一、ATC編碼優點
1、它定義了藥物產品，包括現用的藥物，常規管理，如與劑量有關，還定義相關劑量。
2、它立足於治療學和化學，這是其他系統所欠缺的。
3、它的體系結構允許進行邏輯分組。
4、它被國際性的世界衛生組織標準所接受，用來進行藥物研究。
二、ATC編碼缺點
ATC編碼的缺點是不能覆蓋產品組合、皮膚病學的分類、當地的複雜的分類。
三、運用ATC編碼體系實現精確管理
1、 藥品目錄管理存在缺失
我國醫療保險藥品實行目錄管理，即各省份依據《國家基本醫療保險和工傷保險藥品目錄》制定本地區管理目錄，並按其內容進行管理。《藥品目錄》分為凡例和目錄兩部分，凡例是一般使用原則與示例，目錄是具體藥品條目與管理細則。而藥品目錄管理中的個別問題在實踐工作中不斷顯現：
（1） 管理模式不統一
醫療保險《藥品目錄》之中，西藥、中成藥實行準入法管理，中草藥（中藥飲片）實行排除法管理，不同的管理方法成為建立統一、高質、高效藥品庫的最大障礙。
（2） 管理類別缺失
院內製劑是許多醫院治療疾病的重要手段，有時可能成為某家醫院的一個專長所在，而《藥品目錄》中缺少對院內製劑的管理或指導意見，使其在類別管理上缺位。
（3） 使用規則不統一
西藥、中成藥雖均實行準入法管理，但使用規則不統一;西藥通用名稱與劑型分別管理，同一劑型下的通用名稱藥品均屬統一條目；而中成藥通用名稱與劑型合併管理，一種藥品的某種特定劑型屬於一個條目。即藥品名稱與劑型配伍管理原則不統一。
（4） 劑型不規範
藥品劑型與我國藥監部門規定的劑型不能完全匹配。常用的醫保藥品目錄劑型多為總括式劑型，即一個管理劑型涵蓋藥監部門多個藥品劑型，例如： “口服常釋劑型”包含普通片劑（片劑、腸溶片、包衣片、薄膜衣片、糖衣片、浸膏片、分散片、劃痕片）、硬膠囊、軟膠囊（膠丸）、腸溶膠囊等多種劑型，一方面不利於精細化管理與資源共享，另一方面使一些不能涵蓋的劑型推諉不清。
（5） 不利於統計分析
因《藥品目錄》是對通用名稱進行的藥品總括管理，涵蓋內容過多而使條目管理線條過粗，所以不利於對藥品進行細緻的統計分析，也不利於發揮數據在監管中應有的作用。
（6）對照容易產生分歧
藥品管理最複雜之處就是藥品中的任何一點不同即可使其成為“另一種新藥”，如酸根、鹽基、脂質體、旋光性甚至序列位等微細變化均可使一種人們熟知的藥品變為另一種“新藥”，而《藥品目錄》的“凡例”肯定不能解決其中的全部問題。認知上的歧義在實踐中就產生了不同醫院將同一種藥品對照為不同的醫保類別，甚至有同一家醫院不同人員對照結果不同的情況。結果是，一方面直接影響了參保人員的醫保待遇，另一方面降低了醫療保險管理部門的公信度和統計結果的準確性。
2、 藥品編碼庫解決難題
夯實藥品基礎管理，就應以實踐工作中藥品管理存在的問題為切入點，建立完善的管理工具、提供精準的管理數據、推出高效的管理措施。
（1） 建立標準化藥品編碼管理信息
人社部和醫療保險研究會推出了“基本醫療保險藥品代碼行業標準”，即我國醫療保險藥品編碼管理的ATC編碼（解剖-治療-化學代碼）。“基本醫療保險藥品代碼行業標準”是在ATC編碼（2010版）基礎上進行編寫的國內行業標準，於2012年12月11日經人社部審核批准，2013年起實施。瀋陽醫保以該編碼體系為起點，將其作為本地醫保的“源庫”（藥品使用備選資料庫）。此源庫共收錄我國目前使用的19萬條藥品編碼信息，因其藥品收錄全面分類層次鮮明、編碼規則科學，使得藥品管理標準化、準入制均有了堅實的基礎。
瀋陽醫保並沒有完全照搬其全部編碼。而是根據本地區醫保的具體實踐和管理要求將其進行本地化改造，實行具有本地特色的藥品“基準庫”，同時堅持藥品註冊名稱、劑型、規格、生產單位、批准文號的多方位精準化管理初衷。
（2） 建立統一的準入製藥品庫管理
在ATC編碼體系的強大數據支持下，瀋陽不但將醫保範圍內的西藥、中成藥進行準入制管理，而且將醫保範圍外的藥品一併進行準入制管理；本地化後不但將目錄中沒有實行準入制的中草藥進行準入制管理，而且將院內製劑也實行統一的準入制管理。建庫後使得藥品庫管理真正實現了完善統一的準入制，使得藥品全部準入的界限更為鮮明，醫保管理可以延伸到目錄內、外的所有藥品。標準化的管理也為日後各地醫保交流和信息互通搭建了良好的橋樑。
（3） 規範藥品條目管理
做細藥品庫管理不但體現在增設藥品條目上，更體現在加強和完善每個藥品條目的規範管理上：（1）每個藥品條目均包含ATC編碼、藥監本位碼、藥品目錄編碼和系統管理編碼，方便查找和與其他系統的數據交換；（2）按照藥理分類進行層次管理，方便各系統藥品按類別統計與查詢；（3）按藥品本身劑型進行精準定位，並建立與醫保藥品目錄總括式劑型的對應關係；（4）向部、省主管部門請示並明確每種存在歧義的藥品類別歸屬問題，由醫保局依據藥品目錄及上級指導意見統一進行藥品醫保類別確認，避免對照使用過程的混亂。
（4） 審核准入，提高對照準確率
面對所有定點醫院建立藥品審核准入制度，即所有定點醫院均需先由本院藥劑科室對藥品五類信息進行完全對照，再由醫院醫保辦進行初審，最後由醫保局逐戶、逐條、逐項複審，保證藥品對照使用的準確性。
（5） 建立藥品監控系統
計算機系統是實現精確管理的手段與捷徑，在建庫的同時進行程式改造，從對照模組到維護模組，從統計模組到監控系統，將藥品庫提供的豐富、細緻、準確的信息進行分類匯總，提供藥品類別、醫院等級、時間前後、藥占比、費用增減等信息的對比變化情況，提供監督管理的基礎與手段。
