概論
HLA系統是目前人類已知的最複雜的基因群—HLA複合體，或稱MHC基因的編碼產物。HLA複合體位於第六對染色體的短臂，是免疫遺傳的調控中心。每個基因位點存在多種等位基因，導致HLA系統的高度多態性。
分類
HLA複合體的基因位點，從功能角度可分為三類。第一類：包含基因位點HLA－A·B·C，所有真核細胞均具有Ⅰ類基因位點。第二類即HLA－D（DR）位點，主要見於抗原遞呈細胞、B細胞及T輔助細胞，此外，血管內皮細胞、纖維母細胞及腎小管上皮細胞等如果受到淋巴因子IFN－γ的誘導，亦可表達Ⅱ類抗原。第三類則屬於編碼補體C2、C4和B因子的基因位點。HLA分子的主要生理作用是將抗原遞呈給T細胞，因而無論對誘導體液及細胞免疫反應均起重要作用。已知調控免疫反應的Ir(immune response)基因亦位於HLA－D區，所以Ⅱ類抗原的基因亦具有Ir基因的功能，調控免疫反應的幅度。因而可以認為與HLA直接相關的免疫病理現象是：移植排斥反應、對疾病的反應過度或反應不足。
移植排斥機體的某種細胞、組織或器官因損傷而導致不可復性的結構及功能損害時，將相應健康細胞、組織或器官植入集體的過程稱為細胞、組織或器官的移植（transplantation）。常見的有自體移植、同種異體移植及同基因型移植等。
自體移植不發生排斥，如手指缺失後移植自體足趾、自體皮膚移植等。同種異體之間的細胞、組織或器官移植已成為一種常用的臨床治療手段，但同種異體移植後因MHC的不相容，常常發生移植排斥（transplant rejection）。人體同種器官移植排斥是宿主免疫系統針對移植物的HLA分子產生的、由細胞和（或）抗體介導的變態反應，其發生與供、受者HLA的差異程度正相關。不同個體而HLA完全相同者，即同基因型移植，僅見於單卵多胎者之間，這種供受關係最為理想。但就多數同種移植物而言，總有不同程度的不相容性。因此，移植前進行組織配型，甚至基因配型，選擇供、受者HLA差異最小者是降低移植排斥、增加移植成功的關鍵。
