個人履歷
1975年2月，高中畢業到北京市順義縣北石槽公社插隊務農。
1976年12月，招工到國家建委一局三公司機運處汽車隊司機。
1978年2月，考入北京大學地球物理系空間物理專業，獲學士學位。
1982年2月, 國家分配到中國科學院地球物理所，歷任研究實習員、助理研究員和副研究員，研究地球電磁學和地球內部物理，先後獲理學碩士學位和博士學位。
1987年11月至1988年11月，駐南極科考，任第四次中國國家南極考察隊隊員。
1999年12月，執教中國科學院研究生院，2000年12月晉升教授，先後主講《地球流體力學》、《地球科學反演理論與實踐》、《套用偏微分方程與科學計算》和《環境流體力學》等學科基礎課程；
2001年8月起，歷任中國科學院研究生院地學教學部副主任、地球科學學院常務副院長、教務處處長等職；
2003年9月起，任中國科學院研究生院副院長，先後兼任教務處處長、中關村園區管理部主任，本部教育辦公室主任，培養辦公室主任，基建處處長等職。
2012年7月，中國科學院研究生院更名為中國科學院大學（簡稱“國科大”），馬石莊任國科大副校長兼紀委書記。
2014年4月，中國科學院大學黨委副書記、紀委書記。
2017年7月起，不再擔任中國科學院大學黨委副書記、紀委書記職務，保留副局級。
研究方向
近年來，馬石莊教授以地球磁場的起源理論及相關的地球流體力學、反演理論和網路環境並行科學計算問題為研究方向，先後主持中國國家自然科學基金三項和中國科學院院長基金特別資助項目一項，參加國家自然科學基金項目五項；在中外核心期刊上發表論文卅余篇。
曾學術訪問俄國科學院國際數學地球物理研究所，英國埃克塞特大學數學系和美國馬里蘭大學地球系統研究中心；是中國地球物理學會會員，《地球物理學進展》、《中國地球物理學會年刊》和《中國科學院研究生院學報》編委。
