富，因而三七產質優、產量高，占中國總產量的90％以上，質量居中國之冠，成為名副其實的“三七之鄉”。早在清朝就已蜚聲海內外。經中國農學會特產經濟專業委員會認定：文山縣、硯山縣分別為“中國三七之鄉”。
動物資源
蜂猴分布有獸類9目29科60屬86種；
鳥類13目37科221種；
兩棲爬行類5目22科56屬92種；
魚類4目15科44屬60種（亞種）；
昆蟲11目75科222種；
其中有國家一級重點保護野生植物5種，二級重點保護野生植物32種。如蜂猴、倭蜂猴、熊猴、雲豹、印支虎。
倭蜂猴 形態特徵：倭蜂猴與蜂猴十分相似而體型更小，只有蜂猴的一半大，其身長21-22.5厘米，尾長1.2厘米，體重325-425克。
頭圓，眼圓而大，無頰囊，口、鼻、唇白色。體毛細絨狀，多為橙色至赤褐色。從背部中央至頭頂有一深色紋，腹部、四肢有銀灰色光澤。
鑑別特徵：中國體型最小的一種原猴類，成體體重0.3-0.4kg，僅及蜂猴的1/3，體長不及250mm。
在毛被、毛色和斑紋上，倭蜂猴的面部和頸肩部大部為橙棕色而無灰色。
