這些重複DNA序列有的繼續發生進化歧異,成為與原來序列不同的新基因;有的以結構和功能仍基本相同的形式保留下來成為多拷貝基因。如為rRNA和tRNA編碼的基因就是典型的多拷貝基因。人的一個細胞中約有200個rDNA拷貝。還有組蛋白基因,免疫球蛋白基因等都是多拷貝基因。重複頻率在10^5次以上(也有人認為是數千次或百萬次以上)的稱為高度重複序列。
有的DNA序列,在基因組中並不是只有一份,還有很多它的複製品,又稱拷貝,它們的序列完全一樣,多存在幾份是為了轉錄RNA的時候速度快些,因為有些基因表達量大,需要快速的產生很多RNA,就叫“多拷貝基因”。
組蛋白基因、免疫球蛋白基因、tRNA基因、rRNA基因屬於多拷貝基因。
人類DUF1220的拷貝有212個,而猩猩有37個,猴子只有30個。小鼠和大鼠都為單拷貝。研究者在很多地方發現這種蛋白,包括腦部神經元。這說明了某些基因的多拷貝現象與生物進化的關係。
大多數情況下,結構基因在細菌染色體基因組中都是單拷貝,但是編碼rRNA的基因rDNA也是多拷貝的,這樣可能有利於核糖體的快速組裝。