張文炳[武漢大學教授]

張文炳[武漢大學教授]
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張文炳,研究生導師,主要方向有生物分子(RNA, DNA, protein)的統計熱力學: 結構和穩定性預測, 致病分子的結構, 生物分子序列設計等。

基本信息

個人介紹

1999年獲武漢大學博士學位後留校任教,2000年晉升為副教授。1999年11月??2005年12月,在美國密蘇里-哥倫比亞大學物理系作研究工作,為美國物理學會會員和美國生物物理學會會員。2005年12月回武漢大學,晉升為教授。

研究方向

目前,我們的主要工作方向為生物物理。生物分子是由成千上萬個原子通過共價鍵連結的鏈狀有機分子。生物分子必須形成某種特殊的結構才能發揮生物功能,錯誤的結構常常引起疾病。根據物理原理,我們發展統計力學理論和計算機模型,精確地預測生物分子序列和結構的關係及結構與功能的關係。

力學過程幾乎伴隨細胞循環的每一步.細胞中的力可產生於不同的生化過程:染色體分離,複製,輸運,蛋白質跨越細胞膜輸運,蛋白質和核酸的摺疊與反摺疊,分子馬達,等等.我們發展第一性原理的方法來定量預測和分析實驗結果,揭示其分子機理.

主要方向

1.生物分子(RNA,DNA,protein)的統計熱力學:結構和穩定性預測,致病分子的結構,生物分子序列設計.

2.生物分子摺疊的動力學:摺疊機制,有功能的中間態,限制變化率的關鍵步,摺疊路徑和過度態的預測,變異及分子序列的影響.

3.生物分子相互作用:RNA-RNA,RNA-DNA,DNA-DNA相結合的統計熱力學和動力學,結合點的預測和結合分子設計.

4.單分子生物物理:外力導致的生物分子摺疊和反摺疊,分子馬達.

論文著作

1ZhangWB,ChenSJ,RNAhairpin-foldingkinetics。PROCEEDINGSOFTHENATIONALACADEMYOFSCIENCESOFTHEUNITEDSTATESOFAMERICA.99,1931(2002).

2ZhangWB,ChenSJ.ExploringthecomplexfoldingkineticsofRNAhairpin.1.Generalfoldingkineticsanalysis。BIOPHYSICALJOURNAL90,765(2006)

3.ZhangWB,ChenSJ,ExploringthecomplexfoldingkineticsofRNAhairpin.2.Effectofsequence,length,andmisfoldedstates。BIOPHYSICALJOURNAL90,778(2006)

4.ZhangWB,ChenSJ,Analyzingthebiopolymerfoldingratesandpathwaysusingkineticclustermethod.JOURNALOFCHEMICALPHYSICS,119,8716(2003)

5.ZhangWB,ChenSJ,Masterequationapproachtofindingtherate-limitingstepsinbiopolymerfolding.JOURNALOFCHEMICALPHYSICS,118,3413(2003)

6ZhangWB,ChenSJ,Athree-dimensionalstatisticalmechanicalmodeloffoldingdouble-strandedchainmolecules。JOURNALOFCHEMICALPHYSICS,114,7669(2001)

7ZhangWB,ChenSJ,Predictingfreeenergylandscapesforcomplexesofdouble-strandedchainmolecules。JOURNALOFCHEMICALPHYSICS,114,4253(2001)

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