形成基礎
中醫學理論體系初步形成於戰國至兩漢時期，《黃帝內經》、《傷寒雜病論》、《神農本草經》等醫學專著的成書，標誌著中醫學理論體系的初步形成。漢代以後的醫學理論與實踐的發展，又逐漸充實和完善了這一理論體系。
中醫學理論體系的形成和確立，經歷了一個漫長的歷史時期。戰國以降，社會的急劇變革和學術的百家爭鳴，為醫學理論體系的形成創造了有利的社會文化氛圍。此時，古代醫家也加速了對人體自身奧秘及人與自然關係的探討，力圖將醫學的經驗上升為理論。他們在吸收了諸子學說中的精華部分，在醫學實踐與解剖學成就的基礎上，創立了藏象、經絡、氣血津液精神等學說，並在探討人與自然關係的過程中創立了六淫致病學說；同時又將古代哲學的氣、陰陽、五行諸學說引入醫學領域，作為方法論用以闡釋人體的生理和病理，指導疾病的診斷和防治。於此建立起中醫學理論體系。
基礎總述
戰國至秦漢時期，是中醫學理論體系的形成時期。這一時期問世的《黃帝內經》、《難經》、《傷寒雜病論》、《神農本草經》等醫學典籍，標誌著中醫學理論體系的確立，即理、法、方、藥體系的基本形成。
層次結構
中醫學在數千年的歷史中，逐漸形成了獨特的醫學理論體系，標誌著中醫學作為一門科學的誕生。
中醫學理論體系是包括理、法、方、藥在內的一個整體，主要闡明中醫學的基本理論、基本規律和基本方法。它是以整體觀念為主導思想，以氣、陰陽、五行諸學說為論理方法，以臟腑經絡精氣血津液為生理病理基礎，以辨證論治為診治特點的獨特的醫學理論體系。
醫學理論體系的建立，是醫學發展成熟的最重要標誌。中醫學因其在漢代已建立了較完備的醫學理論體系，故能代有發展，流傳至今。世界各民族都有自己的傳統醫學，但至今未見衰亡，未被西方醫學所替代的，恐怕只有中醫學。其原因在於中醫學並非簡單的傳統醫學，她具有相當完備的理論體系作指導。醫生在治療疾病時可根據理論分析從未接觸過的疾病，這是一般經驗醫學難以做到的。即使是常見病，中醫學也是從辨證入手進行治療，而不重複以往的經驗。當然，理論的正確與否還需要實踐的檢驗，不能有效地指導臨床實踐的理論則被揚棄。理論源於經驗，又反過來指導實踐。中醫學理論體系就是在這一複雜過程中逐漸完善的。
中醫學理論體系的主要內容有：
①藏象、經絡、形體官竅、精神氣血津液、體質學說，為有關人體正常形態生理的理論；
②病因、發病、病機學說，為有關疾病發生髮展變化的理論；
③治療原則與方法，藥學、組方理論及診法、辨證理論，為認識與處理疾病的理論與方法體系；
④養生、保健、康復理論與方法，為有關預防與延壽的理論與方法體系。
制約和指導以上各種理論的是在古代哲學精氣、陰陽、五行諸學說影響下建立的整體觀、恆動觀與辯證觀，它們是中醫學理論體系結構中的最高層次，表達了中醫學的特色。
當然，隨著中醫學的現代化進程，中醫學自身的基本理論將在繼承的基礎上不斷得到創新和發展，古代哲學範疇的精氣、陰陽、五行諸學說對中醫學的影響將不斷被淡化，中醫學理論體系的內容將不斷得到更新，並納入現代自然科學、社會科學和思維科學的研究領域，中醫學的新的假說、新的理論和方法學體系將被提出和建立，中醫學理論體系也將在此基礎上得到逐步完善和重新構建。
