轉座酶基因改變位置（例如從染色體上的一個位置轉移到另一個位置，或者從質粒轉移到染色體上）的j酶基因。
轉座酶基因轉座酶基因的作用
在基因組進化過程中，轉座酶基因的作用在許多方面起作用。最明顯的效應是轉座子能夠啟動重組，最後導致基因組重排。這種作用與這些轉座因子的轉座活性無關，而只是由於染色體上有某一轉座因子的幾份拷貝，於是在同一染色體或不同染色體上有著相同轉座因子序列的部位之間發生重組。重組的結果可能會缺失若干個有重要功能的基因而出現有害效應，但有時確實也有產生了有利效應的重組。反轉錄轉座因子的轉座作用可以引起非編碼序列DNA的重排，當基因組的一段DNA序列在RNA聚合酶的作用下產生其RNA拷貝，然後在反轉錄酶催化下，以這個RNA為模板合成DNA拷貝，然後插入基因組的其他部位，由此既增加了基因組的大小，又增加了重複序列。
重複序列L1是一種反轉錄轉座子，除了它本身可在哺乳動物基因組上從一個位置移到另一位置外，L1還可能通過“通讀”(readthrough)機制將其3，端的非L1序列轉錄成RNA，再反轉錄成DNA拷貝，而後連同L1一起轉座到基因組的新的位置，這樣使基因組上原先不連鎖的兩個DNA片段連線在一起。這一過程被稱為3’端轉導作用(3'—transduction)，其結果除了擴大基因組的大小，生成新的重複序列外，還有可能由此而形成新的基因，果蠅的一個基因(jingwei)就是乙醇脫氫酶基因的DNA插入了另一個無關的DNA序列中形成的。從近期效應看，轉座因子如插入基因編碼序列中通常會引起基因失活，因此轉座作用對細胞的生存多半是有害的，所以轉座因子通常是被甲基化的，使其所含的轉座酶基因的轉錄受抑而不發生轉座行為。可是，從進化的角度看，轉座因子的轉座作用對於基因組的進化則有潛在的有利效應。
轉座酶基因遺傳標記的研究
轉座酶基因遺傳標記的研究的目的是為了了解常州地區新生兒呼吸道分離到的肺炎鏈球菌（Sp）接合型轉座子存在狀況。方法採用PCR擴增技術對新生兒病房分離到47株Sp菌進行轉座酶基因遺傳標記——i班Tn916／Tn1545轉座酶基因檢測。結果47株Sp菌中39株（83．0％）攜帶intTn916型或／和Tn1545轉座酶基因。結論Tn916型和Tn1545型接合型轉座子可攜帶多種耐藥基因，本組S戶菌中intTn916／Tn1545轉座酶基因高檢出率，揭示了Sp菌獲得多重耐藥性的遺傳學特徵。Sp菌通過轉座酶基因獲得並傳播耐藥基因，在耐藥中起重要作用。
相關信息
（1）密度梯度離心實驗
E.Jordon等和P.Starlinger小組以及J.Shapiro分別進行了以下實驗，他們將含有gal+和gelm(上述極性突變)λ噬菌體分別出離出，同時加入到離心管中進行CsCl密度梯度離心，結果出現了兩條帶，λdgalm的密度>dgal+,表明dgalm有可能具有小片斷DNA的插入。
（2)分子雜交實驗
將ldgalm和ldgal+進行分子雜交，若有ldgalm有額外片段那么在電鏡下可以觀察到它們存在和所處的位置。實驗結果在雜交鏈上出現了一個額外的單鏈的莖環結構，長800nt，這就是插入序列1，或稱為IS1（insertionsequence1）。
