一、混元教派的由來
在北宋，江南道教本以正一教為主幹，在元朝時又與全真教合宗。在武當山則多種派系共存，這是湖北武當道教的特性。武當道教主神是“玄帝”，又稱“混元六天傳法教主”、三元都總管、九天游奕使、元天上帝、盪魔天尊等等。北宋時期道教神霄雷法興起，神霄雷法天心派傳於湖北，其教主“玄帝”是湖北地區信教眾弟子及信徒所崇奉的主神。進入南宋時，湖北地區獨創的混元派系其所傳正法恰是：《混元六天如意大法》。武當山還保留了混元派譜如下：一永通玄宗 道高本常清 德祥恭敬泰 義久復圓明
混元三教主 天地君親師 日月星斗真 金木水火土
另白雲觀所存混元派譜為：
混元乾坤祖 天地日月星 三教諸經師 金木水火土
渾合本空洞 朝謁上玉京 虛無生一氣 良久歸太清
混元教派人道傳承的開宗立派者是南宋時期雷默庵(1221—1295)。根據《道藏》中《歷世真仙體道通鑑續篇》第五卷中四四六頁記摘錄如下：
“真人姓雷，諱時中，字可權，號默庵。其先本豫章人（釋：即今江西南昌），後家於今湖廣之武昌金牛鎮，所居溪水迴環，東西二橋，故又號雙橋老人。生於宋嘉定辛巳年（公元1221年）十一月十五日辰時。幼習詞賦，後通詩經，三領鄉薦，精心道學，專務性理。與九江吉甫親，因巳未庚申之難，揭家依居吉甫。甲子歲（公元1264年，應43歲）殿帥往太平宮酬醮。師從其行，夜宿太平宮之聽雨軒。恍惚間見上帝親謂語曰：‘卿，陽祿無份，陰官有緣。不須留意功名。’是夕，本宮知宮（釋：即是太平宮主持）亦夢採訪真君。告曰：‘來日午刻可精嚴祀事，五百靈官中有一靈官親降於壇炷香。’次日午朝，殿帥謂師曰：‘我困甚，師可代燒香’。及至壇中，知宮大駭，方知師五百靈官中人也。後知宮白於師，師愈留心道法，絕念功名。復回居金牛鎮，置壇祀事。庚午（公元：1270年，應53歲）三月三日，玄武誕辰，（釋：就此可以了解真武的神傳在湖北的影響）可師具表賀，焚香朗頌《度人經》，忽有一道人標格異常自外至，謂曰：‘貧道有一階道法，特來授汝’。因出袖中書一卷曰：‘可置此文於壇中，齋戒七日後方可開看’。師受之置於香案，回首道人已出，不知所在。方悟其為異人也。（釋：可以假借是神仙顯象度人）入壇拜謝，持誠齋戒七日，焚香拜禮開看其文，乃‘混元六天如意道法’。（註：據《道藏》中錄《道法會元》一百五十四卷，其書目名應是《混元六天妙道一氣如意大法》）看畢，壇中白晝如夜，須臾雷火布滿，雷霆辛天君立於案上曰：‘吾奉昊天敕命，付卿開闡雷霆之教，普濟眾生。吾教上帝為主，以吾佐之，以卿行之。前日授卿之文者，乃祖師路真君也。卿名在仙籍，七世為儒，三世行法，並無纖過，當大興吾教。’
“……所著《心法序要》、《道法直指》、《原道歌》皆發揚混元道化之妙。以至元乙未四月初五日沐浴更衣端坐臨午，命盧、李二師率諸門人諷《度人經》一卷畢，即索筆紙書頌曰：‘一輪明月照清穹，萬里無雲光霽中。自在逍遙無一事，圓融常與太虛同’，頌畢凝然而逝。是年冬，弟子奉葬於郡之顏山後，雷霆累降筆云：上帝已升真人為玄都上相混元妙道普濟真君雷神演教天尊。”
由上述的記載可知：雷默庵是在1264年到江西太平宮，得到知宮的點化後回湖北，於公元1270年3月3日，玄武誕辰，雷默庵在先師具表賀，焚香朗頌《度人經》時，得路大安真人傳授《混元六天如意道法》一卷後，又感辛天君下壇告知，故而開始傳道授法。根據上文可知 ：“以吾佐之”是神傳護佑，“以卿行之”是人傳奉教。 由此雷默庵在天心派神霄雷法的教理下創立混元教派。
二、混元教派祖師雷默庵的傳法思想及修煉方法
《歷世真仙體道通鑑續篇》又載：“又考路祖師當晉時，親遇太上老君授以此法。而是教專以《度人經》為主，師每化導世人及開度弟子，皆令其精心頌經，各獲果報。常論《度人經》旨以開後學，其要在十回度人，非惟十遍可以度人。乃在平日修煉自己以究返還之妙。且須先度祖宗，終得道備，飛升上清。經旨之明，莫越是矣。及儒釋二家博採旁求，貫徹混融，歸於一致。”該派的傳法思想是：“行法布氣度人救人。以煉己返還,培元固本，再行罡布氣，治病救人。”在就何謂“混元一氣”的論證時，雷祖闡述：“此氣是先天祖氣，人人有之，特明與不明爾。即佛釋所謂本來面目，父母未生前之妙也。含於一而為混，合乎萬以歸元”。這就是混元教義的本義。該派持教強調：必先尊祖宗，皆是以孝道明法。
按其說法，天地人三才之道無非是陰陽二氣的變化規律而矣。故道是宇宙的大一統論、本體論，是宇宙之生存有序性及結構性，故其顯者為象，藏者為數，其交者為氣，萬事萬物同在宇宙之大一統規律下，萬化不離陰陽之變，不受任何人為的主宰。人同宇宙氣運是統一的，人的魂魄，時常游離本體，故常耗損。如果站在現代社會的角度來認識的話，可將其游離之氣喻為“能量”，能量是永恆的，是可以互為轉化的。這個肉眼看不見，摸不著的規律，即是道的本體。
至於修煉思想，混元派是以道教之混元思想作為宗旨，以元神為主宰進行修煉。在《修煉直指》中，雷默庵很精闢的論斷闡述出：“夫修真之事皆是自己本真，非他外物而成者。其修煉亦自然之功，更不勞心費力。且四時代謝，為萬物發生。天地何嘗用力施工，皆自然而然。”主張“吾身者魂魄也，日月即天地之魂魄，魂魄即吾身之日月也，先賢所謂日魂月魄是也。日月常交會，天地所以無窮。魂魄常支離人身，所以有盡。”雷默庵闡述到：“故天地之造化不外乎魂魄，日火也，魂亦火也。而心為神舍，神即魂神。心賴肝木相生，則魂神居焉，故曰：‘龍從火里出’。月水也，魄亦水也，而腎為氣海，氣即魄。氣賴肺金相生，則魄氣依焉，故曰：‘虎向水中生’。聖人設教，千經萬論，莫不教人收心養氣。總而言之不過拘制魂魄而已。”
混元教派秉持混天思想體系，將人體頭部以喻應天，腹部以喻應地，將人體的任督二脈以感應天地之氣。設百會為先天之鼎。（含泥丸）設會陰為先天之爐（含膀胱），又以任脈對應南斗，督脈對應北斗。是應先天之卦，應先天品物流行之氣。視祖竅為視窗，百會及會陰為門戶。又設肚臍為後天之鼎，膀胱為後天之爐。生門臍是生我之根，命門是死我之蒂。修煉就是要生化，返聚先天真一之氣於後天鼎中，以求返還之機。“寂然不動，感而邃通。”
三、混元派系之大興與傳承
《歷世真仙體道通鑑續篇》還載：是年（1270年），“四方聞其道行卓異，及其門者日眾。弟子數千人，分東南西蜀兩派，首度盧、李二宗師及南康查泰宇。由是盧、李之道行於西蜀，泰宇之道行乎東南。混元之教大行於世。”道教混元派由此流傳下來。混元派既形成為湖北地區的特有教派後，其主壇又遍及湖北的武當山及九宮山。隨即盛行四川與東南。混元派傳承，雖然師祖字派為“昌”字，師父字派為“宏”字，上沿字派斷脈，依修持方法理論在接嗣中皆完美無缺。凡是稟承混天學說的思想及流派應為“混元派”，這是古人的一種說法。以修煉內丹為主以神霄雷法濟世度人為輔是混元教派的修持宗旨及特徵。按此推論，時至今日，這種“混元派”的影響還很大。武當山真武大帝的威儀及神傳現在已經遠播大陸及港、澳、台兩岸四地及其它許多國家和地區。惟願：
混元再現，真武演正。
隨緣入世，德備功成。
弘道傳教，濟渡眾生。
無為自化，世界大同。
