歷史
湄洲灣秀嶼港區萬噸級雜貨碼頭湄洲灣自宋朝以來就有與南洋群島通商的記載。孫中山在《建國方略》中也有在湄洲灣興建漁業良港的宏偉規劃。1978年，曾在秀嶼建成鹽業專用碼頭一座，由兩艘躉船組成，可供3000噸級船舶停靠，1985年8月後廢置。70年代後期，在沿海港址普查的基礎上，開始研究湄洲灣港的開發建設，國家計畫委員會將湄洲灣開發列入第六個五年計畫，1982年開始建設。
地理位置
湄洲灣港位於惠安、仙遊、莆田三縣交界處，三面環山，灣內島嶼羅列，形成自然屏障，風浪小。港灣內水域面積516平方公里，10米以上深水面積105平方公里。深水岸線21.4公里，主要分布在秀嶼、肖厝、鯉魚尾、羅嶼、東吳、斗尾等處。
港區
秀嶼港區
港區位於莆田市湄洲灣北岸莆頭村和秀嶼之間。1982年10月，開工建設1000噸級煤碼頭和3000噸級雜貨碼頭各1座。煤碼頭為方舟，長66米，另有引堤和堆場1萬平方米，年吞吐能力10萬噸，1984年12月建成，總投資150萬元。雜貨碼頭為高樁梁板結構，泊位長149米，最大靠泊能力為5000噸級貨輪，年吞吐能力30萬噸，1987年11月建成，包括裝卸機械和生產生活建築，總投資1334.5萬元。1990年11月，開工建設萬噸級雜貨碼頭，為大型空心方塊重力式結構，泊位長213米，年吞吐能力35萬噸，包括配套設施，總投資5641萬元，至1992年水工工程已接近完成。第八個五年計畫期間，計畫建設3.5萬噸級煤碼頭，1990年開始前期工作，1992年完成可行性研究報告初審，當年7月由國家計畫委員會委託中國國際工程諮詢公司評估通過。
東吳港區
東吳港（吉了港），古稱雞了港，雞了城，位於湄洲灣中樞，今福建省莆田市東埔鎮東吳村南城自然村南宮前。宋代地名“系蓼”，熙寧四年(1071年)創建，名“系蓼城”，時商貿盛行，海船聚泊城下。明洪武二十年(1387年)為防倭在此設吉了巡檢司，重新修建寨城，周150丈，高1.8丈、厚1丈、建垛308個，警埔8個，開城門，建門樓2座。清初劃界廢毀，現存寨牆一段長116米、寬2.9米、高3.3米。
雞了港與海峽東岸的鹿了港（今台灣鹿港）相對，都是古代的著名港口。雞了港（東吳港）開港於宋代，位於東埔鎮東吳村南城自然村南宮前。明初改稱吉蓼港，曾為吉蓼巡檢司駐地和南日水寨兵船駐紮港；清初沿海截界，居民悉遷涉涵江，港口荒廢，復界後易稱吉了港，港務漸興；民國年間，公路運輸業興起，該港貨運量減少，唯漁船時有與台灣通航；建國後改稱東吳港。
肖厝港區
肖厝港位於湄洲灣內澳西南岸，地理位置為東經118°5836，北緯25°1208。素有“中國少有，世界不多”天然良港的美稱。1985年12月，開始在肖厝沙格建造1萬噸級雜貨碼頭。1990年2月，建造10萬噸級石油專用碼頭，至年底已有堆場1.5萬平方米、倉庫6800平方米，年吞吐量5.30萬噸(不包括石油專用碼頭吞吐量)。1995年12月經國務院批准為國家一類口岸。1999年12月通過國家驗收正式對外開放(其中油碼頭於1992年對外開放)。肖厝港港闊、水深、浪小，港區主航道水深10—20米，5萬噸級船舶可自由進出。肖厝港現有碼頭泊位7個，其中10萬噸級油碼頭1座，萬噸級雜貨碼頭1座，5000噸，3000噸，1000噸成品油碼頭各1座。5萬噸貨櫃碼頭1座，年設計吞吐能力為1340萬噸。2002年港口吞吐量約為646．57萬噸，其中外貿吞吐量約為428．0萬噸。肖厝港所在的泉港區是福建省石化基地，也是國家規劃建設的6大石化基地和四大國際中轉港口之一。
斗尾港區
斗尾港口經濟區位於湄洲灣南岸泉州市惠安縣東北部，規劃面積約173平方公里，以東周半島為主，包括淨峰、東嶺、東橋、輞川、塗寨、小乍六個鄉鎮部分區域。港區擁有的深水良港—斗尾港在1990年初被交通部規劃為全國四大中轉港之一。斗尾港介於北緯24°56′15″—25°05′06″和東經118°51′38″—119°02′05″之間，東臨台灣海峽，距30萬噸級主航道2海里，處於上海和廣州兩大港中間地帶。福建省政府將該區域作為船舶和石化產業布局的龍頭地區納入發展規劃，泉州市政府將其確定為四大經濟區域之首，是未來大泉州北翼重化工業的重要組成部分。
吞併泉州港
2008年8月，福建省委常委會和省長辦公會議研究通過《湄洲灣港口體制一體化建議方案》，湄洲灣港口體制一體化改革進程就此啟動。2009年6月4日，省委編辦正式批覆設立福建省湄洲灣港口管理局。同年《人民日報》的一篇文章就指出，《福建省港口體制一體化整合總體方案》當年正式出台。海峽西岸沿海將建起三大港口群——北部的福州港，中部的湄洲灣港，南部的廈門港，方案對各港口的腹地使用進行了明確劃分，其中，湄洲灣港腹地範圍主要覆蓋泉州、莆田、三明。
2009年8月2日，省交通廳發布公告稱：從8月3日起，福建省湄洲灣內泉州市港口管理局所轄的肖厝、斗尾港區，與莆田市港口管理局所轄的秀嶼、東吳港區合併組成新的湄洲灣港，成立福建省湄洲灣港口管理局。新組成的湄洲灣港各港區對外統稱為湄洲灣秀嶼港區、湄洲灣東吳港區、湄洲灣肖厝港區、湄洲灣斗尾港區。
2012年3月31日，福建省交通運輸廳發布公告稱，省政府正式批覆《深化湄洲灣港口管理體制一體化改革方案》，自今天起，原湄洲灣港的四個港區（肖厝港區、斗尾港區、秀嶼港區、東吳港區）、泉州港的三個港區（泉州灣港區、深滬灣港區、圍頭灣港區）以及莆田港的興化灣港區，合併組成湄洲灣港。
