蔣慶華[哈爾濱工業大學生命學院教授]

蔣慶華[哈爾濱工業大學生命學院教授]
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蔣慶華,男,博士,教授,博士生導師。主要研究方向為生物信息學。主持國家自然科學面上項目、青年基金、中國博士後科學基金特別資助、中國博士後基金一等資助等科研項目7項。發表SCI論文35篇,EI論文2篇。其中第一作者或通訊作者SCI論文19篇,單篇SCI最高影響因子9.9、單篇SCI最高他引522次,2010年入選“中國百篇最具影響國際學術論文”,2011年獲“第十二屆黑龍江省自然科學技術學術成果一等獎”。2016年,哈爾濱工業大學生命學院教授蔣慶華在神經退行性疾病研究方面取得進展,對治療阿爾茨海默病產生巨大影響。

基本信息

人物經歷

教育經歷

蔣慶華蔣慶華
1999.09-2003.07吉林大學計算數學學士
2003.09-2006.07吉林大學計算數學碩士
2007.03-2010.06哈爾濱工業大學計算機套用技術博士

工作履歷

2010.08-2012.12哈爾濱工業大學生物醫學工程研究中心講師
2011.11-2012.11哈佛大學DanaFarber癌症研究所訪問學者
2013.12-2015.12哈爾濱工業大學生物醫學工程研究中心副教授
2015.04-至今哈爾濱工業大學生命科學與技術學院博士生導師
2016.01-至今哈爾濱工業大學生物醫學工程研究中心教授

學術兼職

《NucleicAcidsResearch》、《Bioinformatics》、《BriefingsinBioinformatics》、《ScientificReports》、《CurrentBioinformatics》、《AnimalGenetics》、《InternationalJournalofDataMiningandBioinformatics(IJDMB)》等期刊審稿人
《AustinJournalofComputationalBiologyandBioinformatics》期刊編委(2014-)
《AustinMedicalSciences》期刊編委(2015-)

研究方向

生物信息學、癌表觀基因組學:發展信息學方法,對高通量組學及臨床數據進行整合及分析,研究癌症發生、發展過程中表觀及轉錄調控機制,計算預測、實驗驗證癌症相關的非編碼基因(lncRNA、microRNA)。
基於單核苷酸多態的阿爾斯海默病(AD)遺傳標記的識別與檢測:構建中國或者亞洲人群AD遺傳標記(SNP)知識庫系統,研發疾病預測模型和算法,預測AD疾病風險。
長鏈非編碼RNA(longnon-codingRNA,lncRNA)綜合分析平台:發展生物信息學方法,重點研究lncRNA轉錄調控、功能注釋及疾病lncRNA識別技術,開發集數據中心、分析平台、知識庫於一體的lncRNA分析系統,推動在基因組範圍內對lncRNA調控機制及功能的理解。
腫瘤診斷與治療:基於腫瘤基因組數據,發展腫瘤相關的遺傳變異識別及功能注釋方法,基於變異與靶向藥物的關係信息,制定個體化用藥指導方案。
健康管理:通過分析健康個體的基因組數據,預測潛在的疾病風險、制定個體化用藥指導及健康生活方案。

教育教學

承擔課程

生物信息學(授課對象:生命學院三年級本科生)
生物信息技術(授課對象:生命學院碩士一年級)
本課程主要介紹生物信息學基本概念及特點、常用生物資料庫基因組瀏覽器Linux系統常用命令、R語言編程、基因晶片原理及數據分析、新一代DNA測序技術原理及其數據分析、生物信息學熱點問題分析等內容。通過本課程的講授,旨在使學生了解生命科學學術前沿技術及研究問題、培養學生運用所學的數據分析技術解決生命科學中前沿問題的能力,為今後從事生命科學研究奠定基礎。

研究生培養

2017年招生:博士生2名,碩士生3名,歡迎計算機、數學、生物、生物信息學等相關專業的同學報考。
蔣慶華教授歡迎所有喜歡閱讀頂級期刊論文,希望在哈工大生命學院攻讀碩士學位並以發表學術論文為樂趣的有志青年加入他的研究團隊,有意者可致信qhjiangathit.edu.cn。
對於沒有任何編程及信息技術基礎的學生,蔣慶華教授會用大約半年的時間與他們一起學習經典實用的程式語言(R、Python等),指導學生掌握基本的統計與數據挖掘方法,發現並跟蹤最前沿的生命科學熱點問題,並用所學的編程技能及信息學方法解決這些問題。
蔣慶華教授鼓勵他的學生將科研作為畢生的追求和事業,支持他的學生在畢業後繼續攻讀博士學位(出國攻博或公派出國進行二年的博士生聯合培養)。

項目與獲獎

主持的科研項目
2016.1-2019.12,國家自然科學基金面上項目
2016.1-2019.12,哈工大青年拔尖人才選聘計畫項目
2016.1-2017.12,黑龍江省自然科學基金面上項目
2016.1-2016.12,黑龍江省留學人員擇優資助項目
2012.7-2015.06,哈工大基礎研究傑出人才培育計畫III
2012.1-2014.12,國家自然科學青年基金
2012.9-2014.12,中國博士後第五批特別資助基金
2011.7-2013.12,中國博士後科學基金(一等資助)
2011.1-2012.12,哈工大科研創新基金
2012.1-2013.12,黑龍江省博士後基金
參與的科研項目
2010.01-2012.12,國家自然科學基金,排名:9/2
2014.01-2017.12,國家自然科學基金,排名:8/2
2012.01-2015.12,國家863項目,排名:17/11
2015.01-2017.12,國家863重大項目,排名18/69
榮譽稱號
2010年獲“中國百篇最具影響國際學術論文”
2011年獲”第十二屆黑龍江省自然科學技術學術成果一等獎"
2012年入選“哈爾濱工業大學基礎研究傑出人才培育計畫III”
2015年入選“哈爾濱工業大學青年拔尖人才選聘計畫”

學術論文

2016

GuiyouLiu,QinghuaJiang*.Alzheimer'sdiseaseCD33rs3865444variantdoesnotcontributetocongnitiveperformance.2016.PNAS.DOI:10.1073/pnas.1600852113(SCIIF:9.674)(*通訊作者)
GuiyouLiu,QinghuaJiang,YongshuaiJiang,KeshenLi.JunweiHao*.Ischaemicstrokevariantsfromgenome-wideassociationstudiesandAlzheimer’sdiseasesusceptibility.AnnalsofNeurology.2016.(SCIIF:9.977)(Accepted)
QinghuaJiang,GuiyouLiu*.LackofassociationbetweenMC1RvariantsandParkinson’sdiseaseinEuropeandescent.2016.AnnalsofNeurology.DOI:10.1002/ana.24627(SCIIF:9.977)
QinghuaJiang,GuiyouLiu*.RESTrs3796529variantdoesnotinfluencehumansubcorticalbrainstructures.AnnalsofNeurology.2016Feb;79(2):334-5.(SCIIF:9.977)
QinghuaJiang#,ShuilinJin#,YongshuaiJiang,MingzhiLiao,RennanFeng,LiangcaiZhang,GuiyouLiu*,JunweiHao*.Alzheimer'sdiseasevariantswiththegenome-widesignificancearesignificantlyenrichedinimmunepathwaysandactiveinimmunecells.2016.doi:10.1007/s12035-015-9670-8.MolecularNeurobiology.(SCI,IF:5.137)
GuiyouLiu#,YiningXu#,YongshuaiJiang,MingzhiLiao,RennanFeng,QinghuaJiang*.PICALMrs3851179variantconferssusceptibilitytoAlzheimer'sdiseaseinChinesepopulation.2016.MolecularNeurobiology.(SCI,IF:5.137)(Accepted)(*通訊作者)
YiningXu,QinghuaJiang,GuiyouLiu*.PICALMrs3851179variantandAlzheimer'sdiseaseinAsianpopulation.2016.NeuroMolecularMedicine.(SCI,IF:3.678)(Accepted)
WeiyangBai,WenYang,WenjingWang,YangWang,CanLiu,QinghuaJiang,JinlianHua,MingzhiLiao*.GED:amanuallycuratedcomprehensiveresourceforepigeneticmodificationofgametogenesis.BriefingsinBioinformatics.2016Feb5.pii:bbw007.(SCI,IF:9.617)

2015

JiangQH,WangJX,WuXL,MaR,JinSL,HanZJ,TanRJ,PengJJ,LiuGY,LiY,WangYD*.LncRNA2Target:adatabasefordifferentiallyexpressedgenesafterlncRNAknockdownoroverexpression.2015.NucleicAcidsResearch.DOI10.1093/nar/gku1173(SCI,IF:9.112)
JiangQH,MaR,WangJX,WuXL,JinSL,PengJJ,TanRJ,ZhangTJ,LiY,WangYD*.LncRNA2Function:acomprehensiveresourceforfunctionalinvestigationofhumanlncRNAsbasedonRNA-seqdata.2015.BMCgenomics.16(s3):s2.(SCI,IF:3.986)
HanZJ,JiangQH*,ZhangTJ,WuXL,MaR,WangJX,BaiY,WangRJ,TanRJ,WangYD*.Analyzinglarge-scalesamplesconfirmstheassociationbetweenthers1051730polymorphismandlungcancersusceptibility.2015.ScientificReports.(Accepted)(SCI,IF:5.578)(*通訊作者)
ZhangSY,LiX,MaG,JiangYS,LiaoMZ,FengRN,ZhangLC,LiuJF,WangGY,ZhaoB,JiangQH*,LiKS*,LiuGY*.CLUrs9331888PolymorphismContributestoAlzheimer'sDiseaseSusceptibilityinCaucasianButNotEastAsianPopulations.2015.MolecularNeurobiology,53(3),1446-1451.(*通訊作者)(SCI,IF:5.137)
LiYN,SongDJ,JiangYS,WangJ,FengR,ZhangLC,WangGY,ChenZG,WangRZ*,JiangQH*,LiuGY*.CR1rs3818361PolymorphismContributestoAlzheimer'sDiseaseSusceptibilityinChinesePopulation.MolecularNeurobiology.2015July21.[Epubaheadofprint].(*通訊作者)(SCI,IF:5.137)
LiKS,JiangQH,XuAD,LiuGY.RESTrs3796529variantdoesnotconfersusceptibilitytoAlzheimer'sdisease.AnnalsofNeurology.2015Aug18.doi:10.1002/ana.24503.[Epubaheadofprint](SCIIF:9.977)
GuiyouLiu,YongquanLiu,QinghuaJiang,YongshuaiJiang,RennanFeng,LiangcaiZhang,ZugenChen,KeshenLi,JiafengLiu.ConvergentGeneticandExpressionDatasetsHighlightTREM2inParkinson’sDiseaseSusceptibility.MolecularNeurobiology.2015.DOI10.1007/s12035-015-9416-7.(SCI,IF:5.137)
BaiY,JiSF,JiangQH,WangYD.Identificationexonskippingeventsfromhigh-throughputRNAsequencingdata.IEEETransactionsonNanoBioscience.2015Jul;14(5):562-9(SCIIF:2.309)
XinjieBao,GengfengChen,YongshuaiJiang,QinghuaJiang,MingzhiLiao,RennanFeng,Liangcai
Zhang,GuodaMa,ShuyanZhang,ZugenChen,BinZhao,RenzhiWang*,KeshenLi*,GuiyouLiu*.Celladhesionmoleculespathwaysgenesareregulatedbycis-regulatorySNPsandshowsignificantlyalteredexpressioninAlzheimer’sdiseasebrains.NeurobiolAging.2015Jun12(SCI,IF:5.013)
XiaoZhu,HenryC.M.Leung,RongjieWang,FrancisY.L.Chin,SiuMingYiu,GuangriQuan,YajieLi,RuiZhang,QinghuaJiang,BoLiu,YucuiDong,GuohuiZhou,YadongWang.misFinder:Identifymis-assembliesinanunbiasedmannerusingreferenceandpaired-endreads.BMCBioinformatics.2015(Accepted)(SCIIF:2.44)
PengJJ,LiHX,LiuYZ,JuanLR,JiangQH,WangYD*.InteGO2:awebtoolformeasuringandvisualizinggenesemanticsimilaritiesusingGeneOntology.BMCBioinformatics.2015(Accepted)(SCI,IF:2.576)
ZhuX,LeungHC,WangR,ChinFY,YiuSM,QuanG,LiY,ZhangR,JiangQ,LiuB,DongY,ZhouG,WangY.misFinder:identifymis-assembliesinanunbiasedmannerusingreferenceandpaired-endreads.BMCBioinformatics.2015Nov16;16(1):386(SCI,IF:2.576)

2014

JiangQH,WangJX,WuXL,MaR,JinSL,HanZJ,TanRJ,PengJJ,LiuGY,LiY,WangYD.LncRNA2Target:adatabasefordifferentiallyexpressedgenesafterlncRNAknockdownoroverexpression.2014.NucleicAcidsResearch.DOI10.1093/nar/gku1173(SCI,IF:8.808)
QuanBK,QiXS,YuZH,JiangYS,LiaoMZ,WangGY,FengRN,ZhangLC,ChenZG,JiangQH*,LiuGY*.Pathwayanalysisofgenome-wideassociationstudyandtranscriptomedatahighlightsnewbiologicalpathwaysincolorectalcancer.2014.MolecularGeneticsandGenomics.DOI10.1007/s00438-014-0945-y.(*通訊作者)(SCI,IF:2.831)
LiuGY,BaoXJ,JiangY,SLiaoMZ,JiangQH,FengRN,ZhangLC,MaGD,ChenZG,WangGY,WangRZ,ZhaoB,LiKS.IdentifyingtheAssociationBetweenAlzheimer'sDiseaseandParkinson'sDiseaseUsingGenome-WideAssociationStudiesandProtein-ProteinInteractionNetwork.2014.MolecularNeurobiology.DOI10.1007/s12035-014-8946-8(SCI,IF=5.286)
LiX,ShenN,ZhangSY,LiuJF,JiangQH,LiaoMZ,FengRN,ZhangLC,WangGY,MaGD,ZhouHH,ChenZG,JiangYS*,ZhaoB*,LiKS*,LiuGY*(2014)CD33rs3865444polymorphismcontributestoAlzheimer’sdiseasesusceptibilityinEuropeanandNorthAmericanbutnotAsianpopulations.MolecularNeurobiology.DOI10.1007/s12035-014-8880-9(SCI,IF=5.286)
XiangZM,XuML,LiaoMZ,JiangYS,JiangQH,FengRN,ZhangLC,MaGD,WangGY,ChenZG,ZhaoB,SunTS*,LiKS*,LiuGY*(2014)Integratinggenome-wideassociationstudyandbrainexpressiondatahighlightscelladhesionmoleculesandpurinemetabolisminAlzheimer’sdisease.MolecularNeurobiology.DOI10.1007/s12035-014-8884-5(SCI,IF=5.286)
PengJJ,LiHX,JiangQH,WangYD,ChenJ.TITLE:AnIntegrativeApproachforMeasuringSemanticSimilaritiesusingGeneOntology.BMCsystemsbiology.2014,8(Suppl5):S8(SCI,IF:2.853)
TanRJ,WangYD,KleinsteinS,LiuYZ,ZhuXL,JiangQH,ZhuMF.AnEvaluationofCopyNumberVariationDetectionToolsfromWhole-ExomeSequencingData.Humanmutation.2014Mar5.doi:10.1002/humu.22537.[Epub2014May1](SCI,IF:5.213)
JinSL,TanRJ,JiangQH,XuL,PengJJ,WangY,WangYD.AgeneralizedtopologicalentropyforanalyzingthecomplexityofDNAsequences.PLoSOne.2014Feb12;9(2):e88519(SCI,IF:3.73)
JiangQH,WangJX,WangYD,MaR,WuXL,LiY.TF2LncRNA:IdentifyingcommontranscriptionfactorsforalistoflncRNAgenesfromChIP-Seqdata.BioMedResearchInternational.vol.2014,ArticleID317642,5pages,2014.doi:10.1155/2014/317642(SCI,IF:2.706)

2013

JiangQH,WangGH,LiY,JinSL,WangYD.PredictingHumanmicroRNA-diseaseAssociationsBasedonSupportVectorMachine.InternationalJournalofDataMiningandBioinformatics.2013.vol.8,No.3.282-239

2012

JinSL,XuL,JiangQH*,DuanGR.AJointSpectralCharacterizationofC*Independence.InfiniteDimensionalAnalysisQuantumProbabilityandRelatedTopics.Vol.15,No.2(2012)1250013:1-5(*通訊作者)
JinSL,JiangQH*,WangYD*,DuanGR.Onjointspectrumofinfinitedirectsums.OperatorsandMatrices.Vol.6,No.3(2012),529–533(*通訊作者)
JinSL,XuL,JiangQH*andLLi*.ConditionsequivalenttoC*independence,StudiaMath.2012,211,191-197(*通訊作者)
JinSL,XuL,JiangQH.JointSpectrumandJointDistribution.Complexanalysisandoperatortheory.2012.DOI10.1007/s11785-012-0258-2
2011
ZhuSJ,JiangQH,WangGH,LiuB,TengMX,WangYD.Chromatinstructurecharacteristicsofpre-miRNAgenomicsequences.BMCgenomics.2011.12(1):329.

2010

JiangQH,HaoYY,WangGH,JuanLR,ZhangTJ,TengMX,LiuYL,WangYD.PrioritizationofdiseasemicroRNAsthroughahumanphenome-microRNAomenetwork,BmcSystemsBiology,2010,4Suppl1,S2.
JiangQH,HaoYY,WangGH,ZhangTJ,WangYD.Weightednetwork-basedinferenceofhumanmicroRNA-diseaseassociations.The5thInternationalConferenceonFrontierofComputerScienceandTechnology-WorkshoponBioinformaticsandSystemBiology.2010.431-435
JiangQH,WangGH,WangYD.Anapproachforprioritizingdisease-relatedmicroRNAsbasedongenomicdataintegration.The3rdInternationalConferenceonBioMedicalEngineeringandInformatics.2010.2270-2274

2009

JiangQH,WangYD,HaoYY,JuanLR,TengMX,ZhangXJ,LiMM,WangGH,LiuYL.miR2Disease:amanuallycurateddatabaseformicroRNAderegulationinhumandisease.NucleicAcidsRes.2009,37:D98-104

重大發現

找到攻克阿爾茨海默症新線索

2016年,哈爾濱工業大學生命學院教授蔣慶華在神經退行性疾病研究方面取得進展,將對治療阿爾茨海默病產生巨大影響。

尋找影響認知衰退的遺傳位點是治療該疾病的關鍵一步,2015年,美國加州大學研究人員發現CD33基因變異rs3865444是人類逐漸演化出的獨特的基因變異,能保護認知衰退,進而抵禦神經退行性疾病。

為了驗證這一發現,蔣慶華教授和其博士生劉桂友分析了17989個兒童樣本的認知功能數據、106736個成人樣本的認知功能數據以及101069個成人樣本的受教育程度數據。研究發現,CD33基因變異rs3865444與兒童認知功能、成人認知功能和受教育程度無顯著關聯。蔣慶華教授研究結果表明,CD33基因附近可能存在其它的突變位點能夠保護認知衰退,進而抵禦神經退行性疾病,這一發現為阿爾茨海默病等神經退行性疾病後續研究提供了新思路和新線索。

這一研究結果在《美國科學院院報》上以快報形式發表,該刊是被引用次數最多的綜合學科文獻之一,是公認的世界四大名刊之一。

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