第二次世界大戰期間日本軍隊少將。
樋口出生於淡路島兵庫縣南淡路市，他是九個兄弟姐妹中的長子。他十一年歲時他的父母離異，他跟隨母親的家庭。他是日本皇軍學院21級畢業生，和30級陸軍參謀學院畢業生。作為一個下級軍官，他作為軍事隨員前往波蘭。之後，由於他流利的俄語，樋口被派往滿洲的關東軍。
從1933年至1935年，他被任命為日本陸軍第41步兵團軍官參與侵略中國，1935年至1937年擔任日本陸軍第三師參謀長，1937年他隨一個軍事代表團考察德國。1938年，樋口季一郎作為哈爾濱特別支部一個主要的參謀長和指揮官，他允許大約20000名猶太難民逃離納粹德國越界從蘇聯到滿洲。他的下屬，上校安江仙弘，負責難民在哈爾濱的食宿問題，安排他們去上海，或安排出境簽證。
1942年他晉升為陸軍中將，並分配到札幌的日本陸軍第五區。他參加入侵阿留申群島，Attu島和Kiska島。此後作為北區軍指揮官他組織防禦日本北部打擊盟軍部隊，強化Shumshu島嶼與北部千島群島鏈的防禦系統。
在日本投降，史達林要求以戰爭罪引渡樋口被蘇聯的軍事法庭接受審判，世界猶太人大會迅速成立了一個小組遊說同盟國最高司令官麥克阿瑟將軍，以防止樋口的引渡和審判。樋口，連同安江仙弘，被邀請參加獨立慶典的以色列國。
雖然他拯救了數萬名猶太人免遭屠殺，但他參與侵略中國的事實不容改變。
功過是非自有後來人評說。
