研究領域
以探索神經信息處理機制和發展疾病診斷與治療新方法為主要目標，研究方向主要包括：
認知神經信息處理機制的光學成像（認知光學成像）
組織光學（雷射與生物組織相互作用）與光子醫學診斷技術
分子光子學（生物分子成像與分析）
生物信息學(生物信息的獲取與處理,生物功能信息的整合、模擬與可視化)
多維顯微光學成像與生物醫學光譜學
醫學信息工程（醫院信息系統HIS與醫學圖像存檔與傳輸系統PACS）
數字X射線成像（醫學成像系統）
醫學圖像處理
科研實力
生物醫學光子學教育部重點實驗室依託布立頓·強斯（Britton Chance）實驗室（成立於1997年），先後承擔和完成了國家重點基礎研究發展規劃（973）前期研究項目、國家高技術研究發展計畫（863）、國家自然科學基金（含國家傑出青年科學基金、重點項目）、科技部、教育部、湖北省和武漢市等科學研究項目等20餘項。
實驗室得到了“211工程”的大力支持，擁有一批具有國際先進水平的儀器設備，其中包括：多光子激發雷射掃描顯微成像系統、弱光CCD成像系統、近紅外腦功能光學成像器、EPC_9光電聯合檢測系統、腦皮層內源信號光學成像系統、雷射散斑成像系統等，建立有教育部生物醫學光子學網上合作研究中心和分子生物學與細胞生物學實驗室，為科學研究提供了良好的基礎條件。
實驗室與美國賓夕法尼亞大學、麻省理工大學、哈佛大學、加州大學Irvine分校、德克薩斯農機大學、華盛頓大學、俄羅斯Saratov國立大學、德國洪堡大學、澳大利亞斯威本大學等建立了良好的合作關係，已有五十餘人次的國際知名專家學者來本實驗室合作研究或學術交流。在教育部“春暉計畫”重點高校項目的支持下，先後邀請留學回國人員訪問研究30餘人次。與國內重要科研單位如中國科學院神經科學研究所、計算所、自動化所、武漢物理與數學研究所，北京大學、清華大學等建立了良好的學術聯繫。
國際化與學科交叉是該實驗室的最大特點，實驗室非常重視不同學科知識的融合、強調團隊意識。研究隊伍專業背景覆蓋面廣，分別來自物理學、光學、控制科學、電子學、計算機、醫學、神經生物學、分析化學和心理學等學科，科研人員具有博士學位的比例超過50%。實驗室與美國賓夕法尼亞大學和澳大利亞斯威本大學進行人才聯合培養，特別是博士研究生的聯合培養。
實驗室一覽
多光子激發雷射掃描顯微成像實驗室
光學弱相干層析成像（OCT）實驗室
組織光譜與組織改性實驗室
雷射生物散斑成像實驗室
組織光學特性參數測量實驗室
生物超微弱發光實驗室
光子學腦功能成像實驗室
皮層內源信號光學成像實驗室
醫學影像系統實驗室
醫學圖像處理實驗室
光子生物醫學儀器實驗室
細胞生物學實驗室 分子生物學實驗室
教育部生物醫學光子學網上合作研究中心
管理條例
重點實驗室的科研管理分為學術委員會，實驗室主任，課題組長和組員。
重點實驗室學術委員會由實驗室獨立設立，委員13人（校內專家4人，校外專家9人）。委員會的性質是學術領導機構，負責決定：
①實驗室的研究與開放
②組織論文答辯及成果評價
③監督經費的使用。
實驗室主任經學校提名由教育部聘任，全面負責實驗室的工作。
組長由主任指定，負責具體的科研活動組織與協調，與組員共同進行科研開發。
組員為課題組的成員，在服從主任分配的前提下，根據研究興趣選擇課題，與課題組的其他成員一起按期完成科研項目。
實驗室的成果評價實行雙軌制：
論文在不違背保密原則前提下宜公開發表，論文發表數量和發表刊物水平作為衡量實驗室科技成果的一項指標，同時也是評價個人成績和給予獎勵的依據。
技術秘密以及研究方法等不能通過發表和申請專利的成果，經學術委員會評價後，認為有較大實用價值給予相關人員以獎勵。
開放：實驗室圖書資料和配套儀器設備經主任許可對外開放，資源共享，國內研究人員在學術委員會確定的研究計畫內，可申報研究項目來本實驗室工作。培養有志於生物醫學光子學領域研究的碩士生和博士生。
流動：接受客座研究員和短期訪問學者，定期邀請國內外學者進行學術研究和交流，安排研究人員國外進修。
聯合：與國內外同行合作研究和聯合培養人材，與企業共同進行套用研究開發，接受橫向課題，與企業進行產學研結合，以技術入股等形式投資成立有限責任公司。
競爭：依託虛擬研究中心，緊跟國際最新動態，確定生物醫學光子學尚未研究的空白領域，集中力量進行研究，利用學校工科優勢，運用電子通信技術與自動化技術與生物醫學結合，占領生物醫學光子領域的制高點。
科研項目
| 項目類型 | 項目名稱 | 批准號 | 項目負責人 | 項目承擔單位 |
| 國家高技術研究發展計畫（863計畫） | 腦認知過程中神經活動高分辨光學成像新方法研究 | 2007AA02Z303 | 李鵬程 | 華中科技大學 |
| 國家自然科學基金（儀器專項） | 亞微米水平基因表達解剖圖譜成像裝置研製 | 30727002 | 駱清銘 | 華中科技大學 |
| 國家自然科學基金 | 用光學成像技術研究光透明劑對組織功能的影響 | 30770552 | 朱 丹 | 華中科技大學 |
| 國家自然科學基金 | 腫瘤治療早期效應分子事件的多光子在體成像 | 30770525 | 張智紅 | 華中科技大學 |
| 國家自然科學基金 | 用雙光子成像研究海馬區γ振盪的機制 | 30700215 | 周 煒 | 華中科技大學 |
| 國家自然科學基金 | 轉基因小鼠大腦神經元結構和分布的三維可視化 | 30700214 | 劉 謙 | 華中科技大學 |
| 國家自然科學基金 | 基於超連續光譜的全光纖非線性內窺成像的研究 | 60708025 | 付 玲 | 華中科技大學 |
| 國家高技術研究發展計畫（863計畫） | 小動物活體光學分子成像裝置 | 2006AA020801 | 駱清銘 | 華中科技大學 |
| 國家高技術研究發展計畫（863計畫） | 基於數字人體的生理組學研究與套用 | 2006AA02Z343 | 曾紹群 | 華中科技大學 |
| 國家自然科學基金 | 基於細胞光學揀選的微流控晶片膜片鉗研究 | 30570468 | 劉筆鋒 | 華中科技大學 |
| 國家自然科學基金 | 內皮質Endothelin-1誘導皮層擴散性抑制的在體光學成像研究 | 30500115 | 李鵬程 | 華中科技大學 |
| 國家自然科學基金 | 小鼠體內蛋白酶活性的在體擴散光學層析分子成像 | 90508003 | 駱清銘 | 華中科技大學 |
