在20世紀初以前,瓜達盧長腿兀鷹棲息在墨西哥的瓜德羅普。因為瓜達盧長腿兀鷹以往被認為是卡拉卡拉鷹的亞種,故後者有時會被稱為瓜達盧長腿兀鷹。它們於2000年被定為獨立的物種。
早期的觀察者指瓜達盧長腿兀鷹為“惡魔”。它們因牧羊業的獵殺及毒害而滅絕。1876年時,它們在島內仍很普遍。但到了1897年時,就只見到一隻,但相信仍未消失。於1900年,Rollo Beck捕捉了9隻瓜達盧長腿兀鷹作為標本。他可能射殺了島內最後一隻卡拉卡拉鷹。於1903年有多個未確認的報告見到它們,但於1906年就肯定了它們的消失。
瓜達盧長腿兀鷹是其中一種人類克意滅絕的物種。由於它們有時會獵殺幼羊,牧羊業則要求殺絕它們。它們的棲息地被數以萬計的野山羊所破壞,導致了其他物種的滅絕。
已知一種寄生蟲Acutifrons caracarensis與瓜達盧長腿兀鷹一同滅絕。
目前共發現了約35個瓜達盧長腿兀鷹的標本。這些標本分別存放在芝加哥、華盛頓及倫敦。