峨嵋佛家醫藥功特彆強調對心性的修煉，功法則以禪修為代表。在對氣功流派進行對比時常有這樣的特點結："儒
《峨嵋佛家醫藥秘功》禪宗
禪宗是中國古代思想家用自己的哲學思想、知行觀解釋佛學的積極結果，所以這一宗派最有中國特色，它也是中國佛教中最寬容、最具藝術氣質的一個派別。 禪宗的修持法門是非常隨意的，因為禪宗和印度佛教的有著重要的區別：禪宗認為覺悟本身並不等於脫離了塵世。認為塵世是天道運行的結果，也是道的一部分，而且是"門門道"。所以禪宗是以積極的態度介入日常事物，提倡在日常的具體事物中參禪，這樣也可以獲得高覺悟。 禪宗的修持分成了南、北兩宗。北宗強調的是"佛塵看淨"的"漸修"，功法主要是打坐息想，起坐拘束其心。南宗則提倡"頓悟"，提倡"心性本淨，佛性本有，覺悟不假外求，不讀經，不禮佛，不立文字"。強調"以無念為宗"、"即心是佛"、"見性成佛"。正因為禪宗具有獨特的佛學觀，禪宗的修持法比較簡單，所以，一般人在老師的啟發下就能夠頓悟。
密宗
也叫"真言宗"，現在國外通稱為"金剛乘"。修持方法是佛家氣功的一個高級部分。根據藏密古典學（藏語音譯為寧瑪學系）的分類，佛家功法層次共分九級。即顯部三級，密部中瑜珈三級，高級瑜珈三級。 密宗的修持方法很多，據說多達一千多種，分為功、法兩大類。功指氣功，法指法術。功的內容包括鍊氣修脈的寶瓶功、三脈四輪、五輪至六輪（四輪為頂、喉、臍，加密輪為五輪、再加髻輪為六輪）、拙火定、大手印等，其中無上瑜珈部還有男女雙修。法術方面包括息災法、增類法、敬愛法、降伏法、釣召法等五大類。 密宗氣功修煉的要領在於"三密相應"。三密相應就是使自己的身、語，意三"業"（即造作，指一切身心活動）和"佛"的身、口、意三密相應。"身密"一般採取"七支坐法"，此法的特點是頷壓結喉，身密還要於結印契（簡稱手印），手印多種多樣，都由老師教授；"口密"即誦真言，真言稱之為"咒陀羅尼"。
