歷史變革
據有關史書記載：馬溝清真寺創建於明朝正統年間（約1445年）是馬氏先人馬克太等人創建，至今已有五百六十多年了。清真寺由武台高井遷至馬溝村，最初在現清真寺西南角的幾孔土窯洞裡進行教門活動，約1660年在現清真寺所在地盤上蓋了一個有大殿、水房等磚瓦結構房的清真寺。當時規模甚小，也很簡陋。其後在清乾隆三十三年（1768年），進行了擴建。鹹豐九年（1859年），由馬振彪、馬振魁、馬振生、馬瑞龍、把際午、馬曰章、馬倫等主持，重蓋了清真寺。這一次，規模最大，設計最好，至今整個寺院仍基本保持著那時的樣子。其後在光緒十四年（1888年）、民國十七年（1928年）、1980年、2001年等多次重修。2001年為較大的一次，集資數十萬元將大殿往後加深由兩進擴為四進，擴大面積200平方米。其它部分給予加固，外形未變。
建築布局
馬溝清真寺古色古香，呈中國古典式“四合院”，但裝飾方面又處處突出阿拉伯風格，共有房屋50餘間。寺院以大殿中大門為軸線，南北對稱，各建有七間明廊立柱廂房。教長室、講堂屋、沐浴室和學生宿舍、辦公倉儲，分列南北，井然有序。牆體和房頂：大藍磚小藍瓦；屋檐：綠漆紅字；大殿五間寬四進，二十間，面積四百多平米。屋脊高十三米，粗梁、圓檁、方椽，雕樑畫棟，古樸典雅，寬敞明亮，可同時供數百人作禮拜。殿脊裝飾著寶瓶、五脊六獸、龍鳳呈祥、典蘊寬深。大殿前卷棚五間，六根青石方柱高4.5米，截面0.4米x0.4米，頂立梁檁，風格獨特，雄偉壯觀，明柱正面刻有《古蘭經》經文，每段都是一個伊斯蘭經典，卷棚前檐下面寫著“勸、化、普、世、淫、禍、善、惡”教化人生的字樣，這在各清真寺中實屬少見。大殿後望月樓高二十多米，星月雲聳，巍峨壯觀。寺院內：古柏聳天，石碑靜立，圃樹影斜，盆花錦簇，幽靜肅穆，實為贊主敬聖禮拜之聖地 。
“清真無二”匾
清真無二匾