症狀
在種子發芽過程中，受到病菌的侵染，種子的內含物變成褐色的膠質團，即種腐。或胚根和子葉從種皮出現後，即變成褐色並軟化。當侵染髮生在發芽階段的後期，病斑更典型地局限於下胚軸和根上，使之變成水漬狀，最終衰弱凋萎，幼苗倒下或矮縮，子葉小，呈暗綠色，幾天之內使死掉，也即出苗前後的猝倒病。在潮濕天氣，適宜溫度和充足的土壤水分條件，幼苗主根感病後，還可由病部以上生出的二次根生存。幼苗胚根受到腐黴菌侵染，形成叉狀根，即幾條不定根同時深入土中。
病原特徵
至少有10種以上的腐黴菌在各地引起苜蓿幼苗根腐病和猝倒病。苜蓿病苗上最普遍的分離物有終極腐霉（Pythium ultimum trow.）、畸雌腐霉（P.irregulare Buisman）、華麗腐霉（P.splendens H. Braun）。發生在苜蓿上的其他種還有喙腐霉（P.rostratum E.J.Butler）、絢麗腐霉（P.pulchrum Minden）、群結腐霉（P.myrioty1um Drechs.）、瓜果腐霉（P. aphanidermatum（Edson）Fitzp.）、側雄腐霉（P. paroecandrum Drechs.）、寬雄腐霉（P.dissotocum Drechs.）、鍾器腐霉（P.vexans de Bary）和墓菜腐霉（P.violae Chesters & C. J. Hickman）等。被普遍報導於苜蓿苗上的德氏腐霉（P.debaryanum Hesse），它的原始描述明顯地是在一個混合種的基礎上做出的，而且名字被錯誤地套用到幾個普通腐黴菌上，包括間型腐霉（P.intermedium de Bary）和終極腐霉、側雄腐霉和畸雌腐霉等這些成株吸收根上的普遍分離物。最近的分類工作表明，這個複合種應該被承認，因為一些種間是部分重疊的。除群結腐霉之外，冷涼到中等溫度條件對它們是有利的，而高溫對瓜果腐霉有利。低溫氣候型腐霉種的孢子囊是球形的，萌發在一個孢囊內形成遊動孢子，或直接產生芽管。藏卵器端生或間生，除畸雌腐霉的藏卵器是有刺的外，其餘幾種是光滑的。卵孢子可以完全充滿藏卵器的空腔，也可不完全充滿，因種而異。每個藏卵器通常有1－5個雄器，藏卵器自藏卵器柄或其他菌絲上生成。卵孢子發芽產生芽管，長成菌絲或孢子囊。群結腐霉和瓜果腐霉孢子囊有淺裂，每個藏卵器有6個以上的雄器。腐黴菌從感病的組織分離，把洗好的組織置於水瓊脂上，幾個優異的選擇性培養基能從寄主組織和土壤中分離腐霉。在培養中這些種長出白色絨毛狀的菌絲，2天之內菌落達到培養皿的邊緣。苜蓿大子疫霉的菌落生長較慢。
發生規律
腐黴菌是土壤習居菌，以卵孢子或孢子囊存在於作物的殘餘物中，也可以病原的或腐生的定植於其他作物和雜草上。土壤濕度過高和低溫，多數情況不利於幼苗的迅速生長，而有利於病害的發展。高濕的土壤為遊動孢子的移動提供了水膜，也降低了寄主的活力，這樣增加了剌激袍子萌發的寄主滲出物擴散和有效性。對幼苗猝倒病的適溫，在出苗前接近16℃，出苗後為24－28℃。侵染體以遊動孢子、直接萌發的孢子囊、卵孢子和菌絲體存在。孢子囊和卵孢子也可萌發形成孢囊，孢囊內形成遊動孢子。侵入時通常在寄主表面形成附著胞和侵染釘。在控制條件下，沙培或土培，5天后，多數苜蓿苗能抗猝倒病，但吸收根可以在任何階段受到侵染。
分布與危害
腐黴菌廣泛分布於世界各地，引起多種農作物苗期病害。在濕土地內種植苜蓿，病害可導致大量缺苗。較老植株的鬚根也可受到病菌的侵染。在溫室感病土壤，或試驗小區，過密種植苜蓿，病害能毀掉大部分幼苗。
防治方法
適當提高播種量，部分地補償幼苗損失；用對霜霉目真菌有特效的內吸性殺菌劑，如甲霜安等處理種子，可有效的防治腐霉和疫霉引起的苗病；合理施肥，調整土壤pH值及肥力，到適合於苜蓿幼苗生長的水平；選擇適宜的播種時間，使土壤及氣候條件有利於迅速出苗及幼苗早期生長。
