分子信標

分子信標（molecular beacon）是一種呈髮夾結構的莖環雙標記寡核苷酸探針，兩端的核酸序列互補配對，因此標記在一端的螢光基團與標記在另一端的淬滅基團緊緊靠近。螢光基團被激發後產生的光子被淬滅劑淬滅，由螢光基團產生的能量以紅外而不是可見光形式釋放出來。
分子信標的莖環結構中，環一般為15-30 個核苷酸長，並與目標序列互補；莖一般5-7 個核苷酸長，並相互配對形成莖的結構。螢光基團標記在探針的一端，而淬滅劑則標記在另一端。在復性溫度下，因為模板不存在時形成莖環結構，當加熱變性會互補配對的莖環雙鏈解開，如果有模板存在環序列將與模板配對。與模板配對後，分子信標將成鏈狀而非髮夾狀，使得螢光基團與淬滅劑分開。當螢光基團被激發時，因淬滅作用被解除，發出激發光子。由於是酶切作用的存在，分子信標也是積累螢光。常用的螢光基團：FAM ，Texas Red 。