公共衛生學院設有流行病學與衛生統計學、勞動衛生與環境衛生學、營養與食品衛生學、婦女與兒童青少年衛生學、毒理學、衛生政策與管理、社會醫學與健康教育七個系和中心實驗室及北京大學兒童青少年衛生研究所。目前全院教職員工 151 人,其中教授、研究員 29 人,副教授、副研究員 28 人,博士研究生導師 9 人。各類在校學生 562 人、其中博士生 59 人、碩士生 183 人、本科生 320 人。
公共衛生學院現設有預防醫學本科專業, 2001 年起經國家教育部批准,試辦預防醫學專業長學制教育,學制 7 年,第六年起進入二級學科培養,畢業後授予碩士學位。全院有流行病與衛生統計學、勞動衛生與環境衛生學、營養與食品衛生學、兒少衛生與婦幼保健學、衛生毒理學、社會醫學與衛生事業管理學六個專業培養碩士 和 博士研究生。學院有公共衛生和預防醫學博士後科研流動站,可以接受各個學科 畢業 博士生進站從事科研工作。 2003 年開始招收公共衛生碩士( MPH )。設在學院的預防醫學培訓部設有預防醫學專業成人教育專升本、專科兩個層次的夜大和函授班,以及衛生事業管理專業專升本電大班。 公共衛生學院的流行病與衛生統計學為國家重點學科,流行病學實驗室為教育部重點實驗室。學院有循證醫學中心、愛滋病預防研究中心、營養與保健食品評價中心三個聯合研究中心及預防醫學實驗教學中心。近十年來,公共衛生學院承擔國家攻關、國家自然科學基金、部委基金和國際合作等科研項目 200 餘項。獲各類科研成果獎 50 多項。其科學研究和教育水平在國內公共衛生領域處於領先地位。公共衛生學院在教學和科研方面與世界衛生組織( WHO )、聯合國兒童基金會( UNICEF )、美國疾病控制中心( CDC )、美國中華醫學基金會( CMB )等國際組織保持良好合作關係,並與美國哈佛大學、耶魯大學、約翰·霍普金斯大學,澳大利亞悉尼大學、拉籌伯大學、格里非斯大學,韓國漢城大學,香港中文大學等境外大學建立了良好的交流和合作關係。
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