概念
宏基因組 ( Metagenome)(也稱微生物環境基因組 Microbial Environmental Genome, 或元基因組) 。是由 Handelsman 等 1998 年提出的新名詞, 其定義為“the genomes of the total microbiota found in nature” , 即生境中全部微小生物遺傳物質的總和。它包含了可培養的和未可培養的微生物的基因, 目前主要指環境樣品中的細菌和真菌的基因組總和。而所謂宏基因組學 (或元基因組學, metagenomics) 就是一種以環境樣品中的微生物群體基因組為研究對象, 以功能基因篩選和/或測序分析為研究手段, 以微生物多樣性、 種群結構、 進化關係、 功能活性、 相互協作關係及與環境之間的關係為研究目的的新的微生物研究方法。一般包括從環境樣品中提取基因組 DNA, 進行高通量測序分析，或克隆DNA到合適的載體,導入宿主菌體,篩選目的轉化子等工作。
套用
特定生物種基因組研究使人們的認識單元實現了從單一基因到基因集合的轉變，宏基因組研究將使人們擺脫物種界限，揭示更高更複雜層次上的生命運動規律。在目前的基因結構功能認識和基因操作技術背景下，細菌宏基因組成為研究和開發的主要對象。細菌宏基因組細菌人工染色體文庫篩選和基因系統學分析使研究者能更有效地開發細菌基因資源，更深入地洞察細菌多樣性。如宏基因組成為生物催化劑的新來源。
