主要職責
根據市政府辦公室《印發珠海市交通局職能配置、內設機構和人員編制規定的通知》（珠府辦[2001]150號），市交通局主要職責是：（一）貫徹執行國家有關交通行業的方針政策和法律法規，擬訂全市交通行業發展戰略、政策和法規、規章，並監督實施。
（二）擬訂全市交通行業發展和建設規劃；負責交通建設項目的審（報）批、交（竣）工驗收；組織交通重點工程建設的實施和監督管理。
（三）負責交通規費及公路、橋樑、隧道通行費收費站（點）的行業管理，會同有關部門制定交通規費徵收和管理辦法並組織實施。
（四）對交通運輸市場和交通基本建設市場實施監督、管理和調控；監督運輸企業經營行為和服務質量；維護交通行業平等競爭秩序；引導交通運輸企業最佳化結構、協調發展。
（五）制定交通的運力投放額度和年度運行調控計畫；負責路政、運政管理及其行政執法；負責客貨運站場、客貨運代理、汽車租賃、搬運裝卸、汽車與機車維修業、汽車美容護理、營運汽車綜合性能檢測、經營性停車場（點）等服務行業管理。
（六）負責組織實施交通戰備、救災、搶險等政府指令性物資的運輸，做好各種運輸協調工作。
（七）負責全市機動車駕駛學校和駕駛員培訓及交通職業培訓的行業管理工作。
（八）負責交通行業科技信息推廣和運用的協調工作；指導、監督交通行業技術標準和規範的實施；負責行業的統計、匯總；指導行業協會的工作；負責協調和組織交通招商引資和對外經濟技術交流與合作。
（九）實施行業安全生產管理，負責交通工程的質量監督與管理。
（十）承辦市人民政府和上級主管部門交辦的其他事項。
內設機構
交通局內設辦公室、人事監察科、政策法規科、規劃建設科、綜合運輸科、安全技術科、通信民航科等7個職能科室。（一）辦公室
主要職責：負責文秘、檔案、宣傳、信息、信訪、保密、督辦、調查研究、機關安全保衛、接待和後勤管理等事務；負責宣傳、機關作風建設、社會治安治理；負責本機關財務管理和內部審計工作；負責交通規費徵收和監管工作。（二）人事監察科
主要職責：負責黨務、紀檢監察、體制改革、人事調配、幹部監督、機構編制、勞動工資、技術職稱聘用、社會保險、離退休人員管理和徵兵等工作；負責工會、共青團、婦女和計畫生育工作；負責出國（境）證件報批管理；負責精神文明建設和職業培訓工作。（三）政策法規科
主要職責：擬訂全市的交通政策和法規並組織實施；指導行業的法制工作；負責普法和執法聽證；負責交通行政複議和執法監督工作；承辦交通行政訴訟案件，負責治理公路“三亂”工作及交通稽查工作。（四）規劃建設科
主要職責：制定全市交通行業發展的中長期規劃、建設規劃和編制年度計畫並組織實施及檢查監督；負責交通建設項目的審（報）批、交（竣）工驗收；負責交通工程的質量、安全監督與管理；負責交通設計諮詢、監理、施工資質諮詢登記的審（報）批；負責組織協調交通重點項目的建設。（五）綜合運輸科
主要職責：負責全市公路、水路、鐵路、管道、城市公共運輸的監督、管理和調控；編制全市客貨運輸中長期規劃和年度運力投放額度計畫；負責交通運輸運力投放的管理；負責營運車輛、船舶出入境運輸項目管理；負責全市公共運輸項目、規劃運力線網的管理；負責監督、檢查行業經營行為、服務質量和全行業統計及經濟分析工作；負責上級交辦的搶險救災等指令性任務；負責指導行業協會的工作。（六）安全技術科
主要職責：負責協調交通行業安全生產工作；負責汽車、機車維修業開業、變更業務的核准和經營資質管理；負責船舶維修企業的初審；評定車輛技術等級，管理車輛二級維護和綜合性能檢測；管理審批機動車駕駛學校，監督駕駛員培訓教學質量；指導交通技術改造；會同有關部門監督環境保護法規的貫徹執行。
（七）通信民航科（加掛珠海機場管理委員會辦公室牌子）
主要職責：負責修訂地方民航業發展規劃；負責全市民航業的綜合管理和統籌協調與監督工作；負責有關發展地方通用航空服務項目、外地駐珠海民航單位設定、航空運輸、航空貨運服務等審核工作；負責民航業業務統計；負責推進交通信息網路建設和套用系統開發的組織、協調、推廣工作。
交通戰備辦公室
交通戰備辦公室掛靠交通局，正處級，由交通局局長兼任該辦公室主任。主要職責是貫徹執行國家國防交通工作的方針、政策和法律、法規、規章，擬訂有關規定和計畫並組織實施；指導交通戰備系統的國防交通工作，協調處理有關問題；為軍事行動和其他緊急任務組織交通保障。交通運輸局直屬職能
一、珠海市道路運輸管理處
受交通局委託，組織徵收公路運輸管理費；負責道路運政管理；負責跨市和市區內運輸車輛的運力投放及線路管理；負責全市客貨運輸、營業性貨運站場、機動車維修、檢測、汽車租賃、公路運輸服務、搬運裝卸、機動車駕校和駕駛員培訓等行業管理。二、珠海市水上運輸管理處
受交通局委託，負責組織徵收水路運輸管理費；負責水路運政管理；負責跨市、涉外水運企業和船舶、運力投放及航線管理；負責對全市水路客貨運輸和水路運輸服務業以及鄉鎮船舶修造業實施行業管理。三、珠海市金灣交通管理總站
受交通局委託，負責轄區內交通規費征稽；負責轄區內路政、運政管理及行政執法工作；負責金灣區內的道路客貨運輸、搬運裝卸業、車輛維修業、駕駛員培訓業、水水客貨運輸、水路運輸服務業以及鄉鎮船舶修造業等行業管理。四、珠海市交通工程質量監督檢測站 受交通局委託，負責對公路、水運工程質量進行監督管理、核驗和檢測；行使交通工程質量監督行政職能；審查承建我市公路、水運工程勘察、設計、施工和監理檢測單位的資質，協助做好監理單位和人員的資質考核工作。負責對公路水運工程質量進行監督管理；行使交通工程質量監督職責；宣傳貫徹國家、省交通主管部門有關交通建設工程造價管理的方針政策和法律法規；制定交通建設工程造價監督計畫，編製造價監督檢查報告；負責交通建設工程造價管理工作，審核交通建設工程的投資決算、工程預概算、工程招標標底、竣工結算，為交通主管部門提供決策依據；負責對交通建設項目投資執行情況、工程費用支付情況進行監督檢查；負責交通建設項目施工定額管理和造價信息資料管理工作；負責交通建設工程造價糾紛的調解工作，為解決糾紛提供鑑定意見。
