治療方式
少數肛周膿腫用抗生素，熱水坐浴及局部理療等可以消散，但多數需要手術治療，手術有兩種方式。
(一)單純性膿腫的治療
可在截石位或側臥下，用局麻或腰麻，在膿腫部位做放射狀切口，放出膿液後，伸入食指探查膿腔大小，分開其間隔。必要時將切口邊緣皮膚切開少許，以利引流，最後用凡士林紗條放入膿腔做引流。
(二)膿腔與肛瘺相通的膿腫
可在切開膿腫後，用探針仔細檢查內口，然後切開瘺管，適當切除皮膚和皮下組織，內口周圍組織也稍加切除，使引流通暢。如內口較深，瘺管通過肛管括約肌，可採用掛線療法。以上手術優點是膿腫一期治癒，不再形成肛瘺。但在急性炎症中，找內口有困難時，不應盲目尋找，以免炎症蔓延或形成假道，僅做切開排膿，待形成肛瘺後，再做肛瘺手術。二期手術優點是效果準確，治癒率高。
值得注意的是，文獻報告肛門周圍膿腫單純切開引流治療也有些不再復發，如Hanley(1978)報導35%～40%無復發。Scoma(1974)34%無復發。Vasilevsky(1984)103例肛門直腸膿腫切開引流治療，隨訪1月至9年，括約肌間膿腫無復發，83例肛門周圍膿腫及9例坐骨直腸窩膿腫，11%發生復發膿腫，37%形成肛瘺。因此，一期手術不應作為常規手術，以免影響肛門功能。
術後護理
患者如果已行肛門直腸周圍膿腫手術，那么術後的護理及換藥即成為主要的治療手段，是關鍵所在。
所以患者應遵從醫囑，注意飲食，忌食辛辣刺激醇酒之品，多食瓜果蔬菜，以保持大便通暢。同時，便後堅持肛門坐浴，可用1:1000高錳酸鉀液或生理鹽水，或用中藥煎熬坐浴熏洗肛門，每次10～15分鐘。還要忌食生冷之物及油膩之品，以防發生腹瀉或糞渣堵塞肛竇。注意創面有無滲血，如敷料己被染濕應及時更換。
按醫囑補充液體或抗生素，或口服各類藥物。飲食以高蛋白、低脂肪為主，多喝湯湯水水，促進營養吸收。換藥時肉芽以新鮮紅活著為佳，如遇肉芽組織生長高出表皮，應作修剪;遇有創口橋形癒合或縫合創口有感染者，則應剝離敞開創口，或拆除縫線敞開創口。有掛線者，如術後7～9天掛線末脫落，做換線再掛處理，縫合創口以5～7天拆線為佳，還要注意保持創面的引流通暢，填塞凡士林紗條或藥條，應緊貼創面，內口應到位，以創面肉芽從下朝上、從內至外生長力最佳，這樣就能避免橋形癒合，獲得最佳的手術效果。可以配合服用一些中藥如人參皂苷rh2幫助術後恢復，消炎等。
