歷史沿革
山西醫科大學晉祠學院1996年，張宏德創辦“中日友好醫學院”。
1998年，山西“中日友好醫學院”被評為山西省社會力量辦學優秀學校。
1999年，山西“中日友好醫學院”榮獲山西省揚時代風帆、創宏圖偉業——三晉改革之光杯。
2000年，山西“中日友好醫學院”榮獲山西省社會力量辦學先進單位稱號。
2001年，張宏德院長在馳名中外的風景區晉祠獨立建校，占地162畝，使學院有了一個全新的環境。學校又購置了一大批教學儀器和模型，充實擴大了實驗室，充分滿足了學生實驗、學習的需求。
2002年，山西“中日友好醫學院”被評為山西省優秀高校。
2002年6月，山西醫科大學與山西中日友好醫學院強強聯手、優勢互補，經山西省人民政府批准，（晉政函[2002]118號）成立山西醫科大學晉祠學院，為山西醫科大學二級學院。
2003年，學院首次招錄醫學類本科生。
2004年，山西醫科大學晉祠醫學院被評為中國一流獨立學院。
2004年，山西醫科大學晉祠醫學院被定為全國教育發展“十五”規劃重點科研課題制定護理學科教研示範基地。
2004年3月，學院被國家教育部確認為公辦獨立學院（教發函[2004]42號），是山西省唯一一所醫學類獨立學院，具有獨立法人、獨立校園、獨立財務、獨立頒發文憑資格。
2005年，山西醫科大學晉祠學院被中科院教育質量測評中心評為“社會滿意學校”。
2005年，山西醫科大學晉祠學院被定為教育調查“十一五”重點項目評為中國創新教育示範基地。
2003年至2005年，先後開設了臨床醫學、預防醫學、麻醉學、法醫學、口腔醫學、藥學、影像學、護理學、信息管理與信息系統、社會工作、公共事業管理、中藥學、藥物製劑、英語等14個專業。
2006年起，學院對所招學生進行全程培養管理，專業設定主要有臨床醫學、護理學、口腔醫學、信息管理與信息系統、社會工作、公共事業管理等6個專業。學院依託山西醫科大學雄厚的師資力量，所有的醫學專業教學課程由山西醫科大學教務處安排並組織實施。
2006年，山西醫科大學晉祠學院被評為“全國十佳辦學單位”。
2009年，山西醫科大學晉祠學院被評為“全國最佳獨立學院”。
2009年，山西醫科大學晉祠學院被評為“輝煌中國60年·先進教育單位”。
2009年，學院先後成立了自已的基礎課教研室和體育課教研室，分別擔負學院學生的英語課和體育課教學任務。
2010年，山西醫科大學晉祠學院被授予“誠信辦學社會滿意明星學校”。
2011年，山西醫科大學晉祠學院被太原市政府評為“綠化先進單位”。
2014年，學院在新一屆領導班子帶領下，厚積薄發，已成為一所多專業、多學制的高等醫學院校。現設有臨床醫學系、護理學系、管理系和基礎醫學部，共開設臨床醫學、口腔醫學、麻醉學、護理學、預防醫學5個本科專業。該院以山西醫科大學的教育教學資源為依託，教學實行統一管理，主要教學任務由山西醫科大學教師擔任。現有主講教師439人，其中教授91人，副教授158人，講師149人，助教41人，副教授以上職稱教師占到56%，高素質、專家型的教師隊伍為保障教學質量奠定了堅實的基礎。
2014年8月5日，山西醫科大學與希望教育集團簽署合作舉辦山西醫科大學晉祠學院協定。
2015年，該院擬規劃建設新校區，占地面積800畝。
2016年8月前，新校區一期建設工程按5000人規模開始建設。
2017年9月26日，山西醫科大學晉祠學院在祁縣喬家大院附近落成，首批1100名大學生開學入住。
2019年9月1日前，全部在校生入住新校區。
2020年年底完成10000人以上規模的新校區建設工程。
辦學特色
山西醫科大學晉祠學院堅持高質量、高起點、高目標、高要求的辦學宗旨，嚴格要求，嚴謹辦學，以市場需要為導向，以學生能力塑造辦學品牌，堅持以學生為本，以質量求生存，不斷開拓創新，推行人性化管 理 ，狠抓教書育人、管理育人、環境育人、服務育人，奉行一切為了學生，一切服務於學生，堅持對國家的人才培養負責，對學生成才負責，對家長的希望負責，對學院發展負責，培養品學兼優、德才兼備的高素質複合型醫學人才。
辦學環境
山西醫科大學晉祠學院學院占地330餘畝，綠化面積 40 ％以上，園林式的校園風景秀麗，綠茵環繞、碧草如茵、清雅幽靜，是讀書、治學的理想之地。學院建築面積 68000 平方米。生均面積9.43 平方米，教室生均座位數 1.55 個。擁有現代化的集醫學形態、技能、機能等實驗室、電教室、計算機網路中心、多媒體教室於一體的教學實驗大樓；寬敞明亮、配套齊全的學生公寓樓；完善的後勤保障體系及豐富的文化、體育、娛樂設施。與校本部的資源共享：校本部擁有近千人的龐大師資隊伍為我院提供了強有力的人力資源保障。校本部圖書館藏書總計冊，圖書資源的共享，極大開拓了學生的視野。
學術團體
◆英語沙龍
◆雄鷹足球協會
◆攝影學會
◆雷射樂隊
搏智協會
急救協會
籃球協會
小語種協會
動漫協會
舞蹈協會
校風學風
山西醫科大學晉祠學院開展豐富多彩的校園文化活動，營造健康向上、文明高雅的文化氛圍，學生自發組織各種學生團體和活動，陶冶情操，升華人生，學院文化氛圍濃厚。學生素質不斷提高，應徵參軍，參加青年志願者，積極入團、入黨，提升了學生價值觀。
引導學生自發組織學生團體，如足球俱樂部、英語沙龍等總計21個學生團體。
組織學術講座16次，多次舉辦演講、徵文、辯論大賽以及卡拉OK大賽等，極大豐富了校園文化。
院系設定
臨床醫學系
臨床醫學
[培養目標]：培養符合二十一世紀醫藥衛生事業發展需要的德、智、體全面發展的臨床醫師和科技人才。
[課程設定]：五年制臨床醫學專業以普通基礎專業課、醫學基礎課、醫學專業課以及臨床實踐為主，開設課程主要有人體解剖學、微生物與免疫學、組織胚胎學、生物化學、生理學、病理學、診斷學、英語、計算機、內科學、外科學、婦產科學、兒科學等。
[修業年限]：五年
[學位授予]：醫學學士（註：該專業為2004年山西省普通高等學校本科品牌專業）。
護理學
[培養目標]：培養為社會主義衛生事業服務，具有良好職業素質。德、智、體全面發展。面向社會，為生活在不同環境中的個體和群體提供健康服務的實用型高級護理人才。[課程設定]：護理專業開設英語、計算機基礎、人體形態與功能學、病原微生物與免疫學、生物化學、病理學、藥理學、內科護理學、外科護理學、婦產科護理學、兒科護理學、五官科護理學、中醫護理學、急救護理學、老年護理學、社區護理學等課程。
[修業年限]：四年
[學位授予]：醫學學士或理學學士。
衛生事業管理系
信息管理與信息系統（衛生事業管理方向）
[培養目標]：培養德、智、體全面發展的，適應我國社會主義現代化建設需要的，集醫學基礎知識，現代信息技術與管理能力為一體的高級專業人才。
[課程設定]：本專業的主幹學科為醫學、計算機科學與技術、管理學。開設課程有基礎醫學、臨床醫學概論、高等數學、計算機基礎、衛生事業管理、醫學管理學、衛生統計學、管理心理學、數據結構與資料庫、醫學信息系統（HIS）、信息分析與研究、信息經濟學、計算機網路教育、多媒體技術等。
[修業年限]：四年。
[學位授予]：管理學學士。
社會工作
[培養目標]：通過規範的專業教育，確立社會工作理念，傳授社會工作專業知識和助人的基本技巧，培養具有良好的政治素質和道德修養、堅實的理論基礎和研究解決問題的能力，具有敬業精神和開拓創新能力的高級專門人才。
[主要課程]：社會工作專業除了政治理論、英語、計算機等公共課程外，設定的專業課程主要有：社會學概論、社會調查方法、社會統計學、社會心理學、管理學、社會工作導論、個案工作、團體工作、社區工作、社會工作行政、當代中國社會問題、青少年社會工作、基礎醫學概論，臨床醫學概論等。
[就業去向]：適合在高校、行政機構、社會福利部門、社區管理機構、心理健康及教學科研機構和企事業單位。
[修業年限]：四年。
[學位授予]：法學學士。
公共事業管理專業（衛生事業管理方向）
[培養目標]：培養掌握現代化管理學基本理論、基本技能與一般方法，具有公共衛生服務領域專業知識，並能套用這些理論知識從事衛生事業管理工作，具備規劃、協調、組織和決策等多方面能力，可在各級衛生行政部門、醫藥企事業單位、醫療衛生及社區服務機構中承擔管理工作的複合型人才。
[課程設定]：開設主要課程為臨床醫學概論、預防醫學概論、管理學原理、管理心理學、衛生經濟學、衛生法學、衛生事業管理學、衛生統計學、衛生人力資源管理、組織行為學、運籌學、醫學社會學、公共政策學等。
[就業方向]：適合在醫學院校、科研機構從事教學與科研工作；各級衛生行政機關和醫療保健機構、從事衛生管理、社區衛生服務、醫療保險等相關工作。
[修業年限]：四年。
[學位授予]：管理學學士。
