歷任領導
第一任所長 許孔時研究員 1985年2月至1994年7月，
第二任所長馮玉琳研究員 1994年7月至2002年7月，
現任所長 李明樹研究員 2002年8月至今
歷史
中國科學院軟體研究所，是一個以計算機科學理論和套用研究為基礎、以計算機軟體研究開發和高新技術的產業建設為主導的綜合性基地型研究所。目前，軟體所的科研體系分為軟體基礎研究、軟體高技術研究和軟體套用研究三大部分，設有十幾個研發部門（實驗室、中心）。
中國中文信息學會、中國軟體行業協會數學軟體分會、中國軟體行業協會UNIX用戶分會、中國計算機用戶協會IBM分會等掛靠在研究所；研究所主辦的學術刊物有《軟體學報》、《中文信息學報》和《計算機系統套用》。
建所近二十年來，特別是進入中國科學院知識創新試點工程以來，軟體所在計算機科學和軟體領域取得了豐碩成果，獲院、部級以上成果獎23項（全部為第一完成單位），其中包括國家自然科學獎一等獎1項、二等獎2項、三等獎1項；國家科技進步獎二等獎4項、三等獎2項。尤為值得一提的是，自國家自然科學獎設立至今，計算機領域唯一的1項一等獎和5項二等獎中的2項，都出在軟體所。
現狀
進入21世紀，以網際網路為代表的信息技術與知識經濟的迅猛發展，使軟體技術和軟體產業成為國民經濟與社會發展的核心與主導，也為軟體所新的跨越提供了歷史性的發展機遇。在新的形勢下，軟體所的定位是：面向軟體技術未來，從事計算機科學理論研究和軟體高新技術發展的綜合性國立研究所。為此，軟體所人將繼續發揮"創新求實，永競一流"的精神，貫徹"以人為本，創新跨越，競爭合作，持續發展"的新的科技發展觀，匯聚科技精英，建設以著名科學家為核心的科研團隊，努力形成國立研究機構創新文化氛圍。按照新的辦院方針，面向國家戰略需求和世界科學前沿，開展關係到國家經濟發展、國防建設與社會進步的基礎性、戰略性、前瞻性軟體理論與高新技術創新研究；承擔國家重大軟體科技項目和重大信息化工程中的關鍵技術研究開發工作，解決國家急需的重大軟體技術問題；提高我國軟體技術自主創新能力，不斷促進軟體產業發展；通過技術轉移、人才培養和文化傳播，為我國科技事業和社會發展不斷做出重大創新貢獻。
希望通過不懈的努力，軟體所能在不遠的將來，整體上達到國際先進水平，成為對世界科學技術發展有重要貢獻的一流科研機構。
