發展過程及路徑
熱帶風暴“蓮花”路徑機率預報圖2009年6月10日前，一熱帶擾動於帛琉東南方約140公里形成，向西北方移動。但該熱帶擾動中心風力低，移動緩慢，橫跨整個太平洋東南部，並跨過菲律賓進入中國南海。
在橫夸太平洋東南部期間，2009年6月14日，該熱帶擾動曾經增強，日本氣象廳把它升格為熱帶低氣壓，聯合颱風警報中心報告指，熱帶低氣壓當時位於菲律賓馬尼拉東南約520公里。但由於該熱帶低氣壓接近陸地，風力減慢，日本氣象廳把它降格為低壓區，聯合颱風警報中心亦暫時為它作最後報告。
於2009年6月15日及6月16日，該低壓區橫跨菲律賓，為菲律賓帶來惡劣天氣。橫跨菲律賓後，進入中國南海，其後，再度增強，於六月十七日在香港東南偏南約520公里的南海北部上成為熱帶低氣壓,併名為蓮花。蓮花移動緩慢，翌日增強為熱帶風暴。蓮花於六月十九日開始向偏北移動，穿越南海，當晚增強為強烈熱帶風暴。它於六月二十日日間向東北偏北移動，黃昏時達到其強度的頂峰，中心附近最高風速估計達每小時110公里。蓮花於六月二十一日移近中國東南部沿岸，下午減弱為熱帶風暴，黃昏在福建晉江東石鎮附近登入。蓮花於六月二十二日向東北移動掠過福建沿岸地區後進入東海，黃昏時減弱為熱帶低氣壓，翌日在東海進一步減弱為一低壓區,6月23日消散。
影響
菲律賓
受強熱帶風暴“蓮花”影響，廈門海邊風大浪高。CFP著作權作品蓮花為菲律賓中部帶來暴雨，但當時風力程式只是低壓區。
香港
當地懸掛最高風球信號： 一號戒備信號
蓮花是香港在2009年首個需要發出熱帶氣鏇警告信號的熱帶氣鏇。
6月26日初時，蓮花靠近華南沿岸，對本港構成威脅，香港天文台於上午10時40分發出一號戒備信號，當時蓮花位於香港東南約390公里。香港吹微風，主要為西至西北風。蓮花於當日下午二時左右最接近香港，位於香港東南偏東約380公里。香港天文台總部於同日下午5時08分至14分錄得最低瞬時海平面氣壓為999.7百帕斯卡，當時蓮花位於香港東南偏東約400公里。隨著蓮花逐漸遠離本港，天文台於六月二十一日上午5時45分取消所有熱帶氣鏇警告信號。當日早上本港吹輕微至和緩西風。
香港於6月20日天氣炎熱及部分時間有陽光，但黃昏時新界局部地區有驟雨。翌日大致多雲，局部地區有雷雨，梅窩地區錄得超過100毫米的雨量。
澳門
6月21日傍晚，在福建晉江陳埭鎮街頭，一棟建築頂上的大型廣告牌被大風掀落砸中一輛麵包車，幸無人員傷亡。當地懸掛最高風球信號： 一號風球
澳門氣象局於2009年6月20日早上10時30分至翌日早上9時30分發出2009年首個一號戒備訊號 。
台灣
中華民國交通部中央氣象局於2009年6月19日晚上20時30分發出輕度颱風蓮花的海上颱風警報，其時颱風位置在鵝鑾鼻西南方約470公里之海面。6月20日23時30分，發布海上陸上颱風警報，其時颱風位置在澎湖群島西南方約280公里之海面，警戒區域以澎湖、金門地區為主。6月22日8時30分，中央氣象局將颱風蓮花降級為熱帶低氣壓，並解除颱風警報，針對颱風外圍環流發布豪雨特報。台灣最少有五人受傷、一人被溺斃、澎湖及金門島超過3 300戶居民停電。一艘貨輪在台灣南端海域觸礁，全船九人獲救。
6月22日，梅州大埔縣光德鎮砂坪村一民房山體滑坡現場。20日，台南地區因颱風接近，颳起強風吹倒路邊椰子樹，導致一位路人意外死亡。21日另發生兩起路人遭強風吹斷路樹砸傷的意外事故。
中國大陸
根據報章報導，福建有一人失蹤，20多萬人受災、32 000公頃農作物受損、直接經濟損失達3.36億元人民幣。廣東受到蓮花引致的水災影響，有五人死亡，直接經濟損失達3.33億元人民幣。一艘駁船在浙江海域遇險，船上五名船員獲救。而福建沿岸均錄得颶風程度的陣風，烈風程度的持續風速。蓮花晚間20時30分於福建省晉江市東石鎮登入，之後以15公里每小時的速度繼續沿著海岸線擦過。 6月22日傍晚，已減弱為熱帶低壓區的蓮花離開大陸，進入東海。接著蓮花迅速于海面上消散，隨後於20時被各大機構停止編號。
