染色體核型分析主要包括染色體長度、染色體臂比、著絲點位置、次縊痕等。染色體的長度差異有兩種,一種是不同種、屬間染色體組間相對應的染色體的絕對長度差異,一種是同一套染色體組內不同染色體的相對長度差異。絕對長度通常在放大的照片或圖象上以微米(μm)進行測量,然後按下式換算:
染色體絕對長度 = 放大的染色體長度(μm)× 1000 / 放大倍數
絕對長度不大穩定,這是因為預處理條件和染色體的縮短程度難以完全相同,即使同一個體的不同細胞的染色體,縮短程度也常常不同。因此,絕對長度只有在染色體大小差異明顯的種或屬間的比較才有價值。而對於染色體大小差異不明顯的材料間的比較,常常以相對長度作為量度染色體的標準。染色體相對長度是以百分比表示,通常採用Levan(1964)的公式計算:
染色體相對長度 =(染色體長度/染色體組總長度)× 100%
由於相對長度排除了因技術原因引起的染色體短縮程度不同所產生的差異,因此,相對長度值是一個較穩定的可比較的數值。而絕對長度則往往只記錄變異范圍。不同屬、種,以及不同變種之間,因染色體變異,會引起同源染色體長臂與短臂不一樣,這通常用染色體臂比來進行比較。通用公式如下:
染色體臂比 = 長臂(L)/短臂(S)
由於染色體長臂和短臂不一,就表現出著絲點位置不同。此外,在核型分析中,次縊痕或核仁組成區(NOR)和隨體(SAT)的數目、分布和大小的差異,常常成為區分某些近緣種或屬的主要特徵,因此,它們識別與判斷極為重要。例如,蔥、洋蔥和大蒜的染色體數目和基本形態都相近似,但是,其隨體的數目、大小和位置明顯不同,而易於區分。
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