中心現設防疫計免科、慢病學衛科、消毒除害科、健康教育科、環境職業衛生科、檢驗科、綜合防治科等7個業務科室。主要業務職能有:傳染病預防與控制的綜合管理;免疫預防;慢性非傳染性疾病的預防與控制;放射衛生與放射病的預防控制;環境衛生、營養衛生及食源性疾病的預防控制;職業衛生與職業病的預防控制;消毒隔離;學校衛生與學生常見病的預防控制;健康教育與健康促進;突發公共衛生事件(傳染病、職業中毒等)的應急處置;社區綜合防治。同時還負責轄區內全科醫生培訓(公共衛生、預防醫學)工作,承擔對食品加工企業及飲用水公司微生物、理化檢驗人員進修。
徐匯區疾病預防控制中心是復旦大學公共衛生學院、上海師範大學環境生命科學院、上海職工醫科大學公共衛生學院、上海第二醫科大學等高等院校的教學基地,承擔學生實習和見習任務。
中心現有辦公場地約1500平方米(含實驗室樓)。現有職工109名,其中專業技術人員98人,占88%;高級職稱14人,占12.8%。
2003年,徐匯區疾病預防控制中心在全市區縣疾控系統率先通過國家認可實驗室評審。
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