歷史
大清帝國海軍軍旗中國自古即有專師水面作戰的水師，其中有各種不同功能的船艦如補給艦、運兵艦、補水船等，並有專師各種江湖或近海、遠海作戰的戰艦。然而，真正具規模的近代化海軍則源自清朝後期。
大清海軍時期
自強運動時期 在第二次鴉片戰爭時，英法海軍以65艘蒸汽鐵甲戰艦對清廷水師300艘以上的舊式木船。清軍除了海岸炮台稍能發揮拒敵的功用外，舊式水師在海戰中完全無用。清廷理解到目前的木造船艦與船艦技術比西方各國還要落後許多，所以在自強運動（洋務運動）中計畫建立新式海軍。在太平天國之亂時，因為太平軍將自美國購買新式炮船，所以清廷緊急自英國購買戰艦，成立阿思本艦隊（英中聯合艦隊）。然而，由於艦隊司令和清政府對指揮權、用人及花費等各方面皆出現嚴重分歧，最終解散艦隊。
北洋艦隊提督旗在自強運動時期，曾國藩及左宗棠等人創意籌備建立新式海軍，並成立江南製造局及福州船政局來建造新式海軍。沈葆楨更積極成立海軍學校船政學堂來培育海軍人才，該校畢業生不少成為北洋艦隊的高級將領。在當時，大清海軍已成立福建水師、廣東水師以防禦南海。為了建設新式海軍，大清海軍計畫分為三個艦隊：北洋艦隊負責山東及以北之黃海、南洋艦隊負責山東以南及長江以外之東海，廣東水師則負責福建及南海。後來由於同時建立北洋及南洋艦隊使經費不足，所以先將重點放在守衛京師的北洋艦隊。這使得南洋艦隊的軍力不如北洋艦隊。
定遠艦南北洋艦隊時期 大清帝國建立的海軍是世界前六強的，其中北洋艦隊的“定遠”“鎮遠”鐵甲艦更是號稱“遠東巨艦”，是當時遠東噸位最大、火力最強的艦隻。但在經歷中法戰爭及甲午戰爭後，南洋艦隊與北洋艦隊陸續崩潰。主因是清廷沒有持續更新海軍軍艦及裝備，經費反而挪用至修建頤和園，導致大清海軍輸給法國、日本的新式艦隊。當時的海軍人才在思想與素養也未足，戰術運用不如日本、法國。而後，清廷將剩餘海軍改編為巡洋艦隊及長江艦隊。至辛亥革命為止，清廷皆努力重建海軍。一直到中華民國立國後，海軍的發展進入停滯不進的狀態。
中華民國海軍時期
護法艦隊的士兵軍閥混戰時期。中華民國建立後，由於經費不足、軍閥混戰，加上列強的武器禁運政策，使得中華民國海軍發展進入停滯期。直到北伐完成後，於十年建設期間，海軍才有較大規模的建艦計畫。期間由於中華民國參與第一次世界大戰成為勝利國，使得當時海軍獲得第一批戰利艦。 護法艦隊、東北艦隊
中央海軍時期。早在中華民國建立時，為了持續發展海軍，而成立海軍署。1928年北伐勝利後，中央政府將海軍署擴建為海軍部，共有軍務、艦政、軍械、海政、軍學、經理等六部，並開始培養海軍。初期艦隊約44艘，排水量3萬餘頓；至抗戰前夕，艦隊增至58艘，5萬餘噸。
當年停泊在香港的“重慶號”巡洋艦 後來參加起義抗戰及內戰時期。抗日戰爭爆發後，為了節省經費，中央政府將海軍部降為海軍總司令部。而後海軍在日本艦隊攻勢下損失慘重，海岸線的喪失使得海軍僅剩少量炮艦在內河與內湖布雷，阻撓日軍利用河道將船艦、軍隊及補給深入中國內部。抗戰勝利後，中華民國海軍接收日本降艦數十艘，美國也贈與登入艦20餘艘、護衛艦數艘，使得海軍得以重建。而後爆發國共內戰，部份海軍撤出長江，另有大量海軍人員因不認同國民政府因而脫離中華民國海軍加入中國共產黨。1950年政府撤往台灣後，海軍艦隊在多次海戰失利下也分別由舟山群島、海南島撤退，以集中防衛台灣。
戰後時期。1952年，中華民國海軍進行改編，成立驅逐、巡防、掃雷、登入、後勤等艦隊。由於台灣四面環海，海軍日益重要；所以陸續自美國接收退役軍艦，擴充艦隊，並更新武器系統。現今海軍朝向二代兵力發展，以保衛國家安全。
海軍軍徽涵義
組織結構
中華民國海軍司令部
內部單位
中華民國海軍軍旗（中華民國國旗）政治作戰部
2、督察室
3、人事軍務處（合併人事署及軍務署，以下皆原稱“署”）
4、軍事情報處（原情報署）
5、戰備訓練處（原作戰署）
6、後勤處（原後勤署）
7、計畫處（原計畫署）
8、戰鬥系統處
9、主計處
艦隊指揮部
拉法葉級巡防艦1、124艦隊：左營港
2、131艦隊：基隆港
3、146艦隊：馬公港
4、168艦隊：蘇澳港
5、192艦隊：左營港
6、151艦隊（兩棲艦隊）：左營港
7、256戰隊（潛艦戰隊）：左營港（無256艦隊編制）
8、261戰隊：蘇澳港（無261艦隊編制）
9、海蛟大隊
10、海鋒大隊
航空指揮部
桃園基地指揮部
反潛大隊
海軍陸戰隊指揮部
海軍陸戰隊徽標1、陸戰六六旅
2、陸戰九九旅
3、陸戰七七旅
4、兩棲偵搜大隊
5、灘岸勤務大隊
6、通資電大隊
7、登入戰車大隊
8、補保大隊
9、三軍聯合作戰訓練基地指揮部
10、烏丘守備大隊
教育訓練暨準則發展指揮部
海軍技術學校
台灣海軍陸戰隊兩棲偵搜大隊兩棲專長班海軍新兵訓練中心
海軍陸戰隊學校
直屬單位
保修指揮部
海軍軍官學校
海軍造船發展中心
通信系統指揮部
大氣海洋局
勤務指揮部
照相情報隊
後勤支援指揮部（左營、蘇澳、馬公、基隆）
戰鬥系統工廠
南區人才招募中心
海軍之軍階、帽徽、官科識別
| 中華民國海軍帽徽 |  中華民國海軍帽徽 |
| 中華民國海軍軍官科識別章 |  中華民國海軍軍官科識別章 |
| 中華民國海軍軍官科識別章 |  中華民國海軍軍官科識別章 |
| 中華民國海軍階級袖章 |  中華民國海軍階級袖章 |
| 中華民國海軍階級袖章 |  中華民國海軍階級袖章 |
| 中華民國海軍階級袖章 |  中華民國海軍階級袖章 |
| 中華民國海軍階級袖章 |  中華民國海軍階級袖章 |
海軍兵科
蘇澳港全景，圖中右側可以見到南方澳大橋戰鬥軍官兵科：海軍艦艇指揮官、海軍陸戰隊、政戰
戰鬥勤務軍官兵科：航空
技術勤務軍官兵科：補給、軍醫、工程、電信、測量、行政、軍法、主計、
士官兵科：雷達、水雷、魚雷、航海、氣象、信號、聲納、鍋爐、政戰、航空、軍樂、損管、帆纜、炮械、飛彈、電機、電子、補給、文書、機械、食勤、駕駛、射控、電信、油水、油機、汽機、譯電、槍帆、醫務、陸戰隊
備註：士官長的兵科跟軍官的一樣
主要武器裝備
海軍主要武器裝備以主作戰艦、輔戰艦艇、潛艦、陸戰（海軍陸戰隊）、空中等“核心戰力”為主。
主要靠泊港口
| 名稱 | 位置 |
| 左營港 | 左營軍港，在海軍左營基地內 |
| 馬公港 | 測天島軍港，在海軍馬公基地內 |
| 基隆港 | 東五碼頭為主，財政部基隆關稅局附近碼頭為輔 |
| 蘇澳港 | 中正軍港，在海軍中正基地內 |
| 高雄港 | 新濱碼頭，在海軍新濱營區內與旗津碼頭位在旗津區 |
註：除左營港為軍艦專用港外，其餘皆為軍民共用港。
歷任海軍（總）司令
中華民國（國民政府時期）海軍部長、海軍總司令
1945年12月31日海軍總司令部解散，改設海軍處，處長陳誠兼任。1946年7月海軍處再次擴編為海軍總司令部，總司令仍由陳誠兼任。
中華民國海軍（總）司令
| 歷任 | 任期時間 | 司令姓名 | 歷任 | 任期時間 | 司令姓名 |
| 第一任 | 1946年7月1日－1948年8月25日 | 陳誠上將 | 第十一任 | 1988年6月1日－1992年5月1日 | 葉昌桐上將 |
| 第二任 | 1948年8月25日－1952年4月15日 | 桂永清上將 | 第十二任 | 1992年5月1日－1994年4月16日 | 莊銘耀上將 |
| 第三任 | 1952年4月16日－1954年7月1日 | 馬紀壯上將 | 第十三任 | 1994年4月16日－1997年4月16日 | 顧崇廉上將 |
| 第四任 | 1954年7月1日－1959年2月1日 | 梁序昭上將 | 第十四任 | 1997年4月16日－1999年2月1日 | 伍世文上將 |
| 第五任 | 1959年2月1日－1965年1月25日 | 黎玉璽上將 | 第十五任 | 1999年2月1日－2002年2月1日 | 李傑上將 |
| 第六任 | 1965年1月25日－1965年8月16日 | 劉廣凱上將 | 第十六任 | 2002年2月1日－2005年2月1日 | 苗永慶上將 |
| 第七任 | 1965年8月16日－1970年7月1日 | 馮啟聰上將 | 第十七任 | 2005年2月1日－2006年3月1日 | 陳邦治上將1 |
| 第八任 | 1970年7月1日－1976年7月1日 | 宋長志上將 | 第十八任 | 2006年3月1日－2007年5月21日 | 林鎮夷上將2 |
| 第九任 | 1976年7月2日－1983年5月15日 | 鄒堅上將 | 第十九任 | 2007年5月21日－2009年5月21日 | 王立申上將 |
| 第十任 | 1983年5月16日－1988年6月1日 | 劉和謙上將 | 第二十任 | 2009年5月21日－至今 | 高廣圻上將 |
註：1 陳邦治 2006年1月1日起，海軍總司令調整為“海軍司令”
2 林鎮夷 轉任國防部副部長
海軍軍歌
中華民國海軍軍徽我們是中華民國的新海軍，我們是三民主義的新海軍，
信仰堅定，紀律嚴明，操縱新時代之戰艦，使用最堅利之甲兵，
雄視三洋，屏障四海，保衛疆土，鞏固和平，
同舟共濟，萬眾一心，養成忠勇冒險之好習慣，同舟共濟，萬眾一心，創造海洋生活之新精神，
新海軍，新海軍，
乘長風破萬里浪，
為青天白日旗爭光榮，
為青天白日旗爭光榮！
