概論
我國古代醫學家，在長期醫療實踐的基礎上，將陰陽五行學說廣泛地運用於醫學領域，用以說明人類生命起源，生理現象，病理變化，指導著臨床的診斷和防治，成為中醫理論的重要組成部分，對中醫學理論體系的形成和發展，起著極為深刻的影響。
關於陰陽五行理論最科學的解讀
陰陽五行學說是我國古代哲學思想的結晶，這一不朽的結晶不但不隨歲月的流逝、科學的突飛猛進淡出人們的視線，相反她的不曾被人們完全理解的深奧的哲理、隨著認識的升華越來越彰顯在我們面前，讓我們意識到，她非但不是某些人無情扣上的的樸素認識論，反倒是現代思維哲學的集大成，不由得讓我們萌發出辯證法的三大規律的真正發源地恰恰是我們中國，功於我們偉大的中華民族祖先的感嘆！
陰陽五行學說主要由陰陽五行與五運六氣兩個相對不同邏輯範疇的概念與關係所組成，其與現代哲學的關係，簡單的說屬於系統的理論邏輯與邏輯認識方法的關係。換一句話來說，現代哲學的基本觀點和原理其實都是在證明或闡述陰陽五行學說的科學性。如果沒有陰陽五行理論的系統邏輯，那么，現代哲學闡述的基本觀點和原理就是一盤散沙。比如說，現代哲學其實就是以矛盾為立論基礎，對立統一規律、質量互變規律、否定之否定規律為其具體鋪墊的思維方法，也是客觀世界普遍遵循的規律。有道是，任何理論都是抽象的，若未採取特定的思維藝術或與具體事物結合之前，不但不能具備具體的含義，而且也無法形成完整嚴密的思維體系。所以，儘管現代哲學在所有單個的認識層面很深入也較全面，但其畢竟未能採用陰陽五行學說那樣的思維藝術，所以，它的不同認識層面就無法有機的銜接，形成一種反映事物在一定的存在形式中、能在時空上一脈相承的動態變化的思維體系。而這一切恰恰陰陽五行學說出乎人們預料的做到了，且已經達到了無可復加接近絕對真理的程度。那么，陰陽五行學說採用的特定思維藝術又是什麼呢？我們就順著陰陽五行學說的思維邏輯，在劉玉珍老師《陰陽系統論》和《中醫生理病理系統論》的學術思想的引導下通過下面的簡答細細來品味吧？
2、什麼叫陰陽？
答；要把陰陽概念解釋清楚我們必將要懂得認識的基本方法，如果我們把感性認識層面、理性認識層面、理性具體認識層面-------這些不同邏輯範疇的概念混淆在一起，如一時上為陽、下為陰。外為陽、內為陰，一時又熱為陽、寒為陰，氣為陽，血為陰，從表面上看仿佛都是對的，實質上在自己的意識中依然是一個模糊不清的概念，這也是傳統上把陰陽五行理論引向樸素認識論誤區的根本原因所在。所以在這裡我們首先要明確，陰陽五行學說中的陰陽概念屬於理性認識範疇的概念，是陰陽五行學說立論的基礎。在這個確定的認識層面簡單地說，陰陽就是一種定性的矛盾分類方法。如天為陽、地為陰，男為陽、女為陰，氣為陽、血為陰等等就屬於對陰陽的具體定性表達（即理性具體認識範疇的哪方為陽，哪方為陰的具體表達，且在具體運用中雙方的屬性不能任意的顛倒或混淆。否則就將帶來認識的失誤）。所以，理性認識範疇的陰陽概念與矛盾概念一樣，自身沒有具體的含義，只有利用它分析和認識具體事物時，它的意義才有可能隨著我們對事物在實踐中的認識而彰顯出來-----這個過程也就是理論又回到實踐的過程。
3、什麼叫五行？其基本含義是什麼？
答：木火土金水五種物象表達的相生相剋關係就簡稱為五行。五行的基本含義是指無論是事物內部或不同事物之間，都可歸納成一種“對我有害、對我有利及其我對其有利、我對其有害”的矛盾利害關係的基本模式。把這個模式中的我抽提出來，並用土的物象來表達，那么對土有害的物象就是木，對土有利的物象就是火，土對其有利的物象就是金，土對其有害的物象就是水。不難得知，有利或有害其實就是相生相剋的同義語。在現實中與這種矛盾利害關係模式無關的利害關係都是不存在的，所以五行所表達的生克制化模式屬於萬事萬物內部及其不同事物之間矛盾利害關係的基本模式。據此我們不難理解傳統上所謂五行是一種分類方法，或五行就是指木火土金水五種物質的運動一類的解讀為什麼是一種樸素的認識方法的所以然了。
4、陰陽與五行是什麼關係？
答：陰陽屬於陰陽五行學說立論的基礎。陰陽與五行屬於形式與內容的關係。就是指無論陰的內部或陽的內部包括陰陽之間都具備著木火土金水五種物象表達的那種生克利害的基本關係。換句話來說，即陰陽的內容是通過木火土金水物象反映出來的，五行屬於陰陽內容的存在形式。如宇宙雖然無邊無際，但在地球這個視角其相互對立的兩個方面就是天地，天地的空間就是通過東南中西北顯示出來的。中醫學認為氣血是構成人體的基本生理物質，那么，氣血在生理活動中又是通過什麼方式體現出來的呢？只要我們具備這樣的理論思維，這些過去在中醫學中還未曾明確提出過的問題，在現有的中醫理論中就能找到明確的答案（具體見劉玉珍老師《中醫生理病理系統論》相關論述）。理論是實踐的嚮導這句話絕對是真理。同時也能彰顯出劉玉珍老師在發明了四柱太陽律、月亮律的基礎上又能開創出六柱預測學，開闢利用中醫藥調控人體節律達到趨利避害的新領域系列成果的取得都不是偶然的，而是在於劉玉珍老師雄厚的傳統文化功底，比他人最先掌握我們中華民族祖先把矛盾利害關係模式用木火土金水予以物化的特定思維藝術，破解了陰陽五行的千古之謎，真正把握其真諦。
我們中華民族祖先在陰陽五行學說中採用的邏輯物化思維藝術，不僅在人類的認識史上空前絕後，具有無可復加接近絕對真理的水準，而且所借用的物化也相當貼切，幾乎可以以假亂真。之所以如此，對數千年來人們為什麼一直只是在她的物化之物上做文章也就不難理解了。
5、陰陽五行與十天干是什麼關係？
答：簡單地說，屬於抽象的概念與具體表達方式的關係。由於陰陽五行屬於抽象的概念，所以只有將其陽的具體存在方式和陰的具體存在方式加以物化時，才能具體的表達出來，其就是甲乙丙丁戊己庚辛壬癸十天干。所以十天干其實就是對陰陽在木火土金水空間的具體物化方式。（還有五運範疇的十天干之含義這裡就不介紹了。
6、十二地支的基本含義是什麼？
答：子醜寅卯辰巳午未申酉戌亥即十二地支，簡單地說，就是指事物內部陰陽兩個方面、各自對其內在的矛盾因素、通過自我肯定和否定而形成的氣化內容的物化表達（關於氣化提醒一下；不要只停留在“字”的本義上，而是要納入事物“通過自我肯定和否定而形成的氣化”層面）。為了把這個問題說清楚，我們還有必要對矛盾的基本概念有所了解。我們知道，無論任何事物或現象若要構成一個矛盾的統一體，除了它們之間對立的因素外，還必將具備同一性。例如：前與後，左與右之所以能構成一個矛盾的統一體，就在於你界定的那個位置及其確定的視角。如果喪失了這個特定的條件，所謂的矛盾就不會構成一個矛盾的統一體。所以、無論任何具體的矛盾，除了相互對立的兩個方面，同一性內容也要占一席之地（說明：同一性在具體的矛盾事物中，是不能單獨存在的，而是居於對立著的兩個方面之中）。有了這樣的認識基礎後，我們再把事物內部通過對有害的肯定、否定，有利的肯定和否定及其同一性的肯定和否定而形成的氣化內容予以物化，肯定就是“6”這個數理，再把陰和陽各自對有害、有利和同一性的肯定和否定形成的氣化予以物化，在數理上必然為“12”。其物象表達方式就是寅卯辰巳午未申酉戌亥子醜十二地支（詳見劉玉珍老師《人體生物節律學》）。其具體的物象（陰陽兩個方面）若以天地陰陽氣化內容為坐標就是溫熱燥濕涼寒。所以十二地支又可稱為對陰陽在不同空間一定時間都具備的氣化內容的物化表達。陰陽五行學說的時空觀念就是通過這樣的深化一步一步彰顯出來的。
7、天干與地支是什麼關係？
答：簡單地說就是空間與時間的關係；
8、五運六氣與六十甲子是什麼關係？其基本含義是什麼？五行的相生相剋是不是機械循環？
答：陰陽五行學說範疇的五運六氣是從六十甲子中抽象出來的概念，就是說六十甲子其實是由陽五運六氣和陰五運六氣組成。其基本含義是指把陰和陽各自在木火土金水空間形成的溫熱燥濕涼寒氣化（氣化就是指事物內部通過對有利和有害及其同一性因素的肯定、否定而形成的自我運動變化），用具體的符號表達出來，就屬於陰陽氣化的基本內容，也就是六十甲子的基本含義。由於六十甲子表達的方式不同，事物的有別，具體的含義也是既有區別又有聯繫的。如人們最常見的六十花甲子表達的就是事物層次質變的基本規律，在劉玉珍老師的相關教材中都有相應的探討。
事物的變化是隨著時空的推移而不斷發展的，五行的相生相剋就是在這樣的動態時空形成的，人體生物節律學有關的相生相剋就是就是其最好的佐證。所以，那些把陰陽五行理論的相生相剋引向機械循環論的認識，恰恰是站在孤立的、靜止的、片面的角度所形成（就是單純在抽象的五行範圍繞圈子），是那些半拉子唯物主義者沒有把握到陰陽五行理論真諦的表現。這也是把這一提問不安排在五行那個層面，而是安排在陰陽氣化規律形成後才來解答的道理。
現代分形陰陽五行說
·中醫是整體的醫學,中醫基礎的陰陽五行,八綱辯證,藏象,經絡貫穿在中醫的整體與局部變化的始終.陰陽五行,八綱辯證是中醫變化中的"不變性",不管是由局部向整體各個層次的過渡,放大,還是從整體向局部的縮小,中醫的基本點,這种放大縮的"共同特性:分形元(陰陽五行八綱)"的不變性,就是中醫所隱含的樸素古老的分形觀,有自相似,自仿射特性.準拓撲的聯繫.陰陽集的分維是1,五行集的分維是1.4650,陰陽五行集的分維是2.0959,八綱集的分維是4等.中醫診斷,辯證施治的根基也是建立在古老樸素的分形觀上的.中醫的望聞問切是機體功能與結構等的局部與整體互相映射的結果,是分形自仿射,自相似的產物.或全息觀的映射.
陰陽學說
陰陽是中國古代哲學的一對範疇。陰陽的最初涵義是很樸素的，表示陽光的向背，向日為陽，背日為陰，後來引申為氣候的寒暖，方位的上下、左右、內外，運動狀態的躁動和寧靜等。中國古代的哲學家們進而體會到自然界中的一切現象都存在著相互對立而又相互作用的關係，就用陰陽這個概念來解釋自然界兩種對立和相互消長的物質勢力，並認為陰陽的對立和消長是事物本身所固有的，進而認為陰陽的對立和消長是宇宙的基本規律。
陰陽陰陽學說認為，世界是物質性的整體，自然界的任何事物都包括著陰和陽相互對立的兩個方面，而對立的雙方又是相互統一的。陰陽的對立統一運動，是自然界一切事物發生、發展、變化及消亡的根本原因。正如《素問·陰陽應象大論》說“陰陽者，天地之道也，萬物之綱紀，變化之父母，生殺之本始”。所以說，陰陽的矛盾對立統一運動規律是自然界一切事物運動變化固有的規律，世界本身就是陰陽二氣對立統一運動的結果。
陰和陽，既可以表示相互對立的事物，又可用來分析一個事物內部所存在著的相互對立的兩個方面。一般來說，凡是劇烈運動著的、外向的、上升的、溫熱的、明亮的，都屬於陽；相對靜止著的、內守的、下降的、寒冷、晦暗的，都屬於陰。以天地而言，天氣輕清為陽，地氣重濁為陰；以水火而言，水性寒而潤下屬陰，火性熱而炎上屬陽。
任何事物均可以陰陽的屬性來劃分，但必須是針對相互關聯的一對事物，或是一個事物的兩個方面，這種劃分才有實際意義。如果被分析的兩個事物互不關聯，或不是統一體的兩個對立方面，就不能用陰陽來區分其相對屬性及其相互關係。事物的陰陽屬性，並不是絕對的，而是相對的。這種相對性，一方面表現為在一定的條件下，陰和陽之間可以發生相互轉化，即陰可以轉化為陽，陽也可以轉化為陰。另一方面，體現於事物的無限可分性。
陰陽學說的基本內容包括陰陽對立、陰陽互根、陰陽消長和陰陽轉化四個方面。
在中醫學理論體系中，處處體現著陰陽學說的思想。陰陽學說被用以說明人體的組織結構、生理功能及病理變化，並用於指導疾病的診斷和治療。
五行學說
五行是指木、火、土、金、水五種物質的運動。中國古代人民在長期的生活和生產實踐中認識到木、火、土、金、水是必不可少的最基本物質，並由此引申為世間一切事物都是由木、火、土、金、水這五種基本物質之間的運動變化生成的，這五種物質之間，存在著既相互資生又相互制約的關係，在不斷的相生相剋運動中維持著動態的平衡，這就是五行學說的基本涵義。
五行根據五行學說，“木曰曲直”，凡是具有生長、升發、條達舒暢等作用或性質的事物，均歸屬於木；“火曰炎上”，凡具有溫熱、升騰作用的事物，均歸屬於火；“土爰稼穡”，凡具有生化、承載、受納作用的事物，均歸屬於土；“金曰從革”，凡具有清潔、肅降、收斂等作用的事物則歸屬於金；“水曰潤下”，凡具有寒涼、滋潤、向下運動的事物則歸屬於水。
五行學說以五行的特性對事物進行歸類，將自然界的各種事物和現象的性質及作用與五行的特性相類比後，將其分別歸屬於五行之中。
五行學說認為，五行之間存在著生、克、乘、侮的關係。五行的相生相剋關係可以解釋事物之間的相互聯繫，而五行的相乘相侮則可以用來表示事物之間平衡被打破後的相互影響。
中醫學套用五行學說以解釋人體的生理功能，說明機體病理變化，用於疾病的診斷和治療。中科院曾邦哲的結構論認為從數學拓撲幾何學或圖論的角度分析，五元素的聯接方式正好等價於金剛石的化學鍵連線模型，因而稱之為超穩態結構模型。
陰陽與五行的關係
陰陽學說主要說明事物對立雙方的互相依存、互相消長和互相轉化的關係；五行學說是用事物屬性的五行歸類及生克乘侮規律，以說明事物的屬性和事物之間的相互關係。在中醫學裡，二者皆以臟腑、經絡、氣血津液等為其物質基礎；都是從巨觀自然現象（包括）人體的變化規律，用取象比類的方法，來分析、研究、解釋人體的生理活動和病理變化及人體內外的各種關係，並指導臨床辨證與治療。
陰陽五行的最新訓詁與解析
《糖尿病行為醫學技術指南》作者、天津醫科大學王英博士，撰著了《儒醫理論與心身疾病治療》，對陰陽五行學說進行了全面訓詁和重新解析。引起學術界重視。原文節選如下：
陰陽哲學的內容豐富，在古今中外一直存在很多角度的理解。比如海外就有學者認為中國古代用“物理”和“心理”共同說明問題，是陰陽哲學對物與心的共鳴（resonance），還有把物候變化和“心理”共同類比來說明陰陽哲學的情況理解成節奏（rhythm）。如果剔除一些假借陰陽哲學之名，實為迷信糟粕以及對陰陽哲學的機械理解，則可以顯示出這一哲學的歷史作用。下面要闡述的是陰陽哲學在中國古代文化中的地位、陰陽五行理論、陰陽哲學的研究對象和由此產生的心性觀點及其帶來的心身問題。
（一）陰陽哲學的地位
陰陽哲學在孔子生活的時代已經具有了崇高地位。其重要的標誌就是作為群經之首的《易》，所有的卦都是由陰陽爻組成。而《易》以及《易傳》的相關內容，一直成為後世哲學的依據。陰陽哲學實際上一直在總領儒、道、醫。陰陽哲學在儒家的這種地位，可以從正統儒學把《易傳》看成是孔子之作這一點上得到證明；陰陽哲學在道家的這種地位，可以在道家對宇宙解說運用的正是陰陽哲學這一點上得到證明；陰陽哲學在醫學上的這種地位，可以從《黃帝內經》全文以陰陽解說和直接引用《易傳》中陰陽論述的情況得到證明。陰陽哲學的這種地位，要求解析傳統文化心理學思想時必須注意陰陽理論的作用，同時也使闡明陰陽理論具有了更重要意義。
正是陰陽哲學這種歷史地位，使中國人無論從文化心理角度，還是從中醫學角度，只要涉及到心身問題，就無法擺脫陰陽哲學的影響。從心性修養，到心身疾病，無不如此。
（二）陰陽五行理論
古人對陰陽五行，都是用生命的活性來加以理解，並用來說明活生生的事物。明確這一點，對正確理解儒家心性學說非常重要，對理解儒家心性理論對中國人心身健康發生的作用同樣非常重要。
上個世紀五十年代以後中國大陸有關古代陰陽哲學的認識幾乎是統一的，而這種統一就在於陰陽學說符合唯物辯證法的矛盾論。與此相關的認識是，五行理論就是古代樸素的唯物論，而這種說法的依據就是把《尚書洪範》中的五行理解成五種物質。近年來這種情況發生了一些變化，這表現在很多學者試圖擺脫辯證唯物主義的統一哲學模式來重新理解古代哲學思想。事實上，當離開辯證唯物主義的角度回歸到秦漢之前哲學水平上的時候，陰陽哲學就會顯現出原本的內容。早在上個世紀六十年代台灣學者徐復觀就注意到，先秦文獻中凡提到“五行”時大都是用“陰陽五行”，而提到陰陽則經常不帶有五行，這說明五行是依附陰陽存在的。遺憾的是徐復觀對陰陽五行理論的考察沒有關注到還有中醫學的存在，也沒有提及到《黃帝內經》中的相關論述。因此對陰陽理論如何駕馭五行學說沒有做出進一步的探討。實際上，陰、陽、木、火、土、金、水，在原本體系內都是抽象的概念，其中的木、火、土、金、水並不是指有形的物質。本觀點的相關證據如下：
第一點，早期文獻上不支持五行是五種物質的說法。
行，古文是走的意思。《洪範》原文：“五行，一曰水，二曰火，三曰木，四曰金，五曰土。”鄭玄《洪範注》：“行者，順天行氣也。”《春秋繁露》解釋說：“行者，行也。”五行的“行”首先是動詞，然後轉化成描述“動”的名詞。五行，也就是五種基本走勢。所以接著就用了五種運動方式來說明木火土金水。可見漢代儒家理解的木火土金水，是基於陰陽運動方式作出的定義，而不是五種基本物質。至於《左傳》中才出現“五材”，這並不表示五行就是五材。“行”字在古代從來就沒有“材”的含義，把“五行”解釋成“五材”也就沒有任何根據。這種把不同的文獻的內容沒經過文字訓詁而硬放到一起解說的做法，在學術上是不嚴謹的。
《尚書甘誓》中提到“五行，”《尚書洪範》又細論五行。越來越多的證據表明《洪範》是西周時期就成書的作品。“很多人覺得《洪範》晚出，是由於篇中首列五行，而近人的一項成見，是以為五行的出現很遲。這種論證方式，在邏輯上是顛倒的。”建國後的中醫教材中把五行和五材硬拉到一起，也因為文獻考據不足而承認是一種推測。對五行理論發展的“疑古”考證，邏輯上是錯誤的。根據“疑古派”的邏輯，凡是涉略五行的先秦作品，大都是漢代以後的偽作。凡是有金、木、水、火、土之類文字出現的，就必然是講古代的五行理論。按照這些考證，很多文獻被認定為西漢以後完成卻偽稱是先秦作品。隨著郭店楚墓竹簡出土，證明《尚書》確實為周代作品而非漢代人偽作的。
第二點，五行學說在儒學和中醫學上發揮的只是哲學作用，而不是物質作用。
近年來，中醫學者也說明在用於疾病研究的方法論中，五行已經不再是五種物質，而是哲學概念。更重要的是，中國古代在《黃帝內經》以後一直把用於分析生命現象的陰陽五行當成哲學概念解說，而不是當成樸素唯物論來解說。這就導致了五行學說對秦漢之後的儒學發展也就一直發生了方法論上的作用，而不是五種物質的作用。
從戰國到明清，各種醫學、儒學著作大都是用變化和作用來理解五行關係，如《黃帝內經》、董仲舒的《春秋繁露》、班固的《白虎通》等都是類似的理解。
第三點，五行理論本身不支持物質說法。
五行表達了陰陽之間的關係。五行在生命體內的相互依存，表達了陰陽之間相互依存不可分割的關係；五行之間的相互制約，表達了生命運動所具有的內部規定性；五行的運動和轉化，表達了陰陽之間不斷發生力量變化的消長關係；五行不能獨立存在，同生同滅，表達了陰陽並行不悖的關係。陰陽之間的這種重要關係，也無法用五種物質關係來理解。五行所描述的是不能分割的一體關係，是生命體內的互相支持、互相制約又不斷變化的關係，而不是五種獨立個體之間的關係。
金、木、水、火、土，這五種物質之間缺乏嚴格的互相支持關係，可以獨立存在。而在五行學說中，沒有一“行”可以離開其他的四“行”而存在。因此把五行說成是五種物質是牽強附會的。
第四點，五行理論的功用不支持物質說法。
五行理論是用來解說天地萬物變化的。所以中醫學總是用運行不息來理解五行。中醫學的陰陽關係，是通過五行（木、火、土、金、水）來表述的。陰陽五行，描述了生命系統內部所必須具有的相互支持和相互制約力量，因而形成了對生命特殊的看法。五行理論把生命描述成活的、不斷運動發展和能夠維護自身平衡的生命，而這一作用無法用把五行看成五種物質的理論來完成。
（三）陰陽哲學的研究對象
陰陽哲學研究的是天地變化之道，萬物運行的法則，生命變化的規律，生命內部的制約和支持關係，生命力的源頭。這五點是對《黃帝內經》中所闡述的陰陽五行理論內容的提煉：
第一點，陰陽理論用來闡述天地生成和變化。中國古代認為在混沌之後，清陽上浮為天，濁陰下沉為地，所以清陽為天，濁陰為地。又認為地氣上升為雲，天氣下降為雨。而這一過程和天地生成過程構成了天地之間的物質循環。
第二點，陰陽理論用來闡述萬物運行的法則。陰陽用來闡述運動的不同方式、方向和結果。
第三點，陰陽理論用來闡述生命變化規律。中國古代用生、長、收、藏來說明生命的變化形式和過程，而推動這一過程實現的力量就是陰陽。
陰陽用來說明生命變化形式的“生、長、收、藏”。推動了生命過程的“生、長、化、收、藏”，形成終而復始的運動，這正是五行理論的內容之一。這也充分表明了五行理論是用來解釋和落實陰陽理論的。
第四點，陰陽理論用來闡述生命內部的制約和支持關係。
第五點，陰陽理論用來闡述生命能力的源頭。在中國古代，道家和醫家都是用“神明”來描述生命的生滅現象和能力。陰陽正是這種生滅現象發生的原因，因此也就是用來理解生命現象的。
上述五個方面代表了中國古代對天地、生命的基本看法，被《黃帝內經》歸結為：“陰陽者，天地之道也，萬物之綱紀，變化之父母，生殺之本始，神明之府也。”
現代中醫史
上個世紀末,本世紀初，1996年,清華學界對中醫氣本質，經絡實質，陰陽，五行，藏象，中醫哲學觀等都有了新的全面整體創造性的認識和解說。如，鄧宇等發現的:氣是流動著的‘信息－能量－物質’的混合統一體；分形分維的經絡解剖結構；數理陰陽；中醫分形集：分形陰陽集－陰陽集的分形分維數，五行分形集－五行集的分維數；分形藏象五系統－暨心繫統、肝系統、脾系統、肺系統、腎系統；中醫三個哲學觀－新提出的第三哲學觀：相似觀－分形論等。
還包括近代針灸經絡的發展史,近代中醫氣的進展簡史,中西醫結合史,中醫中藥史等.
古代(經典)中醫史
中醫產生於原始社會，春秋戰國中醫理論已經基本形成，出現了解剖和醫學分科，已經採用“四診”，治療法有砭石、針刺、湯藥、艾灸、導引、布氣、祝由等。西漢時期，開始用陰陽五行解釋人體生理，出現了“醫工”，金針，銅鑰匙等。東漢出現了著名醫學家張仲景，他已經對“八綱”（陰陽、表里、虛實、寒熱）有所認識，總結了“八法”。華佗則以精通外科手術和麻醉名聞天下，還創立了健身體操“五禽戲”。唐代孫思邈總結前人的理論並總結經驗，收集5000多個藥方，並採用辨證治療，因醫德最高，被人尊為“藥王”。唐朝以後，中國醫學理論和著作大量外傳到高麗、日本、中亞、西亞等地。兩宋時期，宋政府設立翰林醫學院，醫學分科接近完備，並且統一了中國針灸由於傳抄引起的穴位紊亂，出版《圖經》。金元以降，中醫開始沒落。明清以後，出現了溫病派時方派，逐步取代了經方派中醫。在明朝後期成書的李時珍的《本草綱目》標誌著中藥藥理學沒落。同一時期，蒙醫、藏醫受到中醫的影響。在朝鮮東醫學也得到了很大的發展，例如許浚撰寫了《東醫寶鑑》。
自清朝末年，中國受西方列強侵略，國運衰弱。同時現代醫學（西醫）大量湧入，嚴重衝擊了中醫發展。中國出現許多人士主張醫學現代化，中醫學受到巨大的挑戰。人們開始使用西方醫學體系的思維模式加以檢視，中醫學陷入存與廢的爭論之中。同屬中國醫學體系的日本漢方醫學、韓國的韓醫學亦是如此。2003年“非典”以來，經方中醫開始有復甦跡象。
在文化大革命期間，中醫作為“古為今用”的醫學實例得到中國共產黨政策上的支持而得以發展。現代，中醫在中國仍然是治療疾病的常用手段之一。
在國際上，針灸在引起醫學界極大興趣，世界衛生組織的觀點認為，針灸已被證實在減輕手術後疼痛、懷孕期反胃、化療所產生的反胃和嘔吐、牙齒疼痛方面是有效的且其副作用非常低，然而，對慢性疼痛，背部疼痛以及頭痛，數據顯示出模稜兩可或者爭議性。。WHO認為很多針灸和一些草藥的有效性得到了科學雙盲研究的較強支持，但是對於其它的傳統療法還需要進行進一步研究，而且不能忽視未經研究的傳統療法存在的安全性及危險性等問題。WHO在2002年5月26日發表“2002－2005年傳統醫藥研究全球策略”，邀請全球180餘國將替代醫學納入該國的醫療政策。
