編制
其為志願軍組織，參加與否純屬自願性質，一般來說除非身居要職或有特別才能，否則在沒有要務在身的情況下，去留亦不會有所障礙。只是因為P.L.A.N.T.人民在血色情人節的刺激及陰影下，仍有大量熱血之士尤其青年人踴躍參軍，當然同時亦不乏勞·魯·克魯澤、米哈爾·寇斯特及亞修·葛雷一類的戰爭狂或戰爭愛好者。
在軍制上，基於志願軍性質，以及兵員相對少量下編制不便太明確，因此只設軍職而不設軍銜，同時采小隊制，多半以隊長的姓氏命名。
ZAFT標誌軍事力量
在人員數量上不及地球聯合軍，但擁有大量的MS，與以MA為主要作戰單位的地球聯合占有絕對的技術優勢。故而自“血色情人節”以來戰爭一直處於膠著狀態。但地球聯合軍最終推出“G計畫”，並在C.E.71年製造成功，並於同年實現量產。
克魯澤部隊
勞·魯·克魯澤為隊長，在機動戰士高達 SEED中初期奪取G計畫新型高達的隊伍，本隊機動戰士高達 SEED後結果不明。
薩拉小隊
阿斯蘭·薩拉為隊長，由勞·魯·克魯澤任命。隊員有伊扎克·玖爾、迪亞卡·艾爾斯曼和尼哥爾·阿瑪菲。
成立時間由勞·魯·克魯澤任命，至後來阿斯蘭·薩拉與基拉·大和自爆結束後。
玖爾部隊
伊扎克·玖爾為隊長，在薩拉隊之後伊薩克回到Z.A.F.T.領導新進人員，並在雅金·杜威攻防戰之中有傑出表現。因此在機動戰士高達SEED DESTINY時，被升為玖爾部隊的隊長。
寇斯特部隊
米哈爾·寇斯特為隊長的特種部隊，於奪還被希捷爾·克萊恩及民間廢物商串謀從Z.A.F.T.偷運走YMF-X000A/H Dreadnought及其身上的中子干擾調解器（當時仍未被大西洋聯邦取得）的秘密任務中，遭歐亞聯邦所屬的特務部隊X突襲，除隊長米哈爾·寇斯特所配備的ZGMF-1017M GINN High Maneuver Type以外全軍復沒。
其後第二次雅金·杜威攻防戰中大量ZGMF-1017M GINN High Maneuver Type及精英份子被重編入寇斯特部隊旗下，但在和地球聯合軍的交戰中亦全員被毀，而米哈爾·寇斯特雖然奇蹟生還，但他沒有再以戰鬥員身份而是以軍醫身份（米哈爾·寇斯特於戰前為醫生）回到Z.A.F.T.，寇斯特部隊則沒有被延續。
葛雷部隊
亞修·葛雷為隊長的秘密特種部隊，直屬於當時的議長帕特利克·薩拉，專責創世的試驗型創世紀Alpha的防衛，被配備ZGMF-X11A Regenerate及ZGMF-X12A Testament。亞修·葛雷及其ZGMF-X11A Regenerate亦經常被委派秘密任務出勤，可是亦因此，ZGMF-X12A Testament於亞修·葛雷一次駕駛Regenerate出勤的時間，被地球連合軍特務情報部看準時機所奪。
最後受到顧忌創世紀Alpha威力的民間勢力聯軍攻擊戰敗，亞修·葛雷則於Regenerate的失控加速下，加速到地球聯合軍的宇宙勢力範圍而連同殘破的Regenerate被俘。
勢力分布
主要在L5P.L.A.N.T大本營，但在直布羅陀與澳大利亞的卡奔塔利亞也有基地，基本上Z.A.F.T.的主力都在太空中，太空中的基地有SEED中的波亞茲和雅金·杜維，以及SEED Destiny中的彌賽亞，不過分別在SEED和SEED Destiny的最終戰時被摧毀。
波亞茲（Boaz）為扎夫特軍兩座主要軍事要塞的其中一座，其名稱來自舊約聖經中所羅門王所建造之聖殿中，殿前所豎立的兩根銅柱的其中一根。其意義為“神必堅立”。在SEED中為地球聯合軍之維護和平者隊以核彈擊破。
雅金·杜威（Yakin Due）為扎夫特軍兩座主要軍事要塞的其中一座，其名稱來自舊約聖經中所羅門王所建造之聖殿中，殿前所豎立的兩根銅柱的第二根柱子，（Due為“第二”之意。）其意義為“在神里有力量”。在SEED的第二次雅金·杜威攻防戰中被破壞。
軍紀
Z.A.F.T.由於其志願軍性質，管制不嚴，加上調整者社會個人主義的高昂，因此一般被認為個人主義及軍紀鬆散，而上述特質亦展現於劇中及多部外傳中。
但同時又基於其去留大多不受阻的關係，除了個別情況，幾乎沒有逃兵問題。
