授寧波教授。生平博覽群書,好宋代二程(程頤、程顥)之學;尤精醫,善用古方,稀用峻藥,常藥到病除。時人有非議者,而章炳麟則特意作《仲氏世醫紀略》一文贊之,稱“先生(昴庭)獨祖述仲景,旁及孫思邈、王燾之長,以近世喻、張、柯、陳四家語教人。病應湯輒效,人以為神。”時俞曲園疾病委身,恨俗醫下藥輒增人病,發憤作《廢醫論》,臥床以待天命。後延仲醫治,病始愈。不禁嘆曰:“道未絕也”。一次慈禧患病,御醫束手,召仲晉京診治,不久即愈。清廷欲留仲在朝侍醫供職,婉言請辭。遂命主浙江醫局。在任期間,治癒患者數萬人。撰有《本草崇源集說》3卷,附錄1卷,刊印於宣統二年(1910)。子仲佑長(以敬),繼承其父醫道,熟記所蓄方書,尤精傷寒,口占指數,條條可復,治病無猶豫。1920年,太炎久病,自治不愈,請佑長診治,將太炎自擬藥方略予增減,不日而愈。
仲學輅不但精醫,對故鄉水利事業也十分關心,著有《鍾邑苕溪險塘雜記》、《南北湖開浚記》等文。卒後葬於仲家村故里,後遷葬瓶窯鎮窯山。