二月
2月7日，總兵官左良玉，總督陝西三邊侍郎鄭崇儉等大敗張獻忠於太平縣之瑪瑙山。當時義軍分為三路，西路張獻忠據楚蜀界、東路革里眼、南路曹威、過天星等。
三月
3月7日，崇禎帝下詔罷各鎮內臣。告諭道：“各鎮內員，察飭已久。兵馬、錢糧、器械等項，稍有改觀，但戰守防援，事權未能盡一。遂將總監、分守等內臣俱撤回京另用，凡邊務一切錢糧、兵馬、邊防、剿御等事，著督、府、鎮、道一意肩承。
3月14日，戶科給事中左懋第疏陳四弊：民困、兵弱、臣工委頓、國計虛耗等。又請嚴禁將士剽掠、請散米錢，賑濟饑民。崇禎帝採納其言，詔令上災七十五州縣所舊練三並停，中災六十八州縣止征練餉，下災二十八州縣等到秋後征餉，並令清理刑獄。
四月
4月，為籌措軍費，鎮壓蘇格蘭起義，查理一世被迫召開中斷了11年之久的議會
4月15日，崇禎帝告諭吏部臣：年來資格畛域，抑壞人才。考選屢奉旨舉貢兼收，究竟不遵，非祖宗破格用人至意。就教貢士並試過歲貢生共二百六十三人，俱著於六部司屬、都察院、通政司、太常寺各司屬及推知正官通行察缺，依次填補。此系特用，後不為例。
五月
5月，巴塞隆納爆發了起義；為了鎮壓這次起義，葡萄牙的貴族們都收到了動員令，讓他們去加泰羅尼亞參戰。
5月13日，蘇、松、湖等府的吳江、歸安等地晝夜傾盆大雨，水勢驟發，霎時洶湧，不分堤岸，屋宇傾倒。而米價騰踴，斗米至銀三四錢，富家多閉糶，民食草木根皮俱盡，拋妻子死者相枕。強橫之徒三五成群，鼓譟就食，街坊罷市，鄉村閉戶人情洶洶。
5月16日，崇禎帝告諭戶部、都察院：近來直省告飢，而畿輔、山東、河南、山西、陝西，又有百姓茹土食菜，並無菜色，且剜肉爨骨，殣以澤量，言之墮淚。
六月
6月29日，崇禎帝詔輯《武經七書大全》，命大學士范復粹為總裁，禮部右侍郎黃錦、少詹事李紹賢為副總裁，右贊善胡世安、修撰劉理順、編修方拱乾等為纂修官，開館編輯。
七月
7月，張獻忠西走牡羊山與羅汝才會合。此時曹威、過天星欲渡江，為明官兵所阻。張獻忠至，與之會合。
7月14日，羅汝才與明總兵孫應元等戰於興山之豐邑坪，被官軍斬二千三百餘級，俘五百餘人。羅汝才率其眾逸走巫山，與張獻忠隊伍會合。
八月
8月，楊嗣昌出師入蜀，其時監軍萬元吉先入蜀，令蜀將把守巴、巫等險要之地。
九月
9月，李自成從鄖、均進入河南。起初李自成被圍於魚腹山中（四川奉節縣東），時義軍中人多出降於官軍，李自成欲自盡，為養子雙喜勸止。李自成部下劉宗敏殺己妻對李自成說，要誓死從君。軍中壯士聞之，也多殺妻子誓從李自成。李自成乃盡焚輜重，輕騎入河南。
9月6日，明軍兵敗於觀音岩。當時萬元吉駐守巫山，邵捷春駐於大昌，互相聲援。
9月8日，湯若望將修好的舊琴連同另一件外國進獻的樂器一起獻給了崇禎皇帝。
十一月
11月，楊嗣昌率軍進重慶。監軍萬元吉擢前總兵猛如虎為正總統，張應元為副，率軍趨綿州，分派諸將把守要害之處，元吉自小路至射洪，在蓬溪處以待義軍。義軍分駐安岳界，偵知官軍至，乃退至內江，如虎追之，元吉、應元則在安岳城下扼守。
十二月
12月，下詔增天下關稅。崇禎初年，關稅每兩增一錢，崇文門、河西務、臨清、九江、滸墅、揚州、北新、淮安八關，增五萬兩。不久，又增二錢。戶部尚書畢自嚴，議“增南京宣課司稅額一萬為三萬”，南京戶部尚書鄭三俊以“宣課所收落地稅無幾，請稅蕪湖以抵增數”，自嚴乃上疏議“稅蕪湖三萬，而宣課仍增一萬”。後乃以度支日絀，增加關稅二十萬兩，而商人百姓日益窮困。
出生
6月6日，《聊齋志異》作者蒲松齡誕辰。
逝世
蔡國用逝世：蔡國用（？－1640），字正甫，江西金溪人。萬曆三十八年（1610）進士，由中書舍擢御史。歷大理寺丞、少卿，天啟五年（1625），因忤魏忠賢意，勒令閒住。崇禎元年（1628）起故官，屢遷工部右侍郎，崇禎十一年升禮部尚書兼東閣大學士入閣。十二年六月，以邊功，進太子太保、戶部尚書、文淵閣大學士。十一月以敘守城功，進吏部尚書武英殿大學士，十三年六月二十日卒於官，贈太保，諡文恪。國用入閣三載，居位清謹，碌碌無所建樹。
2月，穆拉德四世(Murad IV，1612～1640) 奧斯曼帝國第十七任素丹，因酗酒過度而死。
雜譚逸事
李自成雕像李信投歸李自成
：李信為杞縣舉人，故尚書精白之子。崇禎十三年（1640）十二月投歸李自成。李信因父列名逆案，欲洗刷其罪，曾出米千石救濟饑民，民稱之為“李公子”。時紅娘子反，擄信。信逃歸，自首於官府，官囚之。紅娘子與饑民共劫獄，殺知縣而返，並挾李信投歸李自成。李自成改信名曰岩。李自成提出“殺一人如殺我父，淫一人如淫我母”，李岩編有“迎聞王，不納糧”的歌謠，並提出“均田免糧”等口號。使義軍軍紀肅然。義軍迅速發展壯大。牛金星投歸李自成：牛金星為盧氏舉人，以磨勘被斥，私自入李自成軍作主謀，後潛歸，事發後坐罪當斬。已而，從輕發落。遂於崇禎十三年（1640）十二月投歸李自成。
宋獻策投歸李自成：崇禎十三年（1640）十二月，宋獻策由牛金星所薦，投歸李自成。宋獻策善卜，上讖給李自成，上書“十八子，主神器”自成大喜。
