深海生態系統
深海中缺乏陽光，靜水壓力大，形成黑暗、低溫和高壓的環境。由於不能進行光合作用，這裡沒有光合作用的植物，沒有植食性動物，只有碎食性和肉食性動物、異養微生物和少量濾食性動物。目前人類發現兩種完全獨立的生態系統。
海底火山生態系統
美國的深潛器“阿爾文”號對加拉帕戈斯群島附近等處海底熱泉的調查，發現了新的海底火山熱泉生態系統。其中以濾食性動物為主。在火山熱泉噴出的海水中,富有硫化氫和硫酸鹽類;硫化細菌十分繁茂，密度達106個/毫升。這些細菌以化學合成作用進行有機物的初級生產，為濾食性動物提供餌料，管蠕蟲正是分解硫化氫製造養料。蝦蟹有時會偷吃管蠕蟲的觸鬚。群落的動物有濾食有機物和細菌的雙殼類（其中一種的貝殼長達30厘米）、鎧甲蝦，與細菌共生的巨型管棲動物(體長2米多),以及小蟹、管水母、某些腹足類和紅色的魚類等海底火山熱泉生物。這裡形成了一條脆弱的完全獨立於外界的生態系統。
海底湖泊生態系統
在海底形成湖泊是件很不尋常的事。“湖泊”的形成是由於密度不均的海水分層所致。從沙灘下不斷湧出高密度的甲烷氣體。在湖泊周圍的沙灘上仍然生活著管蠕蟲，甲烷氣體的分解為其他動物提供生存所需的養料。蝦蟹等低級小動物伴隨管蠕蟲左右也生活在這條脆弱的生態系統當中。
人類對深海的探索還不及1%但是人類已經嚴重的破壞脆弱的海底環境了。
