機構簡介
歷經數次管理體制調整。現轄6個分局、11個稅務所，共負責13000餘戶納稅人稅收征管工作。截止2007年底，全局共有職工574人，其中，在職職工424人，黨員占在職職工63%，大專學歷以上占92%，其中本科以上學歷占56%。局領導職數為：局長1名，副局長3名，紀檢組長1名，總經濟師1名。
萬州區國家稅務局2007年度全年稅收實現跨躍5億元大關的目標，初步實現經濟發展與稅收增長的良性循環。區局機關先後被授予全國稅務系統紀檢監察工作先進單位、重慶市級文明單位、重慶市五十佳文明單位、長江三峽文明長廊建設示範單位、重慶市愛國衛生先進單位等榮譽稱號，2007年獲重慶市文明單位標兵稱號；6個分局、15個稅務所，文明單位比例達到100%。全系統有全國先進工作者、全國先進思想政治工作者、模範軍轉幹部、全國三八紅旗手各1人，全國財稅系統勞動模範1人。
內設機構
1. 辦公室
擬訂本單位年度工作計畫、有關工作制度；組織起草和審核重要文稿；負責機關文電、機要、會務、檔案、督辦、信訪、保密、密碼等工作；承擔面向社會的稅收宣傳、新聞發布及機關政務公開、政府信息公開工作；承辦網站運行和維護工作；組織稅收科研、學術交流工作；組織辦理人大代表議案、建議和政協委員 提案的有關事項; 承擔機關後勤事務的管理、保障和服務工作，擬訂機關事務具體工作制度並組織實施；承辦機關安全保衛工作；承擔機關辦公用品的採購、保管、分配、維修；參與機關後勤體制改革工作。
2. 政策法規科
擬訂並組織實施本單位依法行政、依法治稅工作方案；組織協調涉及多稅種、綜合性稅收政策的落實工作；組織開展綜合性稅收政策調研；承擔機關有關規範性檔案的合法性審核工作，並定期進行清理、評估和反饋；承辦局外涉及多稅種、綜合性稅收政策檔案會辦工作；牽頭重大稅收案件審理及規範稅務行政審批工作；辦理行政複議、賠償案件及行政訴訟案件；組織反補貼案件的應對工作；組織實施稅收法律法規、部門規章及規範性檔案執行情況的監督檢查；組織落實稅收執法責任制制度、稅收執法過錯責任追究制度，承擔稅收執法質量考核工作；督察落實稅收執法檢查結論；配合財政、審計等部門對稅務部門的監督與審計工作。
3. 貨物勞務稅科
組織實施增值稅、消費稅、車輛購置稅的徵收管理工作，擬訂徵收管理具體實施辦法；對有關稅種的具體業務問題進行解釋和處理；組織實施有關稅種的納稅評估、稅源管理等工作；管理增值稅專用發票和車輛購置稅票證；指導有關稅種的日常管理、日常檢查；參與有關稅種的納稅輔導、諮詢服務、稅收法律救濟工作；組織實施進出口貿易稅收管理工作，擬訂稅收管理具體實施辦法；承擔出口貨物退免稅的審核審批、年終清算工作；配合有關部門開展反騙稅工作。
4. 所得稅科
組織實施企業所得稅、儲蓄存款利息所得稅和法律法規規定的基金（費）等徵收管理工作，擬訂徵收管理具體實施辦法；對有關稅種的具體業務問題進行解釋和處理；組織實施有關稅種的納稅評估、稅源管理、稅基管理、彙算清繳等工作；指導有關稅種的日常管理、日常檢查；參與有關稅種的納稅輔導、諮詢服務、稅收法律救濟工作；承擔大企業稅收和國際稅收管理工作。
5. 收入核算科
牽頭編制年度稅收計畫、出口退（免）稅計畫，分配下達年度免抵調庫計畫；監督檢查稅款繳、退庫情況；開展稅收收入分析預測、稅收收入能力估算及重點稅源監控、企業稅收資料調查工作；承擔稅收會計核算、統計核算、稅收票證管理等相關工作；承擔稅收收入數據的綜合管理套用工作;組織實施會計核算、會計基礎規範工作，分析考核徵稅成本。
6.財務管理科
負責組織實施全局財務管理工作，負責財務管理規章制度的制定、貫徹落實。負責全局行政經費收支審核、支付、核算管理；負責銀行賬戶管理，組織實施國庫集中支付工作，辦理具體支付事項；負責本單位基本建設、固定資產、政府採購的財務核算管理工作；負責財務經費預算執行落實及財務預決算的編報；協助完成上級機關開展的各類財務審計工作。
7 . 徵收管理科
組織落實綜合性稅收征管法律法規、部門規章及規範性檔案，擬訂具體操作辦法；組織實施稅收征管狀況監控、綜合性納稅評估稅和稅收管理員制度落實工作；承辦《稅收征管信息系統》業務運維、征管質量考核、風險管理和稅收收入征管因素分析工作；承擔稅務登記、納稅申報、普通發票、征管資料規範性管理以及稅控器具推廣套用等方面的工作；組織落實個體和集貿市場稅收征管。
8. 納稅服務科
組織、協調和指導本單位各部門、各稅種、各環節的納稅服務工作；組織實施納稅服務工作規範和操作規程；組織落實納稅人權益保障規章制度及規範性檔案；組織協調、實施納稅輔導、諮詢服務、稅收法律救濟等工作、受理納稅人投訴；組織實施稅收信用體系建設；指導稅收爭議的調解；承擔網站納稅服務欄目、簡訊系統等納稅服務支持系統的運行管理工作。
9 . 人事科
組織落實幹部人事管理制度及稅務人才隊伍建設規劃，擬訂具體實施方案；承擔人事、機構編制和公務員管理工作；承擔工資、人事檔案、專業技術職務管理等工作；監督檢查本單位執行幹部人事規章制度情況；組織實施本單位思想政治工作、精神文明建設、稅務文化建設和基層建設；擬訂並組織實施人員培訓、學 歷教育管理制度、工作規劃、年度計畫，開展培訓質量考核與評估；負責本單位黨群工作；承擔入黨積極分子的教育培訓考察工作及發展黨員工作；指導本單位黨建、工會、共青團、婦委會工作；承擔本單位離退休幹部的服務和管理工作。
10 . 教育科
組織實施本單位思想政治工作、精神文明建設、稅務文化建設和基層建設；擬定並組織實施人員培訓、學歷教育管理制度、工作規劃、年度計畫，開展培訓質量考核與評估；負責本單位黨群工作；承擔入黨積極分子的教育培訓考察工作，以及發展黨員工作；指導本單位黨建、工會、共青團、婦委會工作。
11. 監察室
組織落實紀律檢查、行政監察工作制度，擬訂具體實施辦法；監督檢查本單位人員貫徹執行黨的路線方針政策和遵守國家法律法規、部門規章情況；監督檢查本單位選拔任用幹部、貫徹黨風廉政責任制和廉政勤政的情況；組織協調本單位的黨風廉政建設和反腐敗工作；受理對本單位工作人員違法違紀行為的檢舉、控 告及有關申訴；查處本單位工作人員違法違紀案件及其他重要案件；開展執法監察和糾風工作。
直屬機構
稽查局
組織落實稅務稽查法律法規、部門規章及規範性檔案，擬訂具體實施辦法；組織、協調稅收違法案件的查處、審理和執行工作；受理稅收違法案件的舉報；協調公安、檢察、審判機關處理稅務稽查有關工作；承擔金稅工程發票協查工作；牽頭組織稅收專項檢查工作。
事業單位
1. 信息中心
落實稅收管理信息化建設規劃和實施方案，執行信息系統管理制度和技術標準；承擔本單位信息化建設的技術支持、保障工作；承擔稅收管理信息系統的運行維護工作；組織本單位信息安全管理與實施。
2. 機關服務中心
承擔機關後勤事務的管理、保障和服務工作，擬定機關事務具體工作制度並組織實施；承辦機關安全保衛工作；承擔機關辦公用品的採購、保管、分配維修；參與機關後勤體制改革工作。
派駐機構
重慶市萬州區國家稅務局設6個稅務分局和11個稅務所，級別為正科級。
1.一分局
負責區屬重點企業、工業園區和經營規模較大、經區局指定管轄的其他納稅企業的日常稅務管理工作。研究制定符合實際的具體的稅源管理辦法、措施，對所轄稅源實施監控管理，對轄區內納稅人實行分類管理和服務；負責所轄納稅戶稅務登記及納稅申報的調查核實，進行稅收分析和納稅評估、稅法宣傳、納稅輔導、稅收調研、納稅服務、日常檢查、戶籍管理、政策送達、稅源調查、定額核定、數據採集分析、處理一般性違規違章行為等。
2.二分局
負責高筍塘、太白、牌樓三個街道辦事處轄區內（除一分局管轄以外）的其他企業的日常稅務管理工作。研究制定符合實際的具體的稅源管理辦法、措施，對所轄稅源實施監控管理，對轄區內納稅人實行分類管理和服務；負責所轄納稅戶稅務登記及納稅申報的調查核實，進行稅收分析和納稅評估、稅法宣傳、納稅輔導、稅收調研、納稅服務、日常檢查、戶籍管理、政策送達、稅源調查、定額核定、數據採集分析、處理一般性違規違章行為等。
3.三分局
負責高筍塘、太白、牌樓三個街道辦事處轄區內的所有個體工商戶和實行定期定額或核定徵收的小規模企業的日常稅務管理工作。研究制定符合實際的具體的稅源管理辦法、措施，對所轄稅源實施監控管理，對轄區內納稅人實行分類管理和服務；負責所轄納稅戶稅務登記及納稅申報的調查核實，進行稅收分析和納稅評估、稅法宣傳、納稅輔導、稅收調研、納稅服務、日常檢查、戶籍管理、政策送達、稅源調查、定額核定、數據採集分析、處理一般性違規違章行為等。
4.四分局
負責周家壩、沙河街道辦事處轄區內（除天子園、興茂花園內管戶以外）的所有納稅人的日常稅務管理工作。研究制定符合實際的具體的稅源管理辦法、措施，對所轄稅源實施監控管理，對轄區內納稅人實行分類管理和服務；負責所轄納稅戶稅務登記及納稅申報的調查核實，進行稅收分析和納稅評估、稅法宣傳、納稅輔導、稅收調研、納稅服務、日常檢查、戶籍管理、政策送達、稅源調查、定額核定、數據採集分析、處理一般性違規違章行為等。
5.五分局
負責鐘鼓樓、陳家壩兩個街道辦事處以及周家壩街道辦事處所屬天子園、興茂花園轄區內的所有納稅人的日常稅務管理工作。研究制定符合實際的具體的稅源管理辦法、措施，對所轄稅源實施監控管理，對轄區內納稅人實行分類管理和服務；負責所轄納稅戶稅務登記及納稅申報的調查核實，進行稅收分析和納稅評估、稅法宣傳、納稅輔導、稅收調研、納稅服務、日常檢查、戶籍管理、政策送達、稅源調查、定額核定、數據採集分析、處理一般性違規違章行為等。
6.六分局
負責百安、五橋兩個街道辦事處轄區和接壤的三個鎮、鄉（原百安稅務所管轄區域）的所有納稅人的日常稅務管理工作。研究制定符合實際的具體的稅源管理辦法、措施，對所轄稅源實施監控管理，對轄區內納稅人實行分類管理和服務；負責所轄納稅戶稅務登記及納稅申報的調查核實，進行稅收分析和納稅評估、稅法宣傳、納稅輔導、稅收調研、納稅服務、日常檢查、戶籍管理、政策送達、稅源調查、定額核定、數據採集分析、處理一般性違規違章行為等。
7.農村稅務所：雙河、龍沙、董家、李河、分水、余家、百安、新田、牡羊、龍駒10個農村綜合性稅務所，實行屬地管理。具體負責所轄納稅戶稅務登記及納稅申報的調查核實、進行稅收預測和分析、稅收宣傳、納稅輔導、稅收調研、納稅服務、日常檢查、戶籍管理、文書送達、稅源調查、定額核定、催報催繳、數據採集分析、組織實施納稅評估、處理一般性違規違章行為和稅款的徵收等。
8.車輛購置稅徵收所
負責萬州區的車輛購置稅的徵收管理工作。
領導信息
黨組書記、局長黃 建軍：主持全面工作，分管風控中心，聯繫第一稅務分局、第二稅務分局、第十稅務所；
副局長李愛平：分管收入核算科、納稅服務科、人事科，聯繫辦稅服務廳、第二稅務所、第五稅務所
副局長廖軍：分管貨物和勞務稅科、財務管理科、機關服務中心（含工會），聯繫第三稅務分局、第一稅務所、第三稅務所；
紀檢組長王永堅：分管監察室，聯繫第四稅務分局、第四稅務所、第七稅務所、第八稅務所；
總經濟師周洪波：分管辦公室、所得稅科、教育科、核准審批中心，聯繫稽查局、第五稅務分局、第十一稅務所；
總會計師王本成：分管政策法規科、徵收管理科、信息中心，聯繫第六稅務分局、第六稅務所、第九稅務所。
