傳授義學
菩提流支與勒那摩提共同翻譯了《十地經論》，但在義學方面卻各有傳授。菩提流支的弟子主要有道寵，俗名張賓，原為大儒雄安生弟子，後出家從流支學《地論》深義，受教3年，一邊聽講一邊將筆記整理成義疏，後來成為很有成就的《地論》師，在鄴城講學，可以造就的學士達數千餘，最突出的有僧休、法繼、誕禮、牢宜等人。勒那摩提的主要弟子為慧光、道房、定義3人。慧光先已精通律學，從勒那受業，又成《地論》名家。其門下也是人才濟濟，突出者有法上、道憑、僧范、曇遵等人。道房、定義則承傳了勒那摩提的禪法。
派中之派
菩提流支與勒那摩提分別培養出了一大批《地論師》，形成了在北朝佛教中占有重要地位的《地論》學派。而兩人的門下又各成派中之派，菩提流支門下被稱為道北學派，勒那摩提門下被稱為道南學派。兩派得名的原因，佛教史上存在不同的說法。舊說認為自鄴城至洛陽有南、北兩道，菩提門徒自道寵以下散處在道北，故稱北道派；勒那門徒自慧光以下分布於道南，故稱南道派。一些現代佛教學者則提出新說，認為菩提流支住在永寧寺，在洛陽城西第三門道北；勒那摩提後來可能住在白馬寺，在西郊第二門道南，北道、南道兩派由此得名。在教義上，兩派也有些不同。北道派主張佛性始有，南道派主張佛性本有；另外在判教學說上，也就是對現有佛教各種派別的歸類劃分上，南道派把佛教分判為四宗，即：《毗曇》學為因緣宗，《成實學》為假名宗，《般若》學為不真宗，《華嚴》、《涅盤》學為真宗。北道派則於上述四宗之外加了一個《華嚴》學為法界宗，成為五宗。這樣，菩提流支就成為主張佛性始有、判教為五宗的《地論》學北道派的祖師。
主要成就
密宗法術
菩提流支與勒那摩提在譯經成就與促進中國《地論》學建立發展方面難分高下，但在密宗法術上，卻是獨步一時，無人可與抗衡。據說有一次他曾經誦咒使井水滿至井欄，用缽舀水盥洗，被人崇拜為神聖。他看到當時中國尚不具備推行密宗的條件，擔心世人為密宗法術所惑，不能領會掌握密宗的宗教精神，所以密而不傳。
主要影響
菩提流支對中國淨土宗的形成也有貢獻。中國淨土宗的祖師曇鸞，未服膺淨土法門之前，曾到江南向道士陶弘景求得長生仙方，回北方途中在洛陽得遇菩提流支，流支向他說明長生不如解脫的道理，並授給他《觀無量壽佛經》及自己譯出的《無量壽經論》(通稱《往生論》)。曇鸞得此啟示和經、論，便廢棄仙方，按《經論》介紹的世親所倡5種念佛法門修行，又加以創造發揮，行化各地，為創建淨土宗奠定了基礎。所以佛教史上一般認為曇鸞的淨土學說乃是傳自菩提流支。
菩提流支到鄴都不久，不知所終，他晚年事跡及何年去世，已無從可考。
《佛光大辭典》“菩提流支”條，記為“天平年間（534-537）師猶在，後不知所終。”
菩提流支原來他因種種原因秘密離開魏都，尋覓靜心之所，來到了湖北黃梅。清順治《黃梅縣誌》載：“流支禪師，中印度人，來東土譯經藏。……於梅地建道場曰菩提，後寂於多雲山，其塔在焉。”菩提道場即今黃梅苦竹鄉鄭友村董城墩菩提寺。多雲山海拔422米，在菩提寺北3公里處。其上有廣福寺，古稱多雲庵，為流支手建。寺旁有一座高2米的窣堵波式古石塔，中空，有石門可入，傳為流支埋骨處。清鹹豐進士、邑人梅雨田有詩曰：“印度東土初祖從，流支疏塔碧苔封。多雲山上多雲蓡，寂寞荒山野寺鐘。”2002年，山民於寺旁水塘中撈起密藏半個世紀的乾隆年間白雲石碑一通，中行鐫文“臨濟正宗三十二世天峰真性和尚之塔碑”。碑誌有云：“……夫多雲一山，乃菩提流支自西域來，闡教中土，卓錫於此。講經說法，註譯諸經，獨傳千有餘年……”天峰和尚原墓尚存，位流支石塔前下方的5米處。
翻譯經書
菩提流支帶來的梵文經卷多達萬夾，他首先選擇瑜伽系的重要經典進行翻譯。朝廷對於他的譯經非常重視，選拔了先已來華的著名梵僧勒那摩提和佛陀扇多和他合作，還撥給通曉佛學的僧侶和儒士1000多人作為譯經助手。譯場就設在皇宮內的太極殿，開譯的第一天，宣武皇帝親臨譯場，親自擔任筆受，第二天起才由僧人僧辯等接替筆受工作。經過3年多的辛勤勞動，譯出了《究竟一乘寶性論》4卷、《法華經論》2卷、《十地經論》12卷、《寶積經論》4卷等瑜伽系重要著述，多屬瑜伽學的開創者無著、世親的作品。
十地經論
譯事的初期階段，由於主譯者菩提流支、勒那摩提等不熟悉華言，又缺乏經驗，翻譯技巧還不夠純熟，譯文中有不少錯亂的文句和別字。例如《十地經論》中用了一個“盞子世間”的措詞，後來流支發現盞子、缽、幞等總名為器，遂將上述譯語改為“器世間”，才顯得通達雅訓。在翻譯過程中，流支等認真總結經驗，不斷提高漢語水平，翻譯技巧隨之不斷熟練，譯文質量也日益提高。
《十地經論》在印度傳誦的過程中，個別字句已產生分歧，因而出現了不同的梵文底本。菩提流支等翻譯時把不同底本的不同字句分別譯出，譯本中相應的出現了某些章節的詞句不盡相同的情況。後人不明底細，附會編造出菩提流支與勒那摩提爭名而分別譯經的故事。有的說菩提流支、勒那摩提、佛陀扇多起初合作翻譯，後來3人聽信流言，各傳本師的學說，互相不通訊息，宣武帝遂令3人於3處各譯，譯文中互有詳略優劣，後人把3人譯文合併整理而成了流傳下來的譯本。有的說宣武帝為了試驗菩提流支與勒那摩提的才學，令菩提在紫極殿、勒那在太極殿分別翻譯，各有禁衛守門，不許互相通訊息。譯出來後一對比，只有一處文字小異，一作“有不二不盡”，一作“定不二不盡”，大家無不驚訝讚嘆。經現代佛教學者呂澄先生考證，這些傳說並非事實。
菩提流支譯出《十地經論》後不久，被安置在新建成的永寧寺中。這是當時海內規模最大、建築最精美的一座皇家寺院。同處此寺受到國家供養的梵僧有700多人，勒那與佛陀也一度被安置在這座寺院，而菩提流支被敕命為寺中翻譯方面的領袖。他在此寺譯經為時很久，直到北魏分裂為東魏和西魏兩國，才於東魏天平元年(534年)遷到東魏都城鄴城，並在那裡繼續了一段時間的譯經工作。在前後將近30年的譯經事業中，他共譯出經論30部，101卷。其中重要的經論除前面所舉之外，還有《金剛般若波羅蜜經》1卷，《彌勒菩薩所問經》1卷，《勝思惟梵天所問經》6卷，《深密解脫經》5卷，《入楞伽經》10卷，《大薩遮尼乾子所說經》10卷，《彌勒菩薩所問經論》5卷，《金剛般若經論》3卷，《文殊問菩提經論》2卷，《勝思惟梵天所問經論》4卷，《無量壽經論》1卷，《百字論》1卷等。據說他的譯稿足足堆滿了一間房屋。
