研究生教育創新計畫於2002年醞釀並提出。2003年教育部啟動研究生教育創新計畫，並列為《2003－2007年教育振興行動計畫》的重要內容。研究生教育創新計畫實施以來，發動面穩步擴大，項目類型逐漸增加，內容不斷豐富，取得了明顯成效，在全國產生較大影響，初步形成激勵和支持研究生創新的良好氛圍。在教育部立項支持一批項目的同時，各研究生培養單位和有關主管部門也採取多種形式開展研究生教育創新計畫活動，積極探索提高研究生培養質量的有效途徑，在推動了我國研究生教育的全面改革與快速發展上發揮了積極作用。
目的和意義
我國1978年恢復招收研究生，1981年開始實行學位制度。二十多年來，研究生教育事業蒸蒸日上，建立了學科較為齊全、結構基本合理的中國特色學位與研究生教育制度，培養的大批研究生成為各條戰線的中堅骨幹力量，為我國的現代化建設事業作出了歷史性的貢獻。近幾年，研究生教育規模持續快速增長，在校的研究生已經突破100萬人，我國已成為研究生教育的大國。但是，由於我國研究生教育的歷史短、發展快，還存在一些不夠完善的地方。這主要是研究生培養機制和培養模式還相對落後，經費投入不足，對研究生的創新精神和創新能力的培養還很薄弱，研究生的總體培養質量，特別是博士生的培養質量與先進國家相比還有較大差距。近年來研究生教育規模迅速擴大造成的生師比攀升，又進一步引起研究生教育資源和培養條件的緊張。
在科學技術突飛猛進和知識經濟崛起的新形勢下，國家對高層次創新人才的需求不斷擴大，研究生教育必須加快改革的步伐，把工作的重心切實轉移到提高培養質量上來。為此，教育部提出要實施研究生教育創新計畫，其目的是要深入探索新形勢下研究生教育規律，更新觀念，深化改革，推進創新，建立與社會主義市場經濟體制相適應的研究生教育體制和運行機制；要加強研究生培養基地建設，改善培養條件；要搭建平台，促進交流，推動優質資源共享；要建立研究生科研創新激勵機制，營造創新氛圍，強化創新意識、創新精神和創新能力的培養；努力使我國研究生培養質量和研究生教育的整體水平儘快接近或達到已開發國家水平。
黨中央提出增強自主創新能力，建設創新型國家的奮鬥目標，既對發展研究生教育，提高研究生培養質量提出了更高的要求，也為研究生教育的改革和發展提供了難得的機遇。我們必須站在國家戰略的高度，用科學發展觀統領研究生教育工作，抓住機遇，乘勢而上，通過實施研究生教育創新計畫，把大力培養拔尖創新人才，增強自主創新能力作為學位與研究生教育的中心任務，切實抓實抓好，為實施科教興國戰略和人才強國戰略奠定堅實的人才基礎
實施過程
1、發動面穩步擴大，項目類型逐漸增加
從2003年開始，教育部通過立項方式支持了一批研究生教育創新計畫項目，並逐年擴大支持面，增加新的項目類型。
2003年，通過學校申報，教育部批准11個學校的13個創新計畫項目，這些項目包括：舉辦全國博士生學術論壇，建設研究生創新中心，開設研究生精品課程，以及優秀博士生科研創新和國際聯合培養等。2004年教育部擴大了支持面，批准20個學校的22個創新計畫項目。2005年，在研究生培養單位高度重視積極申報的基礎上，共批准42個單位的近50個創新計畫項目。同時，項目類型有所增加，可分為：舉辦全國博士生學術論壇、舉辦全國研究生暑期學校、建設研究生創新中心、開展研究生培養及課程改革、組織研究生訪學等。2006年和2007年，承擔項目的單位進一步增加，同時也增加了項目類型，如舉辦確定科學主題的全國博士生學術會議，通過立項方式推動一批學校開展研究生培養機制改革試點工作，推動各省級學位與研究生教育管理部門開展本地區或區域合作的研究生教育創新計畫活動等。
2、各培養單位和主管部門積極開展研究生教育創新計畫活動
作這引導和示範，教育部主要支持了有研究生院的高校的研究生教育創新計畫項目，以及部分區域合作的項目。為了以點帶面，以少帶多，形成多元投入機制，帶動全國研究生教育創新計畫的全面開展，形成多層次、多類型、全方位的研究生教育創新體系，教育部於2005年1月印發了《關於實施研究生教育創新計畫，加強研究生創新能力培養，進一步提高培養質量的若干意見》，進一步明確了實施研究生教育創新計畫的目的、意義、指導思想、主要任務和實施辦法，並對各研究生培養單位和主管部門開展研究生教育創新計畫活動提出了具體要求。
通過廣泛發動，一大批研究生培養單位和主管部門制定了自己的研究生教育創新計畫實施方案，投入了一定的經費。各研究生培養單位和主管部門創新計畫項目內容涉及研究生課程建設、教材建設、教學改革、學術活動節、素質教育、實踐能力培養、培養機制改革、招考制度改革、科技創新激勵制度、優秀人才或優秀論文資助、優秀學位論文評選、研究生開放實驗室建設、研究生文獻信息資源建設、國際聯合培養、信息管理現代化建設、研究生導師培訓等多個方面，有力推動了研究生教育的全面改革。
主要效果
1、全國博士生學術論壇已成為品牌項目
舉辦全國博士生學術論壇，為博士生營造學術交流的氛圍和平台，受到廣泛歡迎。2003年由清華大學承辦首屆“全國博士生學術論壇”以來，四年間共舉辦了31次全國博士生學術論壇（分學科領域），徵集的博士生學術論文稿件數達到15387篇，錄用的論文達到7825篇，出席論壇的正式博士生代表達到8943人，其中海外博士生代表70餘人，開設的分論壇（分學科領域）達到88個。
2、堅持並擴大研究生暑期學校
研究生暑期學校聘請海內外學術水平高、教學經驗豐富的知名專家、學者擔任主講教師，根據不同的學科開設若干門基礎、前沿課程，有效地幫助研究生開闊眼界，最佳化知識結構，受到歡迎。研究生暑期學校始於80年代的“數學研究生暑期教學中心”，1995年開始與國家自然科學基金委員會聯合資助和組織，學科領域逐步擴大到物理、化學、生物、公共衛生、生命、環境、管理等。實施研究生教育創新計畫以來，學科領域進一步擴大到人文社會科學和工程技術領域。2003－2006年，四年共舉辦分學科領域的研究生暑期學校共41個，參加的研究生7000餘人。
3、研究生創新中心成為改革培養模式、推動自主創新的重要基地
幾年來，依託已有較好基礎的教學科研平台，批准建設了一批以開放、共享、自主創新為特點的研究生創新中心，目的是為研究生特別是跨學科的研究生提供可以進行學術交流、跨學科合作、自主開展創新實驗，實踐創新思想的場所。
各高校把研究生創新中心作為改革研究生培養模式、加強產學研結合、推動自主創新的重要基地。如重慶大學、西北工業大學等高校建設的研究生創新中心，不僅為研究生提供了實驗研究場所和平台，而且鼓勵研究生的自行設計、自主選題、自己動手、自由探索、自主創新、自主管理，推動了研究生培養模式和管理體制的改革。河海大學分別爭取長江水利委員會、黃河水利委員會和西部水利部門的支持和經費投入，在武漢、鄭州、成都、昆明等地共建研究生聯合培養實踐基地。
4、培養改革及課程改革取得了一批好的成果
北京大學通過研究生精品課程系列建設項目，分期在“套用數學與科學計算”、“理論物理”、“世界歷史”、“定量遙感”、“高分子前沿專題”、“中國現當代文學研究”、“理論與計算化學”、“財稅法”、“經濟學與金融學”等一批研究生課程組織示範教學，聘請了包括諾貝爾獎獲得者在內的220多位國內外專家授課，吸收校內外近三千名博士生、碩士生和青年教師參加，為他們提供了反映學科最前沿知識和成果的課程，促進了優質研究生教育資源共享，推動了研究生課程的改革和教學水平的不斷提高。南京大學的研究生課程體系改革，在調查國內外80所高校近4000門課程的基礎上，分析存在的問題，制定改革方案，包括引進一批海外人才建設一批核心課程，取得較好效果。清華大學通過多種形式加強研究生的國際化培養，促進研究生拓寬國際視野，增強國際交往能力。華中科技大學利用與德國的長期友好合作關係，建設中德合作醫學研究生培養基地，項目同時得到教育部和德國德意志學術交流中心的資助，取得良好進展。中國人民大學針對研究生培養類型多元化趨勢，分學術型和套用型從研究生培養的目標定位、彈性學制、培養方案、課程結構、激勵機制以及國際化等方面全面改革，取得初步進展。大連理工大學等積極推進研究生的團隊培養模式，為研究生教育創新提供了新的思路。天津大學在實施化工類研究生培養方案、課程、教材、培養模式改革項目中，聯合全國10所化工強校共同參與，加大了改革力度，提高了項目實施水平，擴大了受益面。浙江大學利用教育部創新計畫項目實施的契機，整合全校資源，加大自籌投入，建設多學科共享的多種類型研究生教學與創新能力培養平台，全面改善了研究生培養條件，同時推動了新的教學方式和培養模式的形成。
5、研究生國內訪學促進了優質教育資源共享
2006年，教育部通過研究生教育創新計畫資助研究生國內訪學，一批高校和中國科學院接受校外博士生來本校重點學科、重點實驗室進行訪學研究，有效促進了優質教育資源的共享，全年接受訪學人數共達350餘人。尤其是中國科學院研究生院為高校研究生來中科院所屬研究院、所、台、站、中心等研究機構訪學開闢了通道，推動了高等學校與科研院所的強強聯合與合作。
6、主管部門有力推動了本地區研究生教育創新計畫的開展
在教育部立項支持全國性和示範性研究生教育創新計畫項目的同時，省（市、自治區）研究生教育主管部門在推動地區內研究生教育創新計畫的開展中加強了組織和發動工作。如上海市由政府出面，組織大型企業、高新企業及科研院所與高等學校合作，建立研究生聯合培養基地，有效利用了社會資源，推動了產學研結合，促進了研究生培養模式的改革，發揮了多方面的效益。江蘇省推出以抓質量、抓內涵、抓可持續發展為核心的“江蘇省研究生培養創新工程”，省財政每年安排專項經費予以支持，多方位地開展研究生教育改革創新。幾年來投入經費達1000多萬元，取得較突出的成果和影響。
