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1999年11月，根據“政事分開、上下歸口、精簡高效”的原則，原徐匯區衛生防疫站撤銷，同時組建了徐匯區衛生局衛生監督所和徐匯區疾病預防控制中心兩家單位。徐匯衛監所是徐匯區衛生局行使衛生監督職能的執行機構，辦公地點設在建國西路336弄1號，建築面積約400 平方米，其中辦公用房約300平方米。2010年10月23日，徐匯衛監所整體搬遷到徐匯區公共衛生中心（永川路50號），建築面積約2000平方米，其中辦公用房約1200平方米。徐匯區衛生局衛生監督所是徐匯區衛生局行使衛生監督職能的執行機構，主要工作職責為：依據國家和地方公共衛生法律、法規、規章、標準，按照徐匯區衛生防病、衛生監督工作計畫和有關程式、規範，具體實施傳染病防治、環境衛生、飲水衛生、職業衛生、放射衛生、學校衛生、醫療執業活動等各項監督工作，對違法行為提出行政處罰意見；開展法制宣傳和培訓，做好衛生監督員的管理和考核、衛生監督信息、資料的匯總分析和報告。內設行政辦公室、業務辦公室、場所衛生監督科、醫療機構執業監督科、職業衛生、傳染病監督科、法制稽查科和設計審核科等8個科室，是依法監督醫療服務活動和公共衛生秩序，維護人民民眾健康權益的行政執法部門。
