建立
1911年，四川爆發了一場規模浩大的“保路運動”，在成都成立保路同志會，推選立憲派蒲殿俊、羅倫為正副會長，各縣保路同志會亦先後成立，很快發展至數十萬人。清政府下令鎮壓，四川總督趙爾豐屠殺請願民眾，激起四川人民更大憤怒。同盟會會員乘機組織同志軍，在各縣發動武裝起義，把保路運動推向高潮。武昌起義後，趙爾豐被迫退位，在成都成立了蒲殿俊為都督的大漢四川軍政府，在重慶建立起張培爵任都督的蜀軍政府。蒲殿俊的新政權極其軟弱無能。12月8日，蒲殿俊和朱慶瀾在東校場閱兵，突然軍隊譁變，蒲倉惶逃離成都，成都城中秩序大亂。這時，軍政部長尹昌衡急忙脫身出城，馳往鳳凰山找到第六十三標標統周駿和營長宋學杲。周、宋即率部入城平息混亂。平亂後，由軍官和士紳共推尹昌衡為都督，羅倫為副都督，同時殺掉了趙爾豐。
為了鞏固新政權，尹昌衡將軍隊擴編為三鎮：即以原十七鎮改為第一鎮，宋學皋任統制；以同志軍收編為第二鎮，彭光烈任統制；以巡防軍潰散部隊收編為第三鎮，孫兆鸞任統制；以援川軍為第四鎮，劉存厚為統制。
1912年大漢四川軍政府與蜀軍政府合併，以成都為政治中心，設四川軍政府，尹昌衡出任四川軍政府都督，張培爵任副都督。四川軍政府成立後，尹昌衡即改編川軍為五個師：第一師師長周駿，第二師師長彭光烈，第三師師長孫兆鸞，第四師師長劉存厚，第五師師長熊克武。尹昌衡任胡景伊川軍軍團長統轄川軍五個師。不久，重慶鎮撫總長夏之時辭職出國留學，胡景伊兼任鎮撫總長。除熊克武外，尹昌衡、胡景伊與四個師長，都是四川武備學堂的教官與畢業生或者關係密切的民軍首領。這樣，幾乎控制了川軍的各級領導權的武備系建立，當時為川軍中唯一的軍閥派系。
衰落
1913年袁世凱製造震驚國內的宋教仁案，孫中山決定發動二次革命予以討伐。此時，尹昌衡已經加入了國民黨，袁世凱擔心他也加入討袁行列，便蓄意扶植共和黨籍的胡景伊，而胡景伊也趁機投靠袁世凱。1913年6月，袁世凱正式任命胡景伊為四川都督，解除了尹昌衡的川督職務，任為川邊經略使。二次革命後，尹昌衡遭到袁世凱構陷下獄，直至1916年袁世凱死後才出獄，一度追隨孫中山從事革命活動。後歸隱成都，以著書自娛，不問軍政。
胡景伊出任四川都督後，秉承袁世凱的旨意，鎮壓四川的革命黨人。首先，他企圖編遣由國民黨系組成的駐重慶的熊克武第五師。8月4日，熊克武在重慶宣布獨立，西上討胡。9月12日，重慶被占領，四川討袁之役失敗。胡景伊投靠袁世凱，鎮壓了國民黨人發動的重慶起義，本以為可以穩坐川督的寶座。此時，袁世凱準備復辟帝制，考慮到滇、黔兩省會反對，於是特派自己的親信陳宦於1915年3月以會辦四川軍務、四川巡按使的身份赴四川坐鎮。而胡景伊則被調到北京，任參政院參政，授以將軍府毅武將軍，從此失勢。1915年5月底，陳宦率伍祥禎、馮玉祥、李炳之三混成旅入川，控制了全部川軍及全省政務。川軍武備系由此受到嚴重威脅與打擊。
1916年1月，蔡鍔將軍率領的護國軍經貴州畢節入川，進軍神速。川軍武備系首領劉存厚在納溪宣布加入護國軍，自任護國川軍總司令，迎蔡軍。5月22日，陳宦宣布四川獨立，和袁世凱斷絕關係。陳後為川軍及四川人民所迫，無法留任，只得率部出川。護國戰爭結束，入川滇、黔軍占據了四川省大片地方和成都、重慶等重要城鎮，並且四川督軍羅佩金奉行“弱川”的政策，壓制川軍。川軍將領深感禍將及己，第二師師長劉存厚乘機聯絡川軍各部共謀驅羅。1917年4月18日，劉存厚率部圍攻駐成都皇城之羅佩金部，劉羅之戰爆發。4月24日，羅佩金戰敗退出成都，北京政府免去羅佩金四川督軍職，由戴戡暫代。劉羅之戰後，緊接著又爆發了劉存厚與戴戡的劉戴之戰，結果黔軍又被趕出成都遭殲滅，戴戡身亡。1917年7月，北京政府任命周道剛為四川督軍。周道剛與劉存厚為武備系後期首腦人物。經此，川軍武備系勢力一度崛起。
周道剛出任四川督軍不久，雲南軍閥唐繼堯借護法之名發動了靖國戰爭，率滇黔聯軍進攻四川。1917年12月3日，周道剛與四川查辦使吳光新戰敗撤出重慶，周道剛率殘部敗走永川、資中，從此脫離軍界。12月8日，北京政府任命劉存厚為四川督軍，在成都令川軍第一、二、三師重新部署，推舉熊克武為四川靖國各軍總司令。1918年2月20日，川滇黔靖國聯軍攻入成都，劉存厚等部退往陝南漢中地區。2月25日，唐繼堯自任熊克武為四川督軍兼省長。3月，孫中山正式任命熊克武為四川督軍，楊庶堪為四川省長。
1918年 靖國之役後，武備系後期領軍人物周道剛、劉存厚相繼被逐出四川，武備系日漸沒落。
首腦
尹昌衡(1884—1953年)原名昌儀，學碩權，號太昭，彭縣(今彭州市)人。1902年入四川武備學堂，畢業後保送赴日本留學。1909年畢業回國，1910年返川，任四川督練公所軍事科長，後升任編譯局總辦，教練處會辦，陸軍國小堂總辦。1911年11月大漢四川軍政府成立，任軍事部長。12月8日成都發生兵變，軍政府都督蒲殿俊、副都督朱慶瀾相繼逃遁。成都城內一片混亂，尹昌衡急率部隊連夜入城，平定了叛亂。遂被成都軍政各界會議推為大漢四川軍政府都督。原川督趙爾豐交出四川政權後，仍率部駐在成都並暗中進行復辟活動，威脅著四川軍政府，12月22日凌晨，尹昌衡指揮所部擒獲趙爾豐，並在皇城內召開公審大會，將其斬首示眾。1912年成、渝兩軍政府合併，成立四川都督府，尹昌衡任都督。同年7月，領兵西征，3個月平定康藏叛亂，改任川邊經略使。後被袁世凱騙至北京，以“虧空公款”罪，處以9年徒刑。1916年袁世凱死後出獄，從此閒居。著有《止園文集》等。
胡景伊（1878—1950）字文瀾，巴縣人。1901年赴日本留學，回國後任四川陸軍武備學堂監學兼教習。辛亥革命後投靠袁世凱，1912年7月任護理四川都督，1913年6月任四川都督。8月4日熊克武在重慶興師討袁，他調軍隊鎮壓並在各地屠殺革命黨人及討袁軍骨幹300餘人。1915年4月為袁世凱所迫交出軍政大權。1938年任第一屆國民參政會參政員，受孔祥熙委託調查西康寧屬礦產資源。解放後，被特邀為重慶市第一屆各界人民代表。
周道剛（1875—1953），字菶池，又名鳳墀，雙流人。少時求學省城書院及中西學堂。清光緒二十六年（1900年），派赴日本學習軍事，入日本陸軍士官學校。光緒三十年（1904年）畢業回國。光緒三十一年（1905年），周道剛任四川武備學堂監學兼軍事教習。次年，武備學堂改為陸軍國小堂，任監學、教習，繼任總辦，並任陸軍65標標統。宣統元年（1909年），代理陸軍33混成協協統。因懲處士兵中同盟會會員的活動，引起士兵強烈不滿。繼而又秉承川督趙爾巽旨意，將士兵中革命黨人伍安全處死，遭到士兵反對，被撤職。民國4年（1915）初，袁世凱派親信陳宦督川。年底護國之役。次年7月蔡鍔任四川督軍，任命周為第1師師長。8月，蔡鍔離職去日本治病，川省軍政大權由滇軍參謀長羅佩金總攬。羅截留川款數百萬，又占領成都兵工廠，引起川軍極度不滿。6月3日，周道剛等邀集川軍師長聚會成都，推劉存厚領銜，聯名電北京政府，聲討羅氏。6月，北京派王人文為查辦使。王抵重慶，商得熊克武同意，任命周道剛為四川督軍。周在重慶宣誓就職後，拉攏川軍，驅逐滇軍，暗拒北軍，導致北軍、滇軍、黔軍、川軍（熊克武第5師）四面圍攻。周棄城逃走，結束軍閥生涯。 民國14年（1925）春，楊森在全川發動統一之戰，周道剛在成都以紳耆之名通電全國，呼籲罷兵息戰，恢復和平。7月，劉湘擊敗楊森，邀集各軍首領齊集成都，舉行善後會議。周道剛以川軍宿將身份，被劉湘推為會議副主席。民國30年（1941）3月，當選為國民參政會參政員，同月15日當選為川康建設期成會會員。次年7月，當選為第三屆國民參政會參政員。民國33年（1944）10月，在"青年民主憲政促進會"發起的成都5大學12社團主辦的"國是座談會"上，周道剛以國民參政員身份出席發言，要求國民黨取消一黨專政，成立民主聯合政府。民國34年（1945）4月，再次當選為國民參政會參政員。民國36年（1947）夏，川西發生米荒，周因囤積居奇遭社會團體以"快郵代電"嚴厲譴責，1953年病死於成都。
劉存厚，字積之。四川簡州（今簡陽）人。清末舉人。早年就讀四川武備學堂，日本陸軍士軍學校畢業。回國後，任南武備學堂堂長。參加光復雲南。辛亥革命爆發後，任援川滇軍總參謀，率兩個團進駐敘府、瀘州和自貢鹽場。滇軍回師，四川軍政府成立，所部改編為川軍第四師，駐敘、瀘一帶。1912年後任四川陸軍第二師師長、重慶鎮守使。1915年參加護國戰爭，任四川護國軍總司令、肇慶軍務院撫軍。1917年後任四川督軍。1923年後任川陝邊防督辦兼四川陸軍檢閱使。1927年後任國民黨政府第二十三軍軍長。1933年在四川參加“圍剿”中國工農紅軍。老百姓稱他為"劉瘟牛"。後長期在原籍寓居。1949年到台灣，任“總統府”國策顧問。著有《雲南光復記》、《護國川軍戰紀》、《蜀軍志》等。
主要教官與將領
顧藏。1903年任四川武備學堂總教習
楊芳毓，資陽縣人。入四川武備學堂炮兵科，畢業後留為教官。
王伯喬，又名王貞傑，自貢人。四川武備學堂教官。
張 毅（蓬山），湖北人。四川武備學堂任教。
彭家珍，金堂（現青白江區城廂鎮）人。早年四川武備學堂，1906年赴日本考察軍事，在日本秘密加入中國同盟會。1911年，彭家珍任東三省天津兵站副館長，代理標統之職。1912年彭家珍攜帶炸彈刺殺良弼，壯烈犧牲。
周 駿（吉珊），成都人一說金堂人。1908年任四川武備學堂監督。1909年任新軍第十七鎮管帶、標統。1912年任四川陸軍第一師師長。1913年任陸軍第十五師師長兼重慶鎮守使。1916年任四川督理。
孫兆鸞。讀布告時讀“草菅人命”、“馬革里屍”，向人祝壽云：“人面壽星”，人稱“白字將軍”。四川陸軍第三鎮鎮將。第三師師長孫兆鸞。
彭光烈，雙流東升鄉人，同盟會員，川軍將領。1904年考入四川武備學堂，畢業後，任四川陸軍國小堂教官，加入同盟會。清廷組建新軍，成都成立第十七鎮，彭任十七鎮第三十三混成協部隊官、六十七標三營管帶官，累升為十七鎮五十八標標統（團長）。1912年為川軍第二師師長。1914年去北京，任將軍府將軍。1918年返川，後又到北京，任川軍劉存厚駐京代表。
陳德葵。四川武備學堂畢業。重慶將校學堂教育長。重慶將校學堂系劉伯承元帥就讀的軍校。
王陵基，字方舟，樂山人，1886年生。四川武備堂畢業，後留學日本，加入同盟會。回國後歷任四川陸軍學堂副官、隊官等。民國成立後，王陵基歷任團長、師長、重慶衛戍司令、四川第五路剿匪總指揮、四川保全司令等。
