海關特殊監管區域
海關特殊監管區域是經國務院批准，設立在中華人民共和國關境內，賦予承接國際產業轉移、聯接國內國際兩個市場的特殊功能和政策，由海關為主實施封閉監管的特定經濟功能區域。
海關特殊監管區域有保稅區、出口加工區、保稅物流園區、跨境工業園區、保稅港區、綜合保稅區多種模式。
保稅區
企業註冊備案流程
（一）企業遞交註冊申請材料；
（二）經辦人員初審；
（三）科長複審；
（四）報關長審批；
（五）向企業核發海關註冊登記證書及自用物資手冊；
（六）企業申領企業編碼；
（七）正式業務開展。
企業註冊備案遞交註冊申請材料
（一）中資企業
1、企業法人營業執照（正本及複印件）；
2、企業章程複印件（股東簽字）；
3、企業法人身份證（複印件）；
4、銀行開戶許可證正本及複印件；
5、企業在區內購房、租房契約或土地使用證，房屋租售登記(正本及複印件)；
6、企業海關登記註冊申請表（加蓋公章及法人章）；
7、驗資報告正本（附銀行進帳單）。
8、海關認為必要的其他單證。
（二）外商投資企業
1、管委會批覆、批准證書、企業法人營業執照(正本及複印件)；
2、企業章程、契約(複印件)（獨資企業不要契約）；
3、企業法人身份證(複印件)（法人代表為外籍或港澳台籍的須有委託書及被委託的國內主管經理人身份證複印件）；
4、企業銀行開戶許可證(正本及複印件)；
5、企業在區內購房、租房契約或土地使用證、房屋租售登記(正本及複印件)；
6、企業海關登記註冊申請表（加蓋公章及法人章）。
7、海關認為必要的其他單證。
加工貿易契約備案需企業遞交申請材料
1、加工貿易登記手冊；
2、進口契約或來料加工契約一式兩份；
3、初次申請需遞交租房協定或土地使用證、房產證複印件並經過海關人員驗廠；
4、海關認為必要的其他單證。
加工貿易中期補稅企業遞交申請材料
1、製成品內銷補稅申請；
2、製成品單耗表；
3、製成品折算原材料明細表；
4、進口原材料入區報關單；
5、內銷契約、發票、箱單；
6、內銷貨物所對應監管條件的相關憑證；
7、國產料件入區單據（製成品全部使用保稅進口料件的除外）；
8、製成品分攤製造費用明細表（製成品使用國產料件的除外）；
9、海關認為必要的其他單證。
加工貿易手冊核銷企業遞交申請材料
1、企業核銷報表；
2、加工貿易手冊；
3、進口原材料保稅入區報關單（加蓋驗訖章聯）及發票、契約、箱單；
4、製成品返銷出口報關單（加蓋驗訖章聯）及發票、契約、箱單；
5、製成品中期補稅通知書、報關單、稅單；
6、海關需要的其他單證。
出口加工區
加工貿易企業電子帳冊備案
（一）作業流程
企業準備有關材料 —→ 管委會審批 —→ 海關受理單證 —→三級審批—→電子帳冊備案
（二）所需提交單證
1、《出口加工區報備申請表》；
2、《加工貿易加工企業生產能力證明》；
3、《進口料件申請備案 清單》、《進口設備備案清單》、《出口成品備案清單》、《單耗報備申請表》；
4、《出口加工區加工貿易批准證》。
電子帳冊變更
（一）作業流程
企業準備有關材料 —→ 管委會審批 —→ 海關受理單證 —→ 二級審批—→電子帳冊變更
（二）所需提交單證
1、《出口加工區變更申請表》；
2、《進口料件變更申請表》、《進口設備變更申請表》、《出口成品變更申請表》、《單耗報備申請表》；
3、《出口加工區加工貿易批准證》。
電子帳冊核銷
（一）預報核
1、作業流程
企業準備有關材料 —→ 海關受理單證 —→ 三級審批 —→預報核核銷
2 、所需提交單證
《預報核申情表》、核銷期內進出口貨物備案清單正本。
（二）正式報核
1、作業流程
企業準備有關材料 —→ 海關受理單證 —→下廠核查（海關認為需要時）—→ 三級審批 —→ 海關核銷
2 、所需提交單證：
《電子帳冊報核申請表》、《進出口情況明細清單》、《報核電子帳冊料件核銷核算表》、《報核電子帳冊成品核銷核算表》、《電子帳冊本期余料申報數量登記表》、《電子帳冊本期廢料登記表》及其他海關要求的單證等。
