主要職能
1．研究與制定生命科學與生物技術發展戰略、規劃和學科政策；
2．組織協調有關研究所爭取國家重大科研任務，組織實施院重大科研項目的規劃、立項和評估；
LOGO3．負責知識創新工程和重要研究基地的規劃與建設；
4．協作有關研究所把握學科發展方向並進行結構性調整；
5．歸口管理有關國家和院重點實驗室、各類研究和工程中心，以及野外台站、植物園、標本館、典型培養物保藏中心、實驗動物等支撐系統；
6．人力資源的管理，包括研究隊伍的建設，傑出人才的引進等；
7．協助院有關部門制訂大型裝備計畫；本領域科研成果組織、鑑定和評價；
8．廣泛開展本領域國際合作和交流。
局各處分工
1．綜合規劃處
負責全局綜合業務工作。包括國家有關部委的對口聯繫以及院有關業務局、綜合局的對口業務聯繫；對內協調匯總業務工作；負責總體規劃、基地、項目、實驗室、人才、儀器裝備、支撐系統、成果的綜合管理；負責人事、文書、檔案、信息等與辦公有關的日常工作。
2．生物醫學處
負責“人口健康與醫藥創新基地”的日常管理工作；負責人口與健康領域、生物醫學、藥物相關的基礎、套用、高技術產業化和支撐體系的管理工作的管理和協調。包括有關規劃、項目、隊伍建設、實驗室、國際合作等。
3. 現代農業創新基地辦公室
負責“現代農業科技創新基地”的日常管理工作；負責大農業領域(含水面)相關的基礎、套用、高技術產業化工作和支撐體系的管理和協調。包括有關規劃、項目、隊伍建設、實驗室、國際合作、試驗農場、台站(農業相關)等。
4．工業生物技術與產業化處
負責“先進工業生物技術創新基地”的日常管理工作；負責工業生物技術領域相關的基礎、套用、高技術產業化工作和支撐體系的管理和協調。包括有關規劃、項目、隊伍建設、實驗室、國際合作、成果產業化等。
5．整合生物學處
負責“戰略生物資源保護與利用”專項管理工作；負責與整合生物學領域相關的基礎與基礎性工作和支撐體系的管理和協調。包括植物園、標本館、典型培養物、實驗動物等的支撐體系建設，以及與生物領域相關的生態和生物多樣性等有關的規劃、項目、隊伍建設、實驗室、國際合作等
6．院農業項目辦公室
負責農業區域綜合開發項目的管理；負責農業高新技術的研製、開發與推廣項目的管理；負責科技扶貧項目的管理；以及相關的協調和組織實施工作。
7．人與生物圈秘書處
負責人與生物圈活動在中國的組織和管理，《人與生物圈》雜誌的編輯出版工作，中國人與生物圈保護區網路建設和管理，國家自然保護區的業務指導。
國家項目
1、基金委重大項目（九五）
項目名稱 主持人
植物光合作用吸能、傳能和轉能超快過程的機理及其調控 匡廷雲
視覺信息加工的神經基礎 王書榮
真核基因表達的調節與控制研究 敖世洲
異種器官移植的基礎研究 孫方臻
蛋白質組及蛋白質結構變化與其生物功能的研究 李林
《中國植物志》、《中國動物志》、《中國孢子植物志》的編研 魏江春、黃大衛、陳心啟
知覺信息的基本表達及其無創性認知成像研究 陳霖
中國重點地區生物多樣性保育的研究 馬克平
2、973項目
項目名稱 首席專家
1）重要疾病創新藥物先導結構的發現和最佳化 陳凱先
2）光合作用高效光能轉化機制及其在農業中的套用 匡廷雲
3）水稻重要性狀的功能基因組學研究 薛勇彪
4）腦功能和腦重大疾病的基礎研究 楊雄里
5）蛋白質功能、三維結構和摺疊原理研究 饒子和、王志新
6）腦發育和可塑性的基礎研究 郭愛克
3、承擔“863”、國家攻關項目、課題若干。
重大研究成果自
自然科學獎一等獎
1997年
1、中國種子植物的特有屬 (植物所)
2、水稻蠟質基因的克隆、結構分析與表達調控的研究 (上海植物生理所)
3、排卵機理的研究 (動物所 昆明動物所)
4、草原蝗蟲生態學研究 (動物所)
1998年
1、峨眉山藏獼猴行為生態學研究 (昆明動物所)
2、石杉鹼的化學與藥理研究 (上海藥物所)
3、蛋白酶抑制劑結構與功能的研究 (上海生化所)
1999年
1、蛋白質二硫鍵異構酶既是摺疊酶也是分子伴侶 (生物物理所)
2000年
1、江浙蝮蛇磷脂酶A2三維結構與功能 (生物物理所 上海生物化學所)
2、種子吸脹冷害和滲透調控 (植物所)
自然科學獎二等獎
1997年
1、中國蕨類植物的孢子形態 (植物所)
2、中國苔蘚植物泥炭蘚目至叢蘚類6目的分類系統學研究 (瀋陽套用生態所、昆明植物所、華南植物所、中山大學)
3、tpA和PAL-1在調節黃體萎縮和精子發生成熟過程功能研究 (動物所、昆明動物所)
4、中國動物志 硬骨魚綱：鰈形目 (動物所)
5、植物病毒衛星核糖核酸（sRNA）及其生物防治植物病害的機理 (微生物所 、 農業部植物檢疫實驗所、武漢大學、植物所)
6、基於蛋白質和核酸三維結構知識的藥物設計 (上海藥物所)
7、兩棲類胚胎表皮細胞的興奮性幾興奮性的傳播 (上海細胞所)
1998年
1、 中國木蘭科植物種質保存及開發利用研究 (華南植物所、植物所)
2、重要小蜂類群的分類和系統發育研究 (動物所)
3、激素、遞質與行為關係的研究 (心理所)
4、水稻花粉植株的產生、特性與套用的基礎研究 (遺傳所)
5、左旋千金藤碇鹼對腦內多巴胺受體的雙重作用研究 (上海藥物所)
6、巨噬細胞免疫調變和信號轉導研究 (上海細胞所)
1999年
1、 中國菊科藍刺頭族、萊薊族及菊苣族系統分類與區系 (植物所)
2、雅魯藏布江河谷地區植物區系地理的研究 (昆明植物所)
3、稀有瀕危植物遷地保護的原理與方法研究 (西雙版納熱帶植物園)
4、中國假尾孢屬的研究 (微生物所)
5、神經細胞退行性改變過程中一氧化氮作用機理的研究 (上海藥物所)
6、脊髓傷害性信息傳遞和調製的突觸機制 (上海腦所)
2000年
1、 鯉魚人工雌核發育及建立人工多倍體單性克隆魚的研究 (水生所)
2、中國淡水魚類粘孢子蟲的研究 (水生所)
3、中國經濟昆蟲志 (動物所、江西農大、安徽農大)
自然科學獎三等獎
1997年
1、光（溫）敏核雄性不育水稻的光溫反應特性及其發育遺傳 (上海植物生理所)
2、芳香植物及其化學成分專著 (華南植物所)
3、中國多孔菌 (微生物所)
4、抗腫瘤藥物篩選模型的研究 (上海藥物所)
5、雞慢肌纖維去神經後肥大的發現及其機理研究 (上海生理所)
6、天花粉蛋白對滋養層細胞專一損傷的細胞和分子機制 (上海細胞所)
1998年
1、溫帶草原植被現代特徵與近20年之動態 (植物所)
2、 紫色非硫光合細菌氮調節系統和光合基因的研究 (上海植物生理所)
3、南亞熱帶森林植被生物量、生產力和能量利用效率研究 (華南植物所)
4、喀喇崑崙山-崑崙山地區昆蟲 (動物所、瀋陽農業大學)
5、青藏高原生物資源分析化學 (西北高原生物所)
6、小鼠ES細胞誘導分化和TGF-β1基因過表達對分化的調節 (上海細胞所)
1999年
1、南海島嶼的植物區系的研究 (華南植物所)
2、馬檳榔甜味蛋白的研究 (昆明植物所)
3、 植物次生物質在植物害蟲及其天敵尋找寄主過程中的動態分布 (動物所)
4、 細胞器的蛋白質組分及其在細胞周期中的動態分布 (上海細胞所)
