人物生平
早期經歷
明神宗朝服像 嘉靖四十一年（1562）八月十七日，朱翊鈞出生在裕王府，是明穆宗朱載垕的第三子。明穆宗有四子，長子朱翊釴、次子朱翊鈐，俱早亡。四子朱翊鏐與朱翊鈞同為李氏所生。朱翊鈞的祖父世宗嘉靖帝晚年迷信道教，“諱言儲貳，有涉一字者死”， 因此，關於朱翊鈞的誕生，沒人敢報告嘉靖皇帝，更不敢為之起名字。直到隆慶元年（1567）正月初十日，廷臣上疏請立皇太子，同月十八日明穆宗才為他賜名，叫朱翊鈞。明穆宗說：賜你名字，名為鈞，是說聖王制馭天下，猶如制器之轉鈞也，含義非常重大。你當念念不忘。
隆慶二年（1568）三月十一日，因其成為了其父子嗣中最為年長的，故朱翊鈞被立為皇太子，正位東宮。朱翊鈞的生母李太后身世卑微原是宮人，後來母以子貴才晉升為貴妃。 皇太子就是未來的皇帝，將來要治國治民，必須從小接受教育，了解以往帝王承業治國的經驗教訓，熟悉朝章典故，掌握駕馭臣民的本領。朱翊鈞雖然年幼，卻很懂得這個道理。明穆宗任命一批大臣為教官，輔導他讀書。朱翊鈞學習非常用功。其母李氏教子非常嚴格。朱翊鈞小時候稍有懈怠，李太后就將其召至面前長跪。每次遇到講筵的時候，李太后都令經筵講官入前親授。沒遇到早朝的時候，五更就到了朱翊鈞的寢宮，早早將朱翊鈞叫起。 由於講官的盡心輔導，李太后的嚴格管教，以及朱翊鈞本人的刻苦努力，朱翊鈞年漸長而學愈進。他自己後來也常常十分得意地說：“朕五歲即能讀書。”
沖齡踐祚
神宗生母李太后 隆慶六年（1572）五月二十二日，明穆宗病危，三天后內閣大學士高拱、張居正、高儀被召入宮中。 高拱等人進入寢宮東偏室，見明穆宗坐在御榻上，榻邊簾後坐著皇后陳氏、皇貴妃李氏，10歲的太子朱翊鈞就立在御榻的右邊。明穆宗抓住高拱的手，臨危託孤，“以全國使先生勞累”。司禮監太監馮保宣讀給太子朱翊鈞的遺詔： “遺詔與皇太子。朕不行了，皇帝你做。一應禮儀自有該部題請而行。你要依三輔臣並司禮監輔導，進學修德，用賢使能，無事荒怠，保守帝業。”三位大學士受託之後，掩淚而出。 五月二十六日，明穆宗即崩於乾清宮。六月初十，皇太子朱翊鈞正式即位，次年改元萬曆。
萬曆皇帝繼位伊始，大學士高拱馬上呈進新政五事，要求其御門聽政，親答奏請，面見輔臣，議處要事，且一應章奏覽後俱鬚髮送內閣看詳擬票，杜絕內批留中。 雖然高拱的本意在於“以主上幼沖，懲中官專政，條奏請詘司禮權，還之內閣”， 但仍可看出他對於幼年皇帝朝夕訓誨的急迫心情，初衷未為不妥。然而當時正值主少國疑之際，“上沖年在疚，拱默受成於兩宮，權不自製，惟恐外廷之擅”。 在讀書方面，朱翊鈞也是從一開始就堅持按照祖宗舊制，舉日講，御經筵，讀經傳、史書。在明朝的眾皇帝中，除明太祖朱元璋之外，像朱翊鈞那樣確實是不多見的。朱翊鈞即位後，就按照內閣首輔張居正的建議，每天於太陽初出時就駕幸文華殿，聽儒臣講讀經書。然後少息片刻，復回講席，再讀史書。至午飯完畢時始返回宮內。只有每月逢三、六、九常朝之日，才暫免講讀。除此之外，即使是隆冬盛暑亦從不間斷。
內閣爭紛
朱翊鈞即位時，一個突出的問題就是內閣紛爭傾軋，整個朝廷也沒有能夠挽回嘉靖一朝的積弊。 這個社會問題，以後變得更為激烈。按照明穆宗的布置，高拱是外廷的顧命大臣中排名最前的；在宮中，朱翊鈞自然依靠馮保。但是，馮保與高拱的關係非常惡劣。此前，司禮監掌印太監職位空缺，高拱先後推薦了陳洪、孟沖，就是不願讓馮保做掌印太監。神宗自己在登極詔中也命令他們：朕方在沖年，尚賴文武親賢，“共圖化理”，“與民更始”。
明神宗 馮保此人知書達禮，又有文藝素養，所以很受明穆宗的喜愛。馮保利用皇權更迭之間的權力真空，通過遺詔驅逐了政敵孟沖，親自任司禮監掌印太監。而此時的內閣首輔高拱也對馮保欲除之而後快，在高拱的授意下，工科都給事中程文、吏科都給事中雒遵、禮科都給事中陸樹德都開始彈劾馮保。由此，一場政治鬥爭勢必不免，鬥爭中，衝突雙方是馮保和高拱，而張居正表面上是幫助高拱的。但實際上，張居正與馮保關係非常密切，早就預謀趕走高拱。
明穆宗末年，高拱為內閣首輔。神宗即位之後，高拱“才略自許，負氣凌人”， 恰恰觸犯了“自負付託之重，專行一意，以至內猜外忌” 的為臣大戒，最終在官場角逐中失利。人事變更的結果，張居正依序升為內閣首輔，責無旁貸地肩擔起培養萬曆皇帝的重任。而此次政治震盪對幼小的萬曆皇帝產成的刺激也頗為深刻：“專權之疑，深中帝心，魁柄獨持，以終其世。晚雖倦勤，而內外之間，無復挾恣意如初年者。主術所操，為得其大也。” 而且高拱為人性格執拗，出言偏頗。明穆宗去世時，高拱以主幼國危，痛哭時說了一句：“十歲太子如何治天下。”神宗即位後，馮保將這句話加以歪曲，改成“高公講，十歲小孩哪能決事當皇帝”。神宗聽到這話，“專權之疑，深中帝心”。於隆慶六年（1572）六月十六日將他免職，以張居正取代他的位置。此後神宗在位四十八年，始終堅持自操威柄。他說過“若用舍予奪，不由朝廷，朕將何以治天下！”
高拱一走，高儀也驚得嘔血三日而亡，三位內閣顧命大臣中只剩下張居正一人。同時，在經濟和政治方面的問題也堆積如山。面對著這些重重的困難，這個萬曆帝沒有畏縮不前，為了“皇圖永固”，他以“少年天子”的氣派，牢牢抓住“用人唯我”、生殺予奪在朝廷這根權柄，勵精圖治，推行新政，朱翊鈞在位前十年中很有所作為。
勵精圖治
張居正為內閣首輔以後，朱翊鈞將內廷的事務托給馮保，“而大柄悉以委居正”。 對張居正不僅委以重任，而且尊禮有加，言必稱“元輔張先生”，或“張先生”，從不直呼其名。隆慶六年（1572）六月十九日，張居正剛剛走馬上任幾天，朱翊鈞就在平台（即後左門）單獨召見他，共商大計。由於明穆宗在位從沒有召見過大臣，所以這事在當時曾引起轟動，使廷臣看到朱翊鈞承業治國的精神和決心，又大大提高了張居正的威信。
朱翊鈞從思想上到行動上，全力支持張居正，合力進行改革，推行萬曆新政。政治改革的主要措施，是萬曆元年（1573）推行的章奏“考成法”。它是針對官僚作風和文牘主義而提出的，意在“尊主權，課吏職，信賞罰，一號令”，提高朝廷機構辦事效率。按照考成法的要求，事必專任，立限完成；層層監督，各負其責。神宗說：“事不考成，何由底績。” 其時，因為朱翊鈞年幼，對祖制還不十分明白，不曉得箇中的利害關係。後來，他意識到張居正的權力過大，“幾乎震主”，這無疑是一個重要原因。
張居正所撰《帝鑒圖說》 經濟領域的改革，一是清丈全國田畝；二是推廣“一條鞭法”。萬曆六年（1578）十一月，朱翊鈞下令在福建行省進行試點。 至萬曆八年（1580）九月，福建“清丈田糧事竣”。 朱翊鈞與張居正因勢利導，趁熱打鐵，立即通行全國清丈。戶部奉旨就清丈範圍、職責、政策、方法、費用、期限等制定了八項規定，於同年十一月下發各地。至萬曆十年（1582）十二月，各省均按三年期限基本完成，總計支出新增一百四十餘萬頃。 推廣“一條鞭法”，是當時經濟改革的又一個重要舉措。萬曆九年（1581），一條鞭法已在全國各地“盡行之”。這標誌著整個張居正改革已經取得了重大勝利。
萬曆朝的前十年，在幼年朱翊鈞的支持下，張居正在政治上、經濟上進行大刀闊斧的改革，政府面貌煥然一新，經濟狀況也大為改善。萬曆十年（1582）六月，一代名臣張居正病逝，朱翊鈞從此開始親政。 這次改革，始於萬曆元年（1573），至萬曆十年（1582）基本結束。它是明中葉以來地主階級革新自救運動的繼續和發展，也是明後期政治、經濟關係新變動的深刻反映。其範圍，覆蓋政治、經濟諸方面。具體步驟是，前五年以政治改革為重點，後五年以經濟改革為主要任務。十年改革取得了非常大的成就，扭轉了正德、嘉靖兩朝以來形成的頹勢。
朱翊鈞親政後，主持了著名的“萬曆三大征”。先後在明王朝西北、西南邊疆和朝鮮展開的三次大規模軍事行動；分別為李如松（李成梁長子）平定蒙古人哱拜叛變的寧夏之役、李如松，麻貴抗擊日本豐臣秀吉政權入侵的朝鮮之役，以及李化龍平定苗疆土司楊應龍叛變的播州之役，鞏固了漢家疆土。 後世有說明軍雖均獲勝，但軍費消耗甚鉅。而三大徵實際軍費則由內帑和太倉庫銀足額撥發，三大徵結束後，內帑和太倉庫仍有存銀。
萬曆怠政
萬曆十四年（1586）十一月，朱翊鈞開始沉湎於酒色之中， 身體虛弱，每況愈下。因此，朱翊鈞執政中後期，幾乎很少上朝。他處理政事的主要方法是通過諭旨的形式向下面傳遞。“萬曆三大征”中邊疆大事的處理，都是通過諭旨的形式，而不是大臣們所希望的“召對”形式。在三大徵結束之後，朱翊鈞對於大臣們的奏章的批覆，似乎更不感興趣了。同年，禮部主事盧洪春奏曰：朱翊鈞“日夜縱飲作樂”。從同年起，為爭立皇太子，演成了曠日持久的“國本之爭”。
萬曆《平番得勝圖》 明末官僚隊伍中黨派林立，門戶之爭日盛一日，互相傾軋。東林黨、宣黨、昆黨、齊黨、浙黨，名目眾多。 在東林黨爭無休無止之時，由於明神宗私愛貴妃鄭氏之子、福王朱常洵，堅持其王府莊田“務足四萬頃之數”，才肯讓其出京之國，於是在朝廷又掀起了一場長達七八年之久的福王莊田之爭。福王之國洛陽剛剛過了一年，萬曆四十三年（1615）五月初四日酉時，又發生了晚明歷史上著名的梃擊案，作案的是一個名叫張差的薊州男子，史稱“梃擊案”。起初，皇太子也以為“必有主使”。是時，鄭貴妃一再指天發誓，自明無他。朱翊鈞見事涉鄭氏，加上多年來人們一直議論他不善待皇太子，感到事情重大，怕火燒自己，很快就親自定張差為“瘋癲奸徒”，並命“毋得株連無辜，致傷天和”，只處決張差及與之有關的太監龐保、劉成二人。並特地為此於同月二十八日，一反常態，二十五年來第一次召見大臣，宣布他的命令，將此案草草收場。
因立太子之事與內閣爭執長達十餘年，最後索性三十年不出宮門、不理朝政、不郊、不廟、不朝、不見、不批、不講。 萬曆十七年（1589），朱翊鈞不再接見朝臣，內閣出現了“人滯於官”和“曹署多空”的現象。 至於貪財一事，朱翊鈞他在親政以後，查抄了馮保、張居正的家產，就讓太監張誠全部搬入宮中，歸自己支配。為了掠奪錢財，他派出宦官擔任礦監稅使，四處搜括民財。
萬曆二十五年（1597），右副都御史謝杰批評朱翊鈞荒於政事，親政後政不如初：“陛下孝順父母、尊祖、好學、勤政、敬天、愛民、節約開支、聽取意見、親人和賢人，都不能夠像當初一樣。” 以至於朱翊鈞在位中期以後，方入內閣的廷臣不知皇帝長相如何，于慎行、趙志皋、張位和沈一貫等四位國家重臣雖對政事憂心如焚，卻無計可施，僅能以數太陽影子長短來打發值班的時間。萬曆四十年（1612），南京各道御史上疏：“台省空虛，那些致力於廢除掉，皇上深居二十多年，從來沒有一個接見大臣，天下將要淪陷的憂慮。” 首輔葉向高卻說皇帝一日可接見福王兩次。萬曆四十五年（1617）十一月，“部、寺大官十缺六、七，風憲重地空署幾年，六科只剩下四個人，十三道只剩下五人。”
萬曆中期後雖然不上朝，但是不上朝之後並沒有宦官之亂，也沒有外戚干政，也沒有嚴嵩這樣的奸臣，朝內黨爭也有所控制，萬曆對於日軍攻打朝鮮、女真入侵和梃擊案都有反應，表示雖然忽略一般朝政，還是關心國家大事，並透過一定的方式控制朝局。
與世長辭
明定陵地宮 就在朱翊鈞宗晏處深宮，“萬事不理”，導致從內廷到外廷鬧得不可開交之際，遼東後金迅速崛起，不斷出兵南犯，向明軍發動進攻，遼東戰爭爆發。萬曆四十四年（1616）正月初一日，後金政權正式建國，終於成為明朝的主要威脅。自此明朝遼東的形勢也隨之每況愈下。尤其是經過東征援朝戰爭和礦稅使高淮亂遼以後，遼東邊防空虛，軍民困甚，供應艱難，加上明神宗用人不當，明軍屢屢敗北。
萬曆四十七年（1619）三月，薩爾滸之戰，明軍四路大軍，三路全軍覆沒，喪師九萬，敗局遂成。遼東戰爭每年約需銀四百餘萬兩， 朱翊鈞為了應付這筆龐大的軍費，自萬曆四十六年九月起，先後三次下令加派全國田賦，時稱“遼餉”。明末三餉（遼餉、剿餉、練餉）加派開始。加派非但無濟於事，反而激起了全國人民的強烈不滿，紛紛投入反對明朝的革命洪流。朱翊鈞自己也因此情緒低落，愁眉不展。
萬曆四十八年（1620）三月，朱翊鈞因長期酒色無節，加上遼東慘敗，國事困擾，終於病重不起。七月二十一日，神宗在弘德殿去世，終年五十八歲。二十二日發喪，二十三日頒布遺詔，命皇太子朱常洛嗣位。九月初十日尊諡號神宗范天合道哲肅敦簡光文章武安仁止孝顯皇帝，廟號神宗。十月初三日，安葬於定陵。
為政舉措
政治
• 官吏考核
•
萬曆初年的政治改革主要措施是“考成法”，是萬曆元年（1573）推行的。它是針對官僚作風和文牘主義而提出的，意在“尊主權，課吏職，信賞罰，一號令”，提高朝廷機構辦事效率。按照考成法的要求，事必專任，立限完成；層層監督，各負其責。明神宗說：“事不考成，何由底績。”其特點是改變國家機構的運作機制：以內閣監控六科，六科監控部院，部院監控地方撫按，最後使“部權盡歸內閣”。六科和部院原是直接向皇帝負責，把它們變為受內閣制約，聽從內閣指揮，實有悖於祖宗舊制，實質上是將一部分皇權轉移到內閣。這是張居正對明代官制的一次重大變革。
• 早朝制度
隆慶六年（1572），朱翊鈞即位，關於早朝這一儀式有了折中的變通辦法。根據大學士張居正的安排，一旬之中，逢三、六、九日早朝，其他日子則不朝，以便年輕的皇帝可以有更多的時間攻讀聖賢經傳。這一規定執行以來已近15年，越到後來，聖旨免朝的日子也越來越多。與此同時，其他的禮儀，如各種祭掃，皇帝也經常不能親臨而是派遣官員代祭。實際上，神宗的早朝，即使按規定舉行，較之前代，已經要省簡多了。首先是早朝的地點很少再在正殿，而且在一般情況下早朝人員都不經午門而集結於宣治門，所有駿馬馴象的儀仗也全部減免不用。其次，御前陳奏也已流於形式，因為所有陳奏的內容都已經用書面形式上達，只有必須讓全體官員所知悉的事才在早朝時重新朗誦一過。
• 清算張居正
張居正 從萬曆九年（1581）到萬曆十年（1582）間，張居正一直沒有請假，堅持辦公。次年二月，張居正舊病復發，雖然屢經名醫醫治，但是張居正自己也知道，自己“精力已竭”，“不過行屍走肉而已” ！萬曆十年（1582）六月二十日，張居正病逝。朱翊鈞為之輟朝一天，給予張居正崇高的待遇：諡文忠，贈上柱國銜，蔭一子為尚寶司丞，賞喪銀500兩。 然而，兩年之後的萬曆十二年（1584）八月，朱翊鈞在都察院參劾張居正的奏疏中批示道：“張居正誣衊親藩，侵奪王墳府第，管制言官，蒙蔽我聰明。專權亂政，欺騙主上忘恩負義，謀劃國家不忠。本會斷棺戮屍，念效勞有年，姑且免去全部法追論。”（即說張居正無視皇帝權威，鉗制言官，擅權亂政。）
這時候的張居正一家，已經被抄家。張府人口，一些老弱婦孺因為來不及退出被封閉於張府，餓死十餘口，張居正80歲的老母還是在首輔大學士申時行的請求下才留有一所空宅和10頃田地。張居正恐怕生前絕對不能想到，他死後竟然會遭到一手扶持的神宗如此無情的懲處。朱翊鈞這種一百八十度的態度轉變是他長久處於張居正約束下的發泄，同樣也是自己開始親政的基礎，推倒張居正，也就樹立了皇帝自己的權威。
軍事
• 平定哱拜
參見：寧夏之役
萬曆二十年（1592），哱拜和哱承恩父子在寧夏銀川反叛（哱拜是蒙古韃靼部人，降明以後做副總兵。他的兒子叫哱承恩，承襲父爵，做了指揮使），朱翊鈞果斷決定平叛。派去平叛的軍隊攻打了幾次都沒有取勝，萬曆皇帝又派李成梁的兒子李如松為總兵，率軍平叛。李如松派人決黃河水灌城，城外積滿了水，城被沖開一個口子；李如松乘勢下令攻城，一舉平息了哱拜之亂。
• 援朝抗倭
參見：萬曆韓戰
從萬曆二十年（1592）到二十七年（1599），朝鮮遭到日本侵略，王京陷落，八道失陷七道，僅靠近明朝邊境義州一帶尚存。 朝鮮危急，請求明朝援助，“請求援助的使者，在路上絡繹不絕”。朱翊鈞鑒於唇亡則齒寒，決定派兵到朝鮮，援朝抗倭。這場戰爭時斷時續，前後進行了七年多。最後，日本因豐臣秀吉去世，將侵朝日軍撤出朝鮮，明軍戰勝而歸。
• 勘定播州
參見：播州之役
萬曆十七年（1589），播州（播州就是今貴州遵義地區）宣慰司使楊應龍發動叛亂， 朱翊鈞派兵平叛。這場戰爭時斷時續，一直到萬曆二十八年（1600），最後的結局是明軍八路進兵，四月告捷，平息了楊應龍之亂。
• 用兵女真
萬曆四十六年（1618年）四月十三日，建州女真首領努爾哈赤發布“七大恨”，起兵反明，建立後金政權。女真兵克撫順，朝野震驚。 萬曆四十七年（1619），遼東經略楊鎬四路進攻努爾哈赤，在薩爾滸之戰大敗，死四萬餘人，開原和鐵嶺淪陷，首都燕京震動。朱翊鈞用熊廷弼守遼東，屯兵築城，才稍稍將東北局勢扭轉。
經濟
• 清丈田畝
魚鱗圖冊 清丈田畝又稱“清丈田糧”，目的是為了糾正田制混亂。這是繼朱元璋之後進行的又一次全國性的土地大清丈。朱元璋時期那次大清丈，與“賦役黃冊”相配套，編造了“魚鱗圖冊”，為明代田賦徵收奠定了基本框架。到了明中葉以後，“魚鱗圖冊”已面目全非，賦役征派日益不均，國家賦稅收入越來越少，“私室日富，公室日貧，國匱民窮”，田畝已是非清不可了。同明代其他重要經濟改革一樣，這次清丈也是首先從東南沿海地區搞起來的。
明神宗郊祀天壇 萬曆六年（1578）十一月，朱翊鈞下令在福建試點。 中心問題是為了改變有田者不交納稅糧、無田者苦於賠納的怪現象，使田畝與稅糧掛鈎。由於朱翊鈞態度明確，張居正指導得力，堅決排除阻力，試點工作進行得頗為順利。至萬曆八年（1580）九月，福建清丈田糧的事務告竣之後。神宗與張居正因勢利導，趁熱打鐵，立即通行全國清丈。戶部奉旨就清丈範圍、職責、政策、方法、費用、期限等制定了八項規定，於同年十一月下發各地。至萬曆十年（1582）十二月，各省均按三年期限基本完成，總計支出新增一百四十餘萬頃。有些地方還重新編造了“魚鱗圖冊”。是明代田制與賦制的又一次綜合整治，成績顯著。缺點是有些地區為“求畝多”，不實事求是，用小弓丈量，以致出現新的“虛額”，加重小民負擔。
• 一條鞭法
鞭，又稱“一條邊”、“條邊”、“一條編”、“條編”等。其視點是變通賦與役的徵收方法。它和清丈田畝一樣，也是在嘉靖、隆慶以來各地逐步試行的基礎上發展起來的。明神宗的功勞，是支持把它推廣到全國，實現了中國古代賦役史上一次偉大的變革，為實行貨幣地租創造了條件。
一條鞭法，“總括一州縣之賦役，量地計丁，丁糧畢輸於官。一歲之役，官為僉募。力差，則計其工食之費，量為增減；銀差，則計其交納之量，加以增耗。凡額辦、派辦、京庫歲需與存留、供億諸費，以及土貢方物，悉並為一條，皆計畝征銀，折辦於官，故謂之一條鞭” 。其基本精神與特點是把賦與役合併，簡化徵收手續，擴大了折色範圍，改變了以往的徵收方法。它的推行，是中國封建社會晚期生產關係與生產力發展變化的反映。萬曆九年（1581），一條鞭法已在全國各地“盡行之”。
• 礦監稅使
明神宗 自張居正死後，朱翊鈞開始通過向各地徵收礦稅銀的方式，增加內庫的內帑。在此以前，內庫主要收入為金花銀，即依靠南直隸地區的田賦。不過內庫所有收支最終仍由戶部負責，並對皇帝的使用進行嚴格的干預和管理。礦稅銀除補貼內帑用於宮廷膳食以外，更多則用於國家開支，尤其是邊鎮用錢。如萬曆二十年（1592）十一月初四日，甘肅巡撫田樂上疏，因河西地區邊疆用兵需數十萬錢糧，請撥內帑，朱翊鈞批覆同意。萬曆二十七年（1599）十二月十二日，戶部因京師庫銀減少，邊餉告急，請神宗撥內帑，朱翊鈞雖然責怪戶部未提前做好庫銀儲備，並且不要因為有內帑而有恃無恐，但仍迅速撥發內府庫銀救急。萬曆三十一年（1603）四月，戶部更是因北部邊疆兵餉告急，請撥內帑百萬兩，朱翊鈞最顧及邊情，所以同意照數撥用。
另外，含礦稅銀的內帑也用於國家救災，如萬曆二十二年（1594）三月初九日，因河南饑荒，撥內帑三萬三千兩用於賑災。
文化
• 改革學校
學校為養士基地，“人才所系”。為了培養新的人才，萬曆二年（1574），神宗命令吏部嚴格選用提學官。次年三月，張居正進呈《請申舊章飭學政以振興人才疏》，提出選用提學官和整頓學校的十八條方案。神宗以為“深切時弊”，下詔命“各官著實遵行”， 並大量裁減府、州、縣學的學生數。在明代，“科舉必由學校”。人口不斷增加，學校招生人數反而減少，不但與社會發展大勢背道而馳，對於那些追求功名利祿者更是當頭一棒。明神宗還根據張居正的建議，詔毀天下書院，迫害士人，實行文化專制。這些都是倒退行為，所以，一開始就遭到激烈反對，難以貫徹執行。張居正本人更為此付出了沉重代價：大邑士子多怨之，或謂他“千慮一失，在汰郡縣諸生”， 成為後來慘敗的禍根之一。
外交
• 西學東漸
萬曆時期來華的利瑪竇 萬曆年間，西方傳教士紛紛來華傳播基督教，使得中西之間文化上得到交流。萬曆二十八年十二月二十二日（1601年1月25日），利瑪竇覲見了朱翊鈞。向朱翊鈞進呈自鳴鐘、聖經、《萬國圖志》、大西洋琴等方物，得他的信任。 利瑪竇還把封面燙金、裝訂精美的地圖集《地球大觀》送給他，告訴他，從這部地圖集上，可以看到他從西方來到中國途經的路徑。
同年，朱翊鈞下詔允許利瑪竇等人長居北京。之後利瑪竇在北京以豐富東西學識，結交中國的士大夫。常與賓客談論天主、靈魂、天堂、地獄。同時編撰新書，包括以中文寫成的《二十五言》等，得到不少中國知識分子的尊重。到了1605年，北京已有200人信奉天主教，當中有數名更是公卿大臣。這當中最著名的，也是後來影響最大的是進士出身的翰林徐光啟。
除利瑪竇外，明末來中國的著名傳教士還有義大利人熊三拔、艾儒略，日耳曼人湯若望，瑞士人鄧玉函，西班牙人龐迪我等。
荷蘭約道庫斯·洪第烏斯編制的萬曆三十八年明朝版圖 這些傳教士在中國傳播西方天文、數學、地理等科學技術知識。對於當時中國社會經濟文化的發展起了一定的促進作用，對於中國士大夫階層中的少數先進分子，起了一種喚醒的作用。 對中西交流作出了重要貢獻，傳教士把在中國所經歷的寫到西方去，引起西方巨大的反響，對日本和朝鮮半島上的國家認識西方文明也產生了重要影響。
• 中英交流
萬曆二十四年（1596），時任英國女王伊莉莎白一世寫了一封親筆信，派使者約翰·紐伯萊帶給明朝萬曆皇帝，信中表達了英中兩國更好開展貿易往來的願望。可惜的是，約翰·紐伯萊在途中遭遇不幸，雖然信件沒有丟失，但卻成了伊莉莎白一世的終身遺憾。此後，信件被英國國家博物館收藏。
人物評價
總評
朱翊鈞是明代歷史中在位最久的皇帝。明代歷史中以萬曆紀元的時間，持續將近48年之久。 明神宗在位期間，前十年奮發圖強，中間十年由勤變懶，最後近三十年“萬事不理”。他的主要特徵，是貪酒、貪色、貪財而又貪權，始終“魁柄獨持”，可謂操權有術，從這一點說，他不是一個庸人之輩。但他又缺乏明太祖、明成祖那樣的雄才大略。他即位於十六世紀七十年代初，終於十七世紀二十年代。當時，正是整個世界處於翻天覆地的大變動時期。中國封建社會也已經發展到晚期，“天崩地裂”，新的生產關係開始萌芽，生產力有了巨大發展，也同樣處於由古代社會向著近代社會轉型的劇變前夜。在這個歷史的大變動中，由於幾千年中國封建制度的頑症根深蒂固，加上他沉溺酒色、財貨的心理病態，非但未能使中國跟上世界新潮流，迎來新時代的曙光，相反在他的手裡把明朝推向絕境，加快了其終結的歷史進程。
史書評價
• 《明史》：①神宗沖齡踐阼，江陵秉政，綜核名實，國勢幾於富強。繼乃因循牽制，晏處深宮，綱紀廢弛，君臣否隔。於是小人好權趨利者馳騖追逐，與名節之士為仇讎，門戶紛然角立。馴至悊、愍，邪黨滋蔓。在廷正類無深識遠慮以折其機牙，而不勝忿激，交相攻訐。以致人主蓄疑，賢奸雜用，潰敗決裂，不可振救。故論者謂明之亡，實亡於神宗，豈不諒歟。②“論者謂：明之亡，實亡於神宗。”
歷代評價
• 當時的朝鮮使臣對神宗評價頗高，許篈這樣稱讚萬曆皇帝：今日臣等望見天威甚邇，龍顏壯大，語聲鏗鏘。 朝鮮使臣對萬曆皇帝執政前期的勤政是極為稱道的：因聞皇上講學之勤，三六九日，則無不視朝，其餘日則雖寒暑之極，不輟經筵。四書則方講孟子，綱目至於唐紀，日出坐殿，則講官立講。講迄，各陳時務。又書額字，書敬畏二字以賜閣老，又以責難陳善四字，賜經筵官，以正己率屬四字，賜六部尚書，虛心好問，而 聖學日進於高明。下懷盡達，而庶政無不修，至午乃罷，仍賜宴於講臣，寵禮優渥雲。嗚呼！聖年才至十二，而君德已著如此。若於後日長進不已，則四海萬姓之得受其福者。
• 沈德符評價萬曆皇帝少年的聰穎好學：昔英宗御極亦在幼沖，初不聞三楊諸公有此朝夕納誨，遂使王振得盜國柄，幾危宗社。則主上早歲勵精，真可只千古矣。
• 當時的禮部尚書馮琦在奏摺中評價萬曆皇帝執政後期的怠政：而方春秋鼎盛，正際中天之運。……此盛壯之年，正是理亂之會，若不將大小政務整頓一番，中外人心收拾一番，日復一日，盛年漸往，蠱惑益深，即欲挽不返之勢於倦勤之餘，亦無及矣。夫朝政未肅者，病在人情之惰，吏治未清者，病在士風之貪，君臣上下之睽者，病在行跡之疑，而其要在於服人心。陛下奈何以二百年固結之人心，一朝令其渙散至此乎？古稱成湯改過不吝，非是聖人無過，惟聖人乃能改過耳。漢武帝垂老而悔，唐德宗經亂而悔，千古更有何人？以聖主當盛年，一日不悔即漢唐，一日悔即堯舜。章疏可一日發，缺官可一日補，百姓所不便者可一日罷也。陛下何憚一日之發，不以成萬世之業，立萬世之名乎？
• 戶科給事中田大益曾忍無可忍地批評萬曆帝：“以金錢珠玉為命脈。”
• 朝鮮使臣李恆福曾評價神宗的窮奢極欲：窮極侈靡，以龍腦沉檀屑雜以椒末塗屋壁，又督珠市，盡納其珠，擇其大顆，絡為障子。又遣太監採珠於外，南方貢以珠，其重四兩，天下所貢無於此。此外大者不過三四錢，取之不遺餘力，長安市上龍腦。
• 民國歷史學家白壽彝評價：明神宗在位四十八年，前十年奮發圖強，中間十年由勤變懶，最後近三十年“萬事不理”。他的主要特徵，是貪酒、貪色、貪財而又貪權，始終“魁柄獨持”，可謂操權有術，從這一點說，他不是一個庸人之輩。但他又缺乏明太祖、明成祖那樣的雄才大略。
• 著名歷史學家范文瀾評價：神宗親政以後，獨攬大權，怠於政事而耽於享樂，日益揮霍侈靡，不知遏止。
• 歷史學家黃仁宇評價：總的來說，萬曆即位以後的第一個十年，即從1572年到1582年，為本朝百事轉蘇、欣欣向榮的十年。北方的“虜患”已不再發生，東南的倭患也已絕跡。承平日久，國家的府庫隨之而日見充實。
• 當年明月評價：剛滿二十歲的他躊躇滿志，雖然他不喜歡張居正，卻繼承了這位老師的志向。自從正式執政以來，一直勤奮工作，日夜不息，他似乎要用行動證明，憑著自己的努力，也能夠治理好這個國家，至少比那個人強。
• 許文繼、陳時龍評價：神宗朱翊鈞是明代歷史中統治最久的皇帝。他的一生可以分成三個階段：10歲到20歲，他只是一個象徵性的權威，凡事依大學士張居正而行；20歲以後，他開始親政，有一段時間勤於政務；後期怠於政事，酒色財氣，醉生夢死。
• 王宏鈞：萬曆前十年，大學士張居正輔助神宗處理政事，更張祖制，社會經濟發展較好。神宗20歲時，張居正逝世，朱翊鈞開始親政，有一段時間勤於政務，主持“萬曆三大征”，鞏固了漢家疆土。後期罷朝近30年。在這一時期內，江南一帶的商品經濟高度發達，出現了資本主義生產關係的萌芽，但是階級矛盾也日益加劇，文官集團的黨爭使得政治日益腐敗黑暗，東北的女真趁虛興起，因而種下了明朝滅亡的禍根。
• 崔瑞德《劍橋中國明代史》：萬曆皇帝聰明而敏銳；他自稱早慧似乎是有根據的。他博覽群書；甚至在他最後的日子裡，在他已深居宮廷幾十年，並已完全和他的官吏們疏遠了時，按照他時代的標準，他仍然博聞廣識。
軼事典故
父子親情
有一次明穆宗在宮中騎馬馳騁，朱翊鈞攔住馬對明穆宗說道：“父皇是天下的共主，萬一出了閃失，如何向天下交代呢？”明穆宗聽到這番話，趕緊下馬，抱起朱翊鈞走入宮中。
少時聰穎
神宗登基之初，就以他高貴的儀表給了臣僚們以深刻的印象。他的聲音發自丹田，深沉有力，並有餘音裊裊。從各種跡象看來，他確實是一個早熟的君主。他自己說過他在5歲時就能夠讀書，按中國舊時的計算方法，那時他的實足年齡僅在3歲至4歲之間。巴力儘管如此，在他御字之初，由於年齡太小，臨朝時還需要在衣袖裡抽出一張別人事先為他書寫好的紙片，邊看邊答覆各個官員的呈奏請示。他自然不能完全明白紙片上所寫答語的含義，而只是一個尚未成年的兒童在簡單地履行皇帝的職責。
交好大伴
慈聖皇太后與太監馮保都喜歡書法。所以，朱翊鈞很小的時候書法就極為工整。馮保在宮中，被皇帝稱作“伴伴”、“大伴”，小皇帝對於馮保非常畏懼。每次小皇帝與小太監玩的時候，看到馮保來了，就正襟危坐說：“大伴來了。”馮保的職責不但是對皇帝實行 一般的教育，有時還要代皇帝朱批。因此，他與張居正之間的聯繫要緊密一些。實際上，正因為內有馮保，外有張居正，萬曆初年的新政才能順利地推行。張居正對於朱翊鈞的輔導和關懷無微不至，他為皇帝安排了詳盡的視朝和講讀的日程表。大至朝廷用人之道，小至宮中的一些小節，張居正都要細細地與皇帝說。
呵護太岳
張居正身為輔臣，又是神宗的老師，自然有很大的權力，神宗對居正也是畢恭畢敬，言聽計從。史載“帝虛以委居正，居正亦慨然以天下為己任，中外想望風采。” 張居正所說所請，神宗大多稱善，並一一批准，就連神宗自己都說：“卿平日所言，朕無一不從。” 甚至慈聖太后決定的事，張居正覺得不可行，神宗也要按張居正的意思說服太后然後行之。
神宗對張居正的請求不僅能從之，而且對彈劾張居正的官員皆給予申飭#貶黜，萬曆四年春正月，“御史劉台劾大學士張居正專擅威福，如逐大學士高拱，私贈成國公朱希忠王爵，引用張四維、張翰為黨，斥逐言官余懋學、傅應楨，罔上行私，橫黷無厭。居正甚怒，見上辭政，曰：臣之所處者，危地也。言者以為擅作威福，而臣之所行，正威福也。將巽順以悅下耶？則負國。竭公以事上耶？無以逃端擅之譏。伏地不肯起。上下御座，手掖之曰：先生起，朕當則台以謝先生！詔下台獄，杖之百，遠戍之。”可見，神宗對張居正呵護有加。
喜愛讀書
自從張居正去世以後，萬曆脫出了翰林學士的羈絆；而自從他成為父親以來，慈聖太后也不再干預他的生活。但是，皇帝在這個時候確實已經成年了，他已經不再有興趣和小宦官去胡鬧，他變成了一個喜歡讀書的人。他命令大學士把本朝祖宗的“實錄”抄出副本供他閱讀，又命令宦官在北京城內收買新出版的各種書籍，包括詩歌、論議、醫藥、劇本、小說等各個方面。
明末三案
參見詞條： 明末三案
親屬成員
家世
• 祖父：世宗肅皇帝朱厚熜。
• 祖母：（追尊）孝恪皇后杜氏。
• 父親：明穆宗朱載垕。
• 生母：李貴妃，李彩鳳，神宗即位，尊稱慈聖皇太后。死後謚曰“孝定貞純欽仁端肅弼天祚聖皇太后”。
兄弟
• 長兄：朱翊釴，早亡。
• 次兄：朱翊鈐，早亡。
• 四弟：朱翊鏐，封潞王，與神宗同母。
后妃
皇后
• 孝端顯皇后王氏（1564年—1620）：神宗原配，名王喜姐，謚孝端貞恪莊惠仁明媲天毓聖顯皇后。
• 孝靖皇后王氏（1565年—1611）：謚溫肅端靖純懿皇貴妃。
皇貴妃
• 鄭貴妃（1565—1630），崇禎三年（1630）七月薨，謚曰恭恪惠榮和靖皇貴妃。
• 李貴妃（？—1597），即李敬妃，萬曆二十五年（1597）三月二十一日病薨。
妃
• 劉昭妃（1557年—1642），萬曆六年選美入宮的三人之一。
• 楊宜妃（？—1581），萬曆六年選美入宮的三人之一。
• 周端妃，萬曆十年（1582）選美入宮的“九嬪”之一。
• 榮妃王氏（？—1591），萬曆十年（1582）選美入宮的“九嬪”之一。
• 順妃常氏（？—1594），原是宮女，萬曆十一年封順妃。
• 順妃李氏（？—1623），萬曆三十二年（1604）八月冊封順妃。
• 德妃許氏（？—1602），萬曆十四年冊封為德妃，無出。
• 王僖妃（？—1589），本為低級妃嬪，無出。
嬪
• 李德嬪（1567年—1628）“九嬪”之一。河南開封府祥符縣人，生有四位公主。
• 魏慎嬪（1567年—1606）“九嬪”之一。大名府魏縣人，父錦衣衛正千戶魏承志。
• 邵敬嬪（？—1606）“九嬪”之一。直隸揚州府泰州人，父錦衣衛正千戶邵名。
• 張順嬪（1567年—1588）“九嬪”之一。河南開封府大康縣人，父張榛授錦衣衛正千戶。
• 梁和嬪（1562年—1643）“九嬪”之一。河南歸德府人，父錦衣衛正千戶梁慎。
• 李榮嬪（1568年—1626）“九嬪”之一。河南開封府祥符縣人，父李山授錦衣衛衣左所正千戶。
• 耿悼嬪（1568年—1589）估計是宮女進封的。直隸保定府安肅縣人，父耿大享，母王氏。
子女
• 皇子
1.長子朱常洛，明光宗，母孝靖皇后王氏。
2.次子朱常漵，邠哀王，母鄭皇貴妃（一說為常順妃），甫生即死。
3.三子朱常洵，福忠王，母鄭皇貴妃。
4.四子朱常治，沅懷王，母鄭皇貴妃，早夭。
5.五子朱常浩，瑞王，母周端妃。
6.六子朱常潤，惠王，母李皇貴妃。
7.七子朱常瀛，桂端王，母李皇貴妃。
8.八子朱常溥，永思王，母李順妃，早夭。
• 公主
1.長女榮昌公主朱軒媖，神宗第一女，母孝端皇后王喜姐。
2.次女雲和公主朱軒姝，神宗第二女，母鄭皇貴妃。
3.三女靜樂公主朱軒媯，神宗第三女，母榮妃。
4.四女雲夢公主朱軒嫄，神宗第四女，母孝靖皇后王氏。
5.五女仙居公主朱軒姞，神宗第五女，母李德嬪。
6.六女靈丘公主朱軒姚，神宗第六女，母鄭皇貴妃（一說為李德嬪）。
7.七女壽寧公主朱軒媁，神宗第七女，母鄭皇貴妃，二十七年下嫁冉興讓。
8.八女泰順公主朱軒姬，神宗第八女，母李德嬪。
9.九女香山公主朱軒嬁，神宗第九女，母李德嬪，
10.十女天台公主朱軒媺，神宗第十女，母李順妃。
史書記載
• 《明史·卷二十·本紀第二十》
• 《明史·卷二十一·本紀第二十一》
• 《明實錄·神宗卷》
人物爭議
參見詞條： 萬曆怠政
後人認為明朝的滅亡，萬曆帝有著不可推卸的責任。 史學家也認為正是由於萬曆帝的怠政，才導致明朝滅亡。當然，萬曆他的身體很差是他懶惰原因。考古工作者發掘埋葬萬曆的墓穴發現，“無論是棺內萬曆右腿蜷曲的痛苦形狀，還是屍骨復原後，右腿明顯比左腿短的情形，都足以說明這位皇帝生前確實患有嚴重的足疾。”而萬曆帝對大臣的指責他也解釋說自己身體不好。
這樣的身體條件，嚴重地妨礙到了他出席各項活動，他也就因此背負上了“怠政”的惡名。
陵寢墓地
明神宗朱翊鈞死後葬於明定陵。定陵位於北京昌平區，地面建築的總布局，呈前方後圓形，含有中國古代哲學觀念“天圓地方”的象徵意義。定陵早在萬曆帝生前就開始建設，萬曆十二年（1584）開工，歷時6年方完成，耗銀八百萬兩。陵墓建成時皇帝只有28歲，直到1620年才正式啟用，該陵墓整整閒置達30年之久。
定陵成為十三陵中最大的三座陵園之一。它的地面建築共占18萬平方米，前有寬闊院落三進，後有高大寶城一座。陵正門前方是三卒漢白玉石橋。過了橋是高大的碑亭。亭周圍有祠祭署、宰牲亭、定陵監等建築物300多間。再往後就是陵園最外面的圍牆—外羅城（圍牆外的圍牆）。
1958年，在夏鼐親自指導下進行的明定陵發掘，歷時兩年多順利結束。定陵是新中國第一座經國務院批准，有計畫、有組織、主動發掘的帝王陵墓，出土了大量珍貴的絲織品、玉器、金器等文物。然而，由於技術水平落後，無數奇珍異寶無法保存，發掘的絲織品變硬腐化，三口金絲楠木精製而成的巨大紅漆棺槨以及萬曆帝後的屍骨也在“文革”前後被紅衛兵和革命幹部遺棄及毀壞。
明定陵 影視形象
| 年份 | 影視 | 導演 | 演員 |
| 1986年 | 《努爾哈赤》 | 陳家林 | 孔志軍 |
| 2003年 | 《熱血忠魂之獨行侍衛》 | 吳子牛 | 陳思成 |
| 2006年 | 《皇上二大爺》 | 劉仕裕 | 周野芒 |
| 2007年 | 《大明王朝1566》 | 張黎 | 穆泓屹 |
| 2010年 | 《明宮迷案》（別名：明宮奇案/明宮夕照） | 孔笙 | 張晨光 |
| 2010年 | 《萬曆首輔張居正》 | 熊召政 | 梅年佳、王琦（幼） |
| 2010年 | 《大明嬪妃》 | 田少波 | 趙家林 |
中國歷代皇帝之明朝皇帝
| 姓名 | 諡號 | 廟號 | 在位時間 | 年號 |
| 朱元璋 | 開天行道肇紀立極大聖至神仁文義武俊德成功高皇帝 | 明太祖 | 1368年-1398年 | 洪武 |
| 朱允炆 | 嗣天章道誠懿淵功觀文揚武克仁篤孝讓皇帝 | 明惠帝 | 1398年-1402年 | 建文 |
| 朱棣 | 啟天弘道高明肇運聖武神功純仁至孝文皇帝 | 明成祖 | 1403年-1424年 | 永樂 |
| 朱高熾 | 敬天體道純誠至德弘文欽武章聖達孝昭皇帝 | 明仁宗 | 1424年-1425年 | 洪熙 |
| 朱瞻基 | 憲天崇道英明神聖欽文昭武寬仁純孝章皇帝 | 明宣宗 | 1425年-1435年 | 宣德 |
| 朱祁鎮 | 法天立道仁明誠敬昭文憲武至德廣孝睿皇帝 | 明英宗 | 1435年-1449年 1457年-1464年 | 正統 天順 |
| 朱祁鈺 | 恭仁康定景皇帝 | 明代宗 | 1450年-1457年 | 景泰 |
| 朱見深 | 繼天凝道誠明仁敬崇文肅武宏德聖孝純皇帝 | 明憲宗 | 1465年-1487年 | 成化 |
| 朱祐樘 | 達天明道純誠中正聖文神武至仁大德敬皇帝 | 明孝宗 | 1487年-1505年 | 弘治 |
| 朱厚照 | 承天達道英肅睿哲昭德顯功弘文思孝毅皇帝 | 明武宗 | 1505年-1521年 | 正德 |
| 朱厚熜 | 欽天履道英毅神聖宣文廣武洪仁大孝肅皇帝 | 明世宗 | 1521年-1566年 | 嘉靖 |
| 朱載垕 | 契天隆道淵懿寬仁顯文光武純德弘孝莊皇帝 | 明穆宗 | 1567年-1572年 | 隆慶 |
| 朱翊鈞 | 范天合道哲肅敦簡光文章武安仁止孝顯皇帝 | 明神宗 | 1572年-1620年 | 萬曆 |
| 朱常洛 | 崇天契道英睿恭純憲文景武淵仁懿孝貞皇帝 | 明光宗 | 1620年8月~1620年9月 | 泰昌 |
| 朱由校 | 達天闡道敦孝篤友章文襄武靖穆莊勤悊皇帝 | 明熹宗 | 1620年-1627年 | 天啟 |
| 朱由檢 | 紹天繹道剛明恪儉揆文奮武敦仁懋孝烈皇帝 | 明思宗 | 1627年-1644年 | 崇禎 |
