官方算法
鐵道部舉例解釋：以CRH3C型動車組為例，該車定員556人，如果開行上海至南京直達列車，在上海有480人購票上車，上座率為480/556=86%。如果不是直達列車，該車在上海有480人上車，在蘇州停靠時下車400人、又上車100人並坐到終點，儘管到南京站時該車僅有180人，但是該趟車的上座率應計算為(480+100)/556=104%。
備註：由於高鐵列車中途停站，旅客有上有下，席位是可以復用的，所以上座率超過100%並不一定超員。
質疑
高鐵售票動態2011年8月初，鐵道部網站發布訊息，截至2011年7月31日，京滬高鐵運營一個月以來，共開行動車組列車5542列，日均179列；運送旅客525.9萬人，日均17萬人，平均上座率107%。
網友“JungleGym”發微博稱，我每次坐高鐵(次數不下50次)都有空座，滬寧高鐵也是周末尖峰時段才會滿員。我從未見過車廂里有站的乘客，不知107%數據從何而來？
網友“來看看123”說，“看到這個訊息著實讓我吃驚，不知道這個‘平均上座率’是如何計算的？我在7月26日乘坐G124次列車時看到的完全不是這么回事。二等座車廂里最多不會超過30%的座位上有人坐，一等座人更少，商務座只有3個座位有人。”
鐵道部回應
外界有人質疑，鐵道部關於“平均上座率”的數據與乘客的感受有差異。當時，鐵道部解釋說，中國鐵路運輸統計已經信息化，每一趟列車的旅客購票人數是計算機統計生成的，準確可靠。旅客之所以對上座率高低的感受不同，主要是由於每日、每月、每年的列車上座率是一個平均數，而每一趟列車的上座率是很不均衡的。
據媒體2010年報導，針對一些旅客反映的滬寧高鐵上座率如此之高，為什麼自己乘坐時車廂常常很空的質疑，鐵道部相關負責人曾分析說，首先，列車上座率是一個平均數，不同時間的列車上座率很不均衡；其次，高鐵車票銷售時，不會在首發站把所有車票銷售一空，會為中間車站預留一些席位以保證公平，因此也會出現上車後發現空車廂的現象。
專家觀點
“鐵道部統計數據不客觀”
湖北省統計局副局長葉青認為，鐵道部算法有問題，其中有水分，不客觀。從經濟角度來講，其上座率與票款收入也不對稱。同樣，也會讓乘客產生誤解。“107%的上座率聽上去挺唬人，但是實際上沒數據上那么多人。”
葉青提出，應該統計列車的有效上座率。具體公式為：
有效上座率=有效里程數/座位里程數。
備註：有效里程數：該座位有人乘坐時列車行駛里程數；座位里程數：該座位空置或有人時列車行駛里程數。有效上座率不會超過100%。
舉例：按照鐵道部的舉例，如果開行上海至南京直達列車，在上海有480人購票上車，上座率為480人×300公里/556人×300公里=86%。
如果不是直達列車，該車在上海有480人上車，在蘇州停靠時下車400人、又上車100人並坐到終點，到南京站時該車僅有180人。則該趟車的有效上座率=[(400人×100公里)+(80人×300公里)+(100人×200公里)]/556人×300公里=50.36%。
備註：據了解，上海至南京全長300公里，上海到蘇州約100公里。
