目前培養組織細胞和脫落細胞塗片常用的HE染色、特殊染色以及免疫組化染色存在著許多缺點。培養細胞和脫落細胞具有完整的細胞膜，雖經95％乙醇或丙酮固定，其細胞膜上的類脂質常不能充分溶解，影響了染料和抗體的滲透，細胞往往著色不良，結構不夠清晰，免疫組化染色常造成假陰性的結果，有時難以確定陽性或陰性和判斷陽性著色的部位。雖可用TritonX-100進行前處理以增加細胞膜的通透性，但其濃度、時間等不易掌握。用福馬林固定後經梯度乙醇脫水和二甲苯處理的細胞石蠟包埋切片，可避免上述缺點，並且細胞集中、密度高、便於觀察，所有的細胞都可被收集起來，提高了細胞的陽性檢測率。
製作石蠟切片，切片前須將石蠟滲透組織包埋於石蠟中，而水與石蠟又是不相混合的，所以在浸蠟，包埋前必須將組織內所含的水分脫去。而大多數的組織固定劑是水溶液，隨後的水沖洗也使其含有大量水分，因此必須先行脫水，一般是浸入逐級增加濃度的酒精來完成。由於酒精和石蠟不能混合，須再用一種石蠟的溶劑來置換酒精，因大多數石蠟溶劑有使組織的折光率增高並表現為透明或半透明狀，所以此步驟又稱透明。最後用石蠟浸漬組織並鑄製成堅實的蠟塊。
常規的石蠟包埋 過程包括五個基本步驟，即固定，脫水，透明，浸蠟和包埋，前一章中已述過固定。
