朱冰[中國科學院生物物理研究所研究員]

朱冰，男，博士，中國科學院生物物理研究所、生物大分子國家重點實驗室研究員、博士生導師，創新課題組組長。研究方向：表觀遺傳學。

簡歷

朱冰，男，博士，中國科學院生物物理研究所、生物大分子國家重點實驗室研究員、博士生導師，創新課題組組長。

教育經歷

1999年中國科學院上海植物生理研究所分子遺傳學博士
1995年中國水稻研究所遺傳學碩士
1992年浙江大學生物科學與技術系學士

工作經歷

2014年-中國科學院生物物理所研究員
2011-2014年北京生命科學研究所高級研究員
2006-2011年北京生命科學研究所研究員
2002-2006年美國霍華德-休斯醫學院/新澤西醫學與牙醫學大學/羅伯特-伍德-詹森醫學院，DannyReinberg博士實驗室博士後
1999-2002年瑞士弗雷德里克-米歇爾研究所，Jean-PierreJost博士實驗室博士後

研究概述

研究方向：表觀遺傳學。表觀遺傳學的可塑性和可繼承性
多細胞生物的多種細胞類型擁有同一基因組體，卻各不相同，並擁有各自獨特的基因表達譜。這被認為是由表觀遺傳學機制實現的對DNA承載的遺傳信息的精細調控。表觀遺傳學信息需要同時具有可塑性和一定的可繼承性，以確保不同類型細胞可以得到分化，又可以在分化後維持穩定。本實驗室的研究興趣為：
1.表觀遺傳信息的建立與維持機制
多種組蛋白修飾和DNA甲基化是經典表觀遺傳現象的重要調控因子，本實驗室試圖通過結合生物化學，定量蛋白質組學，高通量基因組分析和高通量篩選來鑑定並理解參與表觀遺傳信息的建立與維持的新機制。
2.染色質修飾酶的活性調節
大量的染色質修飾酶已被鑑定，但對它們催化活性的調節機理研究較少。染色質修飾酶常被認為是機械性的催化機器，然而近期的研究表明染色質修飾酶更可能是聰明的藝術家，可以視基因轉錄狀態的不同和染色質環境的不同調節自己的活性，以譜寫不同的修飾曲調。對染色質修飾酶活性調節的研究不僅有助於對表觀遺傳學機制的理解，也有助於更好的設計干預染色質修飾酶活性的小分子化合物。因為多個染色質修飾酶被認為是潛在的藥物靶標。

研究論文

1.　YuanG,MaB,YuanW,ZhangZ,ChenP,DingX,FengL,ShenX,ChenS,LiG,ZhuB.HistoneH2AUbiquitinationInhibitstheEnzymaticActivityofH3Lysine36Methyltransferases.JBiolChem.2013;288:30832
2.HuangC,ZhangZ,XuX,LiY,LiZ,MaY,CaiT,ZhuB.H3.3-H4tetramersplittingeventsfeaturecell-typespecificenhancers.PlosGenet.2013;9:e1003558
3.YangN,WangW,WangY,WangM,ZhaoQ,RaoZ,ZhuB,XuRM.Distinctmodeofmethylatedlysine-4ofhistoneH3recognitionbytandemtudor-likedomainsofSpindlin1.ProcNatlAcadSciUSA.2012;109:17954
4.YuanW,WuT,FuH,DaiC,WuH,LiuN,LiX,XuM,ZhangZ,NiuT,HanZ,ChaiJ,ZhouXJ,GaoS,ZhuB.DensechromatinactivatesPolycombrepressivecomplex2toregulateH3Lysine27methylation.Science2012;337:971
5.XuM,ChenS,ZhuB.Investigatingthecellcycle-associateddynamicsofhistonemodificationsusingquantitativemassspectrometry.MethodEnzymol.2012;512:29
6.XuM,WangW,ChenS,ZhuB.Amodelformitoticinheritanceofhistonelysinemethylation.EMBORep.2012;13:60
7.WangW,MaoZ,ZhangH,DingX,ChenS,ZhangX,ZhuB.NucleolarproteinSpindlin1recognizesH3K4me3andfacilitatesrRNAgenetranscription.EMBORep.2011;12:1160
8.YangP,WangY,ChenJ,LiH,KangL,ZhangY,ChenS,ZhuB,GaoS.RCOR2isasubunitoftheLSD1complexthatregulatesEScellpropertyandsubstitutesforSOX2inreprogrammingsomaticcellstopluripotency.StemCells2011;29:791
9.ChenX,XiongJ,XuM,ChenS,ZhuB.Symmetricmodificationwithinanucleosomeisnotgloballyrequiredforhistonelysinemethylation.EMBORep.2011;12:244
10.YuanW,XuM,HuangC,LiuN,ChenS,ZhuB.H3K36methylationantagonizesPRC2mediatedH3K27methylation.JBiolChem.2011;286:7983
11.WuH,ChenX,XiongJ,LiY,LiH,DingX,LiuS,ChenS,GaoS,ZhuB.HistonemethyltransferaseG9acontributestoH3K27methylationinvivo.CellRes.2011;21:365
12.XuM,LongC,ChenX,HuangC,ChenS,ZhuB.PartitionofhistoneH3-H4tetramersduringDNAreplication-dependentchromatinassembly.Science2010;328:94
13.JiaG,WangW,LiH,MaoZ,CaiG,SunJ,WuH,XuM,YangP,YuanW,ChenS,ZhuB.Asystematicevaluationofthecompatibilityofhistonescontainingmethyl-lysineanalogueswithbiochemicalreactions.CellRes.2009;19:1217
14.YuanW,XieJ,LongC,Erdjument-BromageH,DingX,ZhengY,TempstP,ChenS,ZhuB,ReinbergD.HeterogeneousnuclearribonucleoproteinLIsasubunitofhumanKMT3a/Set2complexrequiredforH3Lys-36trimethylationactivityinvivo.JBiolChem.2009;284:15701
15.MoniauxN,NemosC,DebS,ZhuB,DornreiterI,HollingsworthMA,BatraSK(2009)ThehumanRNApolymeraseII-associatedfactor1(hPaf1):anewregulatorofcell-cycleprogression.PLoSOne4:e7077
16.PavriR,ZhuB,LiG,TrojerP,MandalS,ShilatifardA,ReinbergD.HistoneH2BmonoubiquitinationfunctionscooperativelywithFACTtoregulateelongationbyRNApolymeraseII.Cell2006;125:703
17.AdelmanK,WeiW,ArdehaliMB,WernerJ,ZhuB,ReinbergD,LisJT.DrosophilaPaf1modulateschromatinstructureatactivelytranscribedgenes.MolCellBiol.2006;26:250
18.ZhuB,ZhengY,PhamAD,MandalSS,Erdjument-BromageH,TempstP,ReinbergD.MonoubiquitinationofhumanhistoneH2B:thefactorsinvolvedandtheirrolesinHOXgeneregulation.MolCell2005;20:601
19.ZhuB,MandalSS,PhamAD,ZhengY,Erdjument-BromageH,BatraSK,TempstP,ReinbergD.ThehumanPAFcomplexcoordinatestranscriptionwitheventsdownstreamofRNAsynthesis.GenesDev.2005;19:1668
20.JostJP,OakeleyEJ,ZhuB,BenjaminD,ThiryS,SiegmannM,JostYC.5-MethylcytosineDNAglycosylaseparticipatesinthegenome-widelossofDNAmethylationoccurringduringmousemyoblastdifferentiation.NucleicAcidsRes.2001;29:4452
21.ZhuB,BenjaminD,ZhengY,AnglikerH,ThiryS,SiegmannM,JostJP.Overexpressionof5-methylcytosineDNAglycosylaseinhumanembryonickidneycellsEcR293demethylatesthepromoterofahormone-regulatedreportergene.ProcNatlAcadSciUSA.2001;98:5031
22.ZhuB,ZhengY,AnglikerH,SchwarzS,ThiryS,SiegmannM,JostJP.5-MethylcytosineDNAglycosylaseactivityisalsopresentinthehumanMBD4(G/Tmismatchglycosylase)andinarelatedaviansequence.NucleicAcidsRes.2000;28:4157
23.ZhuB,ZhengY,HessD,AnglikerH,SchwarzS,SiegmannM,ThiryS,JostJP.5-methylcytosine-DNAglycosylaseactivityispresentinaclonedG/TmismatchDNAglycosylaseassociatedwiththechickenembryoDNAdemethylationcomplex.ProcNatlAcadSciUSA.2000;97:5135

特邀綜述

1.HuangC,XuM,ZhuB.Epigeneticinheritancemediatedbyhistonelysinemethylation:maintainingtranscriptionalstateswithoutthepreciserestorationofmarks?PhilosTransRSocLondBBiolSci.2013;368:20110332.
2.TalbertPB,AhmadK,AlmouzniG,AusióJ,BergerF,BhallaPL,BonnerWM,CandeWZ,ChadwickBP,ChanSW,CrossGA,CuiL,DimitrovSI,DoeneckeD,Eirin-LópezJM,GorovskyMA,HakeSB,HamkaloBA,HolecS,JacobsenSE,KamieniarzK,KhochbinS,LadurnerAG,LandsmanD,LathamJA,LoppinB,MalikHS,MarzluffWF,PehrsonJR,PostbergJ,SchneiderR,SinghMB,SmithMM,ThompsonE,Torres-PadillaME,TremethickDJ,TurnerBM,WaterborgJH,WollmannH,YelagandulaR,ZhuB,HenikoffS.Aunifiedphylogeny-basednomenclatureforhistonevariants.EpigenetChromatin2012;5:7
3.YuanG,ZhuB.Histonevariantsandepigeneticinheritance.BBA-GeneRegulMech.2012;1819:222
4.ZhuB,ReinbergD.Epigeneticsinheritance:Uncontested?CellRes.2011;21:435
5.WuH,ZhuB.Splitdecision:whyitmatters?FrontBiol.2011;6:88
6.XuM,ZhuB.Nucleosomeassemblyandepigeneticinheritance.ProteinCell2010;1:820
　

譯著

《表觀遺傳學》，科學出版社（2009）主譯：朱冰，孫方霖