歷史
早期
天主教上海教區南京教區的最後一位主教是義大利傳教士羅伯濟。
江南代牧區時期
1856年，南京教區改為江南代牧區，交給1842年已經來此、1847年在徐家匯建立總部的的耶穌會巴黎省會的法國神父管理，管轄範圍包括江蘇、安徽2省。南京代牧區時期
1921年，分為南京代牧區（主教座堂在上海）和安徽代牧區（主教座堂在蕪湖）。1926年和1931年，再度分出海門教區和徐州教區。上海代牧區時期
1936年，江蘇省剩下的部分分別設立上海代牧區和南京代牧區，上海代牧區管轄長江以南蘇州以東的地區，和長江以北除徐州和南通附近以外的地區（大半個蘇北，但信徒較少）。上海教區初期
1946年，羅馬教廷宣布成立中國聖統制，上海宗座代牧區改設正式的上海教區。龔品梅時期
1949年，從上海教區又分出蘇州教區和揚州、海州兩個監牧區，上海教區和蘇州教區均由中國籍主教管理。1950年，蘇州主教龔品梅兼任上海主教。1951年9月6日，陳哲敏、沈士賢、侯之正，高樂康（LeGrand），趙玉明（Mg.Prevost）5人在上海天主教協進會，莫克勤神父在高隆邦會同日被捕。1953年6月15日夜，朱樹德神父被捕。
教難時期
1955年9月8日夜，上海教區龔品梅主教，以及張希斌、金魯賢、蔡石方、朱洪聲、陳天祥、王仁生、陳雲棠、朱雪帆、劉季澤、傅鶴洲、李度、范忠良等30多名神父被打成龔品梅反革命集團，被捕入獄。1960年3月17日，龔品梅主教等人一起被判刑。同年自選自聖張家樹為上海教區主教，不被教宗承認。主教座堂也遷到徐家匯。1966年文革開始，所有聖堂全部關閉，挪作他用。
現狀
上海教區現有14萬教友，開放的聖堂、堂點超過了100所，市中心各區至少有一至兩所聖堂，外圍的區縣，都各有十幾所聖堂。這些聖堂劃分為六個總鐸區（deanery）。上海教區現有神父70多人。教區掌權人
天主教上海教區1658年8月17日江南建立代牧區，有兩個掌權人：
（1）高多林（IgnaceCotolendi），巴黎外方傳教會會士（1629-1662），法國人，1660年被任命為江南代牧區首任主教，1662年死於印度。
（2）羅文藻（GregoireLopez），第一位國籍司鐸和主教（1610-1691），出生於福安，16歲受洗。入多明我會，1674年1月4日被任命為巴西利亞府南京宗座代牧主教，1690年設立南京主教區時，成為教區第一位主教。
1690年4月10日，應葡萄牙國王的要求，教宗烏爾朋八世提升南京為主教區：
（1）余宜閣（Jean-FrancoisNicolai），方濟會會士，義大利人，1691年至1697年任職，1697年被任命為湖廣宗座代牧。
（2）羅歷山（Alexandre-LouisCiceri），耶穌會會士（1637-1704），義大利人，1689年被任命為日本和中國的巡閱使，自1696年在澳門受任南京主教直至死亡。
（3）林安廉（多）（AntoinedeSilva）耶穌會會士（1654-1726），葡萄牙人，1699年在南京任教區本堂神父，1700年被任命為羅歷山主教的助手，1705年由鐸羅樞機任命為南京主教，由於他簽署了1707年的呼籲書，而被鐸羅主教宣布停職。
——穆若瑟（JosephMonteiro）耶穌會會士（1646-1720），葡萄牙人，1687-1693年由澳門主教任命為福建宗座代牧，1714年任日本副省會長，葡萄牙國王任命他在南京就職，但遭羅馬拒絕。
（4）AntoinePaes-Godigno，葡萄牙人，立即放棄了他的職位（1718年）。
（5）高斯達（EmmanueldeJesus-Marie-Joseph），方濟各會會士，葡萄牙人，1721年5月20日祝聖，同年被驅逐回歐洲。
（6）方主教（FrancoisdeSteRosedeViterbe），方濟各會（1693-1750），葡萄牙人，，1742年11月26日被任命，5年之久以舟為居，巡視整個教區。
（7）南懷仁（Godefroid-XavierdeLaimbeckhoven），耶穌會會士（1707-1787），奧地利人，1752年被任命為南京主教，1787年5月22日去世。
——閔達耐（NathanaelBurger），方濟各會會士，Bavarois人，山西代牧區助理主教。
（8）Eusebe-LucienCarvalhoGomesdaSilva，遣使會會士（1763-1790），葡萄牙人，1789年7月14日被任命為南京主教，1790年5月30日，26歲尚未受祝聖時，死於印度果阿。
——在14年的出缺情況下，由北京主教湯士選（Gouvea）署理教務。
（9）畢學源（GajetanPires-Pereyra），遣使會會士（1763-1838），葡萄牙人，最後一位被任命的南京主教（1806-1838），因為欽天監的工作回到北京，因此他從未到任。
南京教區署理
天主教上海教區（2）趙方濟（FrancoisXavierMaresca），那不勒斯聖家會會士，1848年11月2日，南京神職班獲信得知他來接任視事。1855年4月8日，因病回羅馬，1855年11月2日，在那不勒斯聖家書院逝世。
（3）徐類思（LouisCelestinSpelta），方濟各會會士，1856年接受了南京署理主教的職銜。1856年1月21日，羅馬撤消了南京主教區，改為托於耶穌會會士管理的宗座代牧區，徐主教移駐到湖廣作代牧。
1856年1月21日，羅馬撤消了南京主教區，改為托於耶穌會會士管理的江南代牧區：
（1）年文思（AndreBorgniet），耶穌會會士，1859年5月24日，羅馬詔令，任命他為江南宗座代牧，頂貝里特主教銜，同年10月2日受祝聖於董家渡。1862年7月31日，死於直隸東南教區的張家莊。
——梅德爾（MathurinLemaitre），耶穌會會士，署理代牧，死於1863年5月15日。
——鄂爾壁（JosephGonnet），耶穌會會士，1863年5月3日-1866年5月6日署理代牧。
（2）朗懷仁（AdrienHippolyteLanguillat），耶穌會會士，1864年9月9日，羅馬詔令他從直隸東南教區移駐江南，1865年3月22日他到了上海，1878年11月27日，死於徐家匯。
（3）倪懷綸（ValentinGarnier），耶穌會會士，1879年1月21日受任命為江南宗座代牧，同年4月27日受祝聖，1898年8月14日死於上海。
（4）蘇建章（JeanBaptisteSimon），耶穌會會士，1899年6月25日受任命為江南宗座代牧，在巡視教區時中暑，於同年8月10日死於蕪湖。
（5）姚宗李（ProsperParis）耶穌會會士，1900年4月6日，教宗良十三世任命為江南代牧區主教，同年11月11日祝聖。1921年8月8日，江南代牧區分為江蘇和安徽2個代牧區，繼續在上海擔任江蘇代牧區主教。1922年5月1日，江蘇代牧區再度改稱南京代牧區，1931年5月13日去世。
1946年，中國成立聖統制，上海教區成立，隸屬於南京總主教區。
（1）惠濟良（AugusteHaouisee）耶穌會會士，1928年6月25日，被任命為南京代牧區輔理主教，1931年5月13日，惠濟良接任南京代牧區主教一職。1933年12月13日，教宗將南京代牧區分為南京和上海2個代牧區，惠濟良留在上海，繼續擔任上海代牧區主教。1946年4月11日，成為天主教上海教區首任正權主教。1948年9月10日在上海去世。
——姚贊唐（Y.Henry）耶穌會會士，1915年至1923年任震旦大學校長，1948年接任教區代理。
（2）龔品梅（IgnaceKung），1949年8月9日，被任命為蘇州主教，10月7日接受祝聖，1950年7月15日，調任上海主教，兼蘇州和南京二教區署理，1955年9月8日，龔品梅被捕入獄。1979年6月被秘密冊封為樞機，1988年1月被提前釋放，1991年6月29日，教宗在羅馬授予樞機紅冠，2000年3月12日在美國去世。
（3）范忠良（JosephFan）耶穌會會士，1985年2月27日，被祝聖為助理主教，2000年3月12日，接任上海教區正權主教職位，及南京教區署理主教。
自選自聖的主教：
——張士琅（FrancoisXavierZhang），1956年3月16日被推舉為上海教區代理主教，以取代被捕入獄的龔品梅主教，3月19日舉行就職彌撒並電告傳信部，3月27日羅馬復電拒絕，1964年去世。
（1）張家樹（AloysiusZhang），1960年4月23日由上海教區一批神父教友推舉為上海教區主教，同年4月27日被祝聖為上海教區主教。1988年2月在上海去世。
（2）金魯賢（AloysiusJin）耶穌會會士，1985年，祝聖為上海教區助理主教，1988年成為上海教區主教。教廷只承認他是上海教區助理主教。
教堂
天主教上海教區佘山進教之佑聖母大殿
董家渡聖方濟各沙勿略堂董家渡路185號。中國第一座可容2000餘人的大型天主堂，又是上海教區第一座主教座堂。上海市文物保護單位優秀近代建築。
君王堂原址在長樂路165號，現遷至巨鹿路361號。
洋涇浜聖若瑟堂四川南路36號。可容１千餘人。市級建築保護單位。
唐墓橋露德聖母堂，上海教區繼佘山之後的第二個朝聖地。
重慶南路聖伯多祿堂重慶南路270號。
