生物學的KIR
定義
KIR(The killer cell immunoglobulin-like receptor),殺傷細胞免疫球蛋白樣受體。構成
KIR基因家族目前已知由15個基因和2個假基因組成。15個基因是KIR2DL1,KIR2DL2, KIR2DL3,KIR2DL4,KIR2DL5A,KIR2DL5B,KIR2DS1,KIR2DS2,KIR2DS3,KIR2DS4,KIR2DS5,KIR3DL1,KIR3DL2,KIR3DL3和KIR3DS1;兩個假基因是KIR2DP1和KIR3DP1。它們位於第19號染色體上的LRC(Leukocyte Receptor Complex)區域中,長度100-200Kb。LRC長度約1Mb,是一個快速進化的免疫相關基因的基因簇,這些基因編碼一些含胞外免疫球蛋白樣結構域的分子,如SIGLEC,liLR,LAIR,NCR1等等。KIR的基因結構
KIR基因長度從4到16Kb不等,包含有4到9個外顯子。根據基因結構,可以分為三組:1)KIR2D基因,編碼含有D1,D2兩個胞外結構域的蛋白;2)結構上變異的KIR2D基因,編碼含D0,D2兩個胞外結構域的蛋白;3)KIR3D基因,編碼含D0,D1,D2三個胞外結構域的蛋白。一型KIR2D基因,包括KIR2DL1-3,KIR2DS1-5,以及假基因KIR2DP1,由8個外顯子和一個無功能的外顯子3組成,這個無功能的外顯子在一型KIR2D基因中是沒有活性的,可能是由於位於內含子2和外顯子3接合處的一個核苷酸突變導致的。它的核酸序列與KIR3D的外顯子3保持了高度的一致性,並有一個典型的三聯鹼基的缺失。與其他的KIR不同,KIR2DL1和KIR2DL2在外顯子7中有一個共同的缺失,導致外顯子7變短。同樣,KIR2DL1-3跟KIR2DS1-5的唯一不同處在於他們編碼胞內域的外顯子9的長度。假基因KIR2DP1與KIR2DL1-3的不同處在外顯子4變短,因為單個鹼基對的缺失。
二型KIR2D包括KIR2DL4和KIR2DL5。不同與KIR3D和一型KIR2D,二型KIR2D並沒有外顯子4,但有一個有功能的可以被翻譯的外顯子3,,而一型KIR2D的外顯子3是不能被翻譯的。其中,KIR2DL4在外顯子1的長度上與KIR2DL5以及其他KIR有很大的不同。KIR2DL4中,外顯子1要多出6個核苷酸,導致了與其他KIR基因不同的初始密碼子。這個初始密碼子要比第二個初始密碼子(對應與其他KIR基因的初始密碼子)更加適合"Kozak transcription initiation consensus sequence"。
KIR3D有9個外顯子,包括了結構相關的KIR3DL1-3和KIR3DS1。KIR3DL2是所有KIR基因中序列最長的一個,全基因長16256bp,而cDNA也有1368bp。這四個KIR3D基因在編碼胞內域的外顯子9上不同。KIR基因編碼的蛋白的胞內域長度從23個胺基酸殘基(某些KIR3DS1等位基因)到116個胺基酸殘基。此外,相比KIR3DL1或者KIR3DL2,KIR3DL3的外顯子8的序列更加短,而且KIR3DL3的外顯子6完全缺失。KIR基因中最大的例外是KIR3DP1,它從外顯子6到外顯子9都完全缺失,偶爾外顯子2也會缺失,而剩下的部分的序列與其他KIR3D基因,特別是KIR3DL3的序列高度一致。
單倍型
KIR的單倍型LRC中的KIR基因組成了KIR的單倍型,KIR單倍型在KIR基因數量和類型上都不同。所有已知的KIR單倍型在著絲粒端都是KIR3DL3,在端粒端都是KIR3DL2,中心是KIR3DP1和KIR2DL4,這些是單倍型的骨架基因,把單倍體分成了兩個部分。所有的KIR基因按照從頭到尾的模式排列,兩兩相距約2.4Kb。許多KIR單倍型是在家系分析中確定的。根據KIR基因的不同可以把單倍體分為A,B兩種。原先單倍體的區分是用限制性片段長度多態性(RFLP)確定的,是基於一段約24Kb的HindIII片段(存在於單倍體B和KIR3DL5)。現在單倍體的區分是根據它還有的激活性和抑制性KIR基因的,單倍體A只有一個激活基因KIR2DS4和四個抑制性基因KIR2DL1,KIR2DL3,KIR3DL1和KIR3DL2。
單倍體B在基因數目上有更多的可變性。可以包含1到5個激活性KIR基因,如KIR2DS1-3,KIR2DS5和KIR3DS1,以及單倍體A中不包括的抑制性KIR基因,如KIR2DL2,KIR2DL5。用家族分離分析的方法確定了至少20中不同的B型單倍體。
內在的遺傳缺陷能夠導致一些KIR等位基因的無法轉錄,如假基因
KIR2DP1和KIR3DP1,以及一些KIR2DL5等位基因。此外,一些結構完整的KIR基因能轉錄,但在NK細胞表面的表達水平卻很低,原因到現在還不知道,比如KIR3DL3。最近的研究表明,一些KIR蛋白的胺基酸多態性導致了它們的 cytoplasmic retention或者formation of soluble variants(KIR3DL4*004和KIR2DS4*003)。KIR3DL1*004由於一個胺基酸的替換導致了D0域不能正確摺疊,所以不能表達在NK細胞表面。
KIR2DS4*003由於D2結構域後胺基酸序列的中斷(由於外顯子5中一個22bp的缺失),雖然可以轉錄,但也不能表達在細胞表面。跨膜區和胞內區結構的缺失,以及這些等位基因在人群中的高頻率,表明NK細胞可能分泌這些異常的KIR蛋白。
KIR所編碼的蛋白分子
KIR蛋白的胞外區有免疫球蛋白樣結構域,在某些KIR蛋白中可以與他們的配體HLA-I類分子結合。它的跨膜區和胞內區決定了KIR受體向NK細胞傳導的是激活還是抑制信號。KIR蛋白可以有兩個或者三個免疫球蛋白樣結構域(KIR2D,KIR2D),以及長的或者短的胞內區(KIR2DL,KIR2DS)。兩個結構域的KIR蛋白可以分為兩組,一型KIR2D蛋白(KIR2DL1-3,KIR2DS1-5)的膜遠端結構域與KIR3D的D1相似,但缺少D0結構域。D1結構域主要由第四個外顯子編碼。二型KIR2D蛋白(KIR2DL4,KIR2DL5)的膜遠端結構域跟KIR3D的D0相似,但缺少D1結構域。長的胞內區含有兩個ITIM結構域,傳導抑制性信號給NK細胞。短的胞內區的跨膜區胺基酸殘基含陽性電荷,與DAP12關聯,由DAP12傳導激活信號。KIR2DL4,KIR3DL2和KIR3DL3是例外,它們N端只有一個ITIM。KIR2DL4的跨膜區還有一個有電荷的精氨酸殘基,可以讓這個受體傳導抑制或者激活信號。KIR受體識別靶細胞表面的MHC-I 類分子,傳導激活或者抑制信號來控制NK細胞的反應。
KIR蛋白的長度從306到456個胺基酸殘基不等。儘管免疫球蛋白樣結構域的數目不同導致了蛋白的長度不同,胞質區的長度的多態性也是一個影響因素。大部分KIR蛋白的前導肽有21個胺基酸殘基,但含有一個不同的起始密碼子讓KIR2DL4的前導肽也更長。
D0結構域有約96個胺基酸殘基,D1結構域約有102個胺基酸殘基,D2約98個。大部分KIR蛋白的stem region有大概24個胺基酸殘基,但在變異的KIR3DL3中只有7個。大部分KIR的跨膜區有20個殘基,但在KIR2DL1,KIR2DL2中會少一個,因為外顯子7中有一個三聯鹼基的缺失。KIR的胞質區有高度的可變性,從一些KIR3DS1等位基因的23個殘基,到KIR3DL2的96個殘基。
基爾酒
基爾酒是一種用白葡萄酒或香檳加上黑加侖酒按照5:1的比例調配而成的經典,它(她)色澤血紅,顏色暗淡,味道卻是十分的醇美,很有內涵的酒。原產地:法國勃艮地 品種介紹: 白葡萄種,植株生長迅速,萌芽多絨毛,葉片中等大小,葉邊鋸齒狀明顯,邊部輕輕自卷。非晚熟品種,果實成熟時顆粒小,呈橢圓柱型,白黃色。 種植區域: 全球約23000公頃,法國1700公頃左右,主要在勃艮地,品均產量5—7噸/公頃。有兩個AOC命名: BourgogneAligote 和 Bouzeron,本地起泡酒也有使用。其他地區在東歐很多國家有栽種,其中羅馬尼亞平原栽種區產量達15噸以上/公頃。並且習慣葡萄完全成熟後採摘,減少酒中酸度.在瑞士、加拿大、加利福尼亞、智利也都有栽種。 品種特色:成酒輕柔口感,可口的酸度,適合年輕時飲用。在勃艮地經常與黑醋栗果酒( Crème de Cassis)調合後飲用,非常流行,名為KIR酒。
漫畫中的KIR
水無怜奈的組織代號
水無怜奈,《名偵探柯南》中人物。組織代號基爾(KIR)原名:本堂瑛海
化名:水無怜奈(名字來自007)
名字來歷:水無=晴=○=0,怜奈≈れいなな=07
生日:不詳,比瑛佑大10歲(柯南里是沒有時間流逝的,所以有關19XX年的說法都純屬杜撰)
長相:非常的漂亮,435 集注目於偵探團的採訪里元太他們都說希望是美女主播是水無怜奈,這可以看出她的長相是非常漂亮的,跟自己弟弟和去世的母親非常像。
真實身份:CIA(美國中央情報局)諜報員 (同其父親) 在TV500集說出真相,並答應赤井秀一和柯南(工藤新一)幫助FBI獲取情報
年齡:27
血型:AB型
初登場:漫畫48本FILE9《惡作劇的門鈴聲》 TV版:425 黑色的衝擊!組織魔爪伸來的瞬間
聲優: 三石琴乃(Mitsuishi Kotono)
謊話識別能力:靠近說謊嫌疑人,盯著他的眼睛,把手放在脖子上,根據脈搏、瞳孔大小、呼吸來判斷他是否有講謊話。(這是CIA探員的必備技能)
情報貢獻:透露了黑暗組織派出了高手——偵探波本(代號:Bourbon) ,來追查雪莉,即灰原哀的下落,讓FBI和柯南等早做準備。
登場集數
425 黑色的衝擊!被組織的魔掌觸碰的瞬間429 無法歸來的二人(前篇)
462 黑暗組織的影子 年幼的目擊者
491 紅與黑的碰撞 開始
492 紅與黑的碰撞 血緣
493 紅與黑的碰撞 絕叫
494 紅與黑的碰撞 冥土
495 紅與黑的碰撞 昏睡
496 紅與黑的碰撞 侵入
497 紅與黑的碰撞 覺醒
498 紅與黑的碰撞 攪亂
499 紅與黑的碰撞 偽裝
500 紅與黑的碰撞 遺言
501 紅與黑的碰撞 嫌疑
502 紅與黑的碰撞 潔白
503 紅與黑的碰撞 決死
504 紅與黑的碰撞 殉職
509 紅白黃色與偵探團